RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440702.5

FAM20B-202, Transcript of FAM20B, glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

TSL 3

Gene FAM20B, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20B-202ENST00000440702 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
FAM20B-202ENST00000440702 PKD2Q13563 968 aa27.21■■□□□ 1.95
FAM20B-202ENST00000440702 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.2■■□□□ 1.95
FAM20B-202ENST00000440702 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.19■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 TNRQ92752 1358 aa27.19■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.17■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 PZPP20742 1482 aa27.17■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.16■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 TSPY4P0CV99 314 aa27.16■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 TSPY10P0CW01 314 aa27.16■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.15■■□□□ 1.94
FAM20B-202ENST00000440702 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
FAM20B-202ENST00000440702 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.09■■□□□ 1.93
FAM20B-202ENST00000440702 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
FAM20B-202ENST00000440702 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM20B-202ENST00000440702 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM20B-202ENST00000440702 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.08■■□□□ 1.93
FAM20B-202ENST00000440702 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.07■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 MAP3K1Q13233 1512 aa27.06■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 MIA2Q96PC5 1412 aa27.05■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.924e-6■■■□□ 16.6
FAM20B-202ENST00000440702 ABCC3O15438 1527 aa27.04■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 ILDR2Q71H61 639 aa27.03■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 CEP152O94986 1710 aa27.02■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.02■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 NLRP1Q9C000 1473 aa27.02■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
FAM20B-202ENST00000440702 MROH1Q8NDA8 1641 aa27■■□□□ 1.91
FAM20B-202ENST00000440702 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.98■■□□□ 1.91
FAM20B-202ENST00000440702 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FAM20B-202ENST00000440702 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.95■■□□□ 1.91
FAM20B-202ENST00000440702 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.95■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 ERVK-7P63135 1459 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.94■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 CPS1P31327 1500 aa26.93■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 DEPDC5O75140 1603 aa26.93■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.92■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 IQGAP1P46940 1657 aa26.92■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 KIF15Q9NS87 1388 aa26.91■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 APLP2Q06481 763 aa26.9■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 PIP4K2BP78356 416 aa26.89■■□□□ 1.9
FAM20B-202ENST00000440702 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.88■■□□□ 1.89
FAM20B-202ENST00000440702 ABCC5O15440 1437 aa26.88■■□□□ 1.89
FAM20B-202ENST00000440702 MED14O60244 1454 aa26.87■■□□□ 1.89
FAM20B-202ENST00000440702 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.85■■□□□ 1.89
FAM20B-202ENST00000440702 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
FAM20B-202ENST00000440702 DAPK1P53355 1430 aa26.83■■□□□ 1.89
FAM20B-202ENST00000440702 ERBINQ96RT1 1412 aa26.83■■□□□ 1.89
FAM20B-202ENST00000440702 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
FAM20B-202ENST00000440702 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.82■■□□□ 1.88
FAM20B-202ENST00000440702 TOM1O60784 492 aa26.82■■□□□ 1.88
FAM20B-202ENST00000440702 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.82■■□□□ 1.88
FAM20B-202ENST00000440702 SOCS7O14512 581 aa26.81■■□□□ 1.88
FAM20B-202ENST00000440702 HSPA1LP34931 641 aa26.79■■□□□ 1.88
FAM20B-202ENST00000440702 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.79■■□□□ 1.88
FAM20B-202ENST00000440702 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.75■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 KANK1Q14678 1352 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 PIK3C2BO00750 1634 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 ALKQ9UM73 1620 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 SYNMO15061 1565 aa26.72■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.72■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.71■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.7■■□□□ 1.87
FAM20B-202ENST00000440702 LTKP29376 864 aa26.7■■□□□ 1.86
FAM20B-202ENST00000440702 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
FAM20B-202ENST00000440702 SLIT1O75093 1534 aa26.7■■□□□ 1.86
FAM20B-202ENST00000440702 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.69■■□□□ 1.86
FAM20B-202ENST00000440702 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.67■■□□□ 1.86
FAM20B-202ENST00000440702 EID1Q9Y6B2 187 aa26.65■■□□□ 1.86
FAM20B-202ENST00000440702 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
FAM20B-202ENST00000440702 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.64■■□□□ 1.85
FAM20B-202ENST00000440702 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM20B-202ENST00000440702 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM20B-202ENST00000440702 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
FAM20B-202ENST00000440702 ADGRL2O95490 1459 aa26.6■■□□□ 1.85
FAM20B-202ENST00000440702 IDI1Q13907 227 aa26.58■■□□□ 1.85
FAM20B-202ENST00000440702 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
FAM20B-202ENST00000440702 ADGRB3O60242 1522 aa26.55■■□□□ 1.84
FAM20B-202ENST00000440702 NOS1P29475 1434 aa26.54■■□□□ 1.84
FAM20B-202ENST00000440702 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.52■■□□□ 1.84
FAM20B-202ENST00000440702 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.51■■□□□ 1.83
FAM20B-202ENST00000440702 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
FAM20B-202ENST00000440702 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.49■■□□□ 1.83
FAM20B-202ENST00000440702 TET3O43151 1660 aa26.47■■□□□ 1.83
FAM20B-202ENST00000440702 BCANQ96GW7 911 aa26.46■■□□□ 1.83
FAM20B-202ENST00000440702 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.46■■□□□ 1.83
FAM20B-202ENST00000440702 TMEM94Q12767 1356 aa26.46■■□□□ 1.83
FAM20B-202ENST00000440702 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
FAM20B-202ENST00000440702 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
FAM20B-202ENST00000440702 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.43■■□□□ 1.82
FAM20B-202ENST00000440702 UNC13BO14795 1591 aa26.42■■□□□ 1.82
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