RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 ATP10AO60312 1499 aa38.15■■■■□ 3.7
CERS1-201ENST00000429504 DCAF11Q8TEB1 546 aa38.15■■■■□ 3.7
CERS1-201ENST00000429504 CARD11Q9BXL7 1154 aa38.15■■■■□ 3.7
CERS1-201ENST00000429504 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa38.14■■■■□ 3.7
CERS1-201ENST00000429504 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP38.13■■■■□ 3.7
CERS1-201ENST00000429504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.13■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.13■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.09■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 PRAG1Q86YV5 1406 aa38.09■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa38.09■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.08■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 CCDC184Q52MB2 194 aa38.07■■■■□ 3.69
CERS1-201ENST00000429504 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.07■■■■□ 3.68
CERS1-201ENST00000429504 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.07■■■■□ 3.68
CERS1-201ENST00000429504 FKBP8Q14318 412 aa38.05■■■■□ 3.68
CERS1-201ENST00000429504 NEFLP07196 543 aa38.05■■■■□ 3.68
CERS1-201ENST00000429504 A2MP01023 1474 aa38.03■■■■□ 3.68
CERS1-201ENST00000429504 LAMC1P11047 1609 aa38.03■■■■□ 3.68
CERS1-201ENST00000429504 MRS2Q9HD23 443 aa38.02■■■■□ 3.68
CERS1-201ENST00000429504 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
CERS1-201ENST00000429504 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
CERS1-201ENST00000429504 DEPDC5O75140 1603 aa37.97■■■■□ 3.67
CERS1-201ENST00000429504 GPRASP1Q5JY77 1395 aa37.96■■■■□ 3.67
CERS1-201ENST00000429504 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
CERS1-201ENST00000429504 E9PCH4 1651 aa37.95■■■■□ 3.67
CERS1-201ENST00000429504 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa37.95■■■■□ 3.67
CERS1-201ENST00000429504 FANCAO15360 1455 aa37.94■■■■□ 3.66
CERS1-201ENST00000429504 POLR3GLQ9BT43 218 aa37.91■■■■□ 3.66
CERS1-201ENST00000429504 ATP7AQ04656 1500 aa37.9■■■■□ 3.66
CERS1-201ENST00000429504 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
CERS1-201ENST00000429504 RGL3Q3MIN7 710 aa37.88■■■■□ 3.65
CERS1-201ENST00000429504 AFAP1Q8N556 730 aa37.88■■■■□ 3.65
CERS1-201ENST00000429504 FAM9BQ8IZU0 186 aa37.88■■■■□ 3.65
CERS1-201ENST00000429504 ZBED9Q6R2W3 1325 aa37.85■■■■□ 3.65
CERS1-201ENST00000429504 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.84■■■■□ 3.65
CERS1-201ENST00000429504 TRPM2O94759 1503 aa37.84■■■■□ 3.65
CERS1-201ENST00000429504 TET3O43151 1660 aa37.83■■■■□ 3.65
CERS1-201ENST00000429504 ASXL2Q76L83 1435 aa37.83■■■■□ 3.65
CERS1-201ENST00000429504 BCANQ96GW7 911 aa37.81■■■■□ 3.64
CERS1-201ENST00000429504 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
CERS1-201ENST00000429504 ADGRL1O94910 1474 aa37.81■■■■□ 3.64
CERS1-201ENST00000429504 CEP152O94986 1710 aa37.81■■■■□ 3.64
CERS1-201ENST00000429504 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.79■■■■□ 3.64
CERS1-201ENST00000429504 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
CERS1-201ENST00000429504 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.76■■■■□ 3.64
CERS1-201ENST00000429504 PTPRTO14522 1441 aa37.76■■■■□ 3.64
CERS1-201ENST00000429504 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.74■■■■□ 3.63
CERS1-201ENST00000429504 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
CERS1-201ENST00000429504 MADDQ8WXG6 1647 aa37.71■■■■□ 3.63
CERS1-201ENST00000429504 KANK1Q14678 1352 aa37.69■■■■□ 3.62
CERS1-201ENST00000429504 CLTCL1P53675 1640 aa37.69■■■■□ 3.62
CERS1-201ENST00000429504 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.66■■■■□ 3.62
CERS1-201ENST00000429504 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.65■■■■□ 3.62
CERS1-201ENST00000429504 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.64■■■■□ 3.62
CERS1-201ENST00000429504 RALBP1Q15311 655 aa37.64■■■■□ 3.62
CERS1-201ENST00000429504 STAC3Q96MF2 364 aa37.63■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 TESK2Q96S53 571 aa37.62■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.62■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa37.61■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 IQGAP1P46940 1657 aa37.6■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.59■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.61
CERS1-201ENST00000429504 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 ERICH6BQ5W0A0 696 aa37.56■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.55■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.55■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 KIF3BO15066 747 aa37.55■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.55■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 TMC1Q8TDI8 760 aa37.55■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.52■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa37.51■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 PARD3Q8TEW0 1356 aa37.51■■■■□ 3.6
CERS1-201ENST00000429504 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.51■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.49■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 TMF1P82094 1093 aa37.49■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.48■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.47■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 KIF1BO60333 1816 aa37.46■■■■□ 3.59
CERS1-201ENST00000429504 CD109Q6YHK3 1445 aa37.45■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.43■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 NLRP13Q86W25 1043 aa37.4■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.4■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.39■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 MYOM2P54296 1465 aa37.39■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 IFT172Q9UG01 1749 aa37.39■■■■□ 3.58
CERS1-201ENST00000429504 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
CERS1-201ENST00000429504 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.37■■■■□ 3.57
CERS1-201ENST00000429504 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.34■■■■□ 3.57
CERS1-201ENST00000429504 NUDCQ9Y266 331 aa37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms