RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426156.1

FAM3C-203, Transcript of family with sequence similarity 3 member C, humanhuman

TSL 5

Gene FAM3C, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3C-203ENST00000426156 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.16■■■■■ 4.34
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FAM3C-203ENST00000426156 ABCC5O15440 1437 aa42.14■■■■■ 4.34
FAM3C-203ENST00000426156 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
FAM3C-203ENST00000426156 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.13■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 PTPRTO14522 1441 aa42.12■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.12■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 NCOA1Q15788 1441 aa42.12■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.1■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 PZPP20742 1482 aa42.1■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 DAPK1P53355 1430 aa42.09■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.08■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
FAM3C-203ENST00000426156 KIF15Q9NS87 1388 aa42.05■■■■■ 4.32
FAM3C-203ENST00000426156 CERKQ8TCT0 537 aa42.03■■■■■ 4.32
FAM3C-203ENST00000426156 TNRQ92752 1358 aa42.02■■■■■ 4.32
FAM3C-203ENST00000426156 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
FAM3C-203ENST00000426156 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
FAM3C-203ENST00000426156 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.01■■■■■ 4.32
FAM3C-203ENST00000426156 A2ML1A8K2U0 1454 aa42■■■■■ 4.31
FAM3C-203ENST00000426156 PLA2R1Q13018 1463 aa41.99■■■■■ 4.31
FAM3C-203ENST00000426156 ERBINQ96RT1 1412 aa41.98■■■■■ 4.31
FAM3C-203ENST00000426156 PKD2Q13563 968 aa41.98■■■■■ 4.31
FAM3C-203ENST00000426156 ABCC3O15438 1527 aa41.96■■■■■ 4.31
FAM3C-203ENST00000426156 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.96■■■■■ 4.31
FAM3C-203ENST00000426156 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.91■■■■■ 4.3
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FAM3C-203ENST00000426156 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.9■■■■■ 4.3
FAM3C-203ENST00000426156 NLRP1Q9C000 1473 aa41.87■■■■■ 4.29
FAM3C-203ENST00000426156 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
FAM3C-203ENST00000426156 CEP152O94986 1710 aa41.82■■■■■ 4.29
FAM3C-203ENST00000426156 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
FAM3C-203ENST00000426156 KANK1Q14678 1352 aa41.8■■■■■ 4.28
FAM3C-203ENST00000426156 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.8■■■■■ 4.28
FAM3C-203ENST00000426156 ADGRL2O95490 1459 aa41.79■■■■■ 4.28
FAM3C-203ENST00000426156 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.77■■■■■ 4.28
FAM3C-203ENST00000426156 DEPDC5O75140 1603 aa41.77■■■■■ 4.28
FAM3C-203ENST00000426156 ERVK-7P63135 1459 aa41.76■■■■■ 4.28
FAM3C-203ENST00000426156 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.74■■■■■ 4.27
FAM3C-203ENST00000426156 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.74■■■■■ 4.27
FAM3C-203ENST00000426156 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
FAM3C-203ENST00000426156 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.71■■■■■ 4.27
FAM3C-203ENST00000426156 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.7■■■■■ 4.27
FAM3C-203ENST00000426156 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
FAM3C-203ENST00000426156 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.66■■■■■ 4.26
FAM3C-203ENST00000426156 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.62■■■■■ 4.25
FAM3C-203ENST00000426156 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.62■■■■■ 4.25
FAM3C-203ENST00000426156 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.62■■■■■ 4.25
FAM3C-203ENST00000426156 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
FAM3C-203ENST00000426156 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.6■■■■■ 4.25
FAM3C-203ENST00000426156 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.56■■■■■ 4.24
FAM3C-203ENST00000426156 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
FAM3C-203ENST00000426156 ROCK1Q13464 1354 aa41.54■■■■■ 4.24
FAM3C-203ENST00000426156 MED14O60244 1454 aa41.52■■■■■ 4.24
FAM3C-203ENST00000426156 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.49■■■■■ 4.23
FAM3C-203ENST00000426156 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
FAM3C-203ENST00000426156 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.45■■■■■ 4.23
FAM3C-203ENST00000426156 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.41■■■■■ 4.22
FAM3C-203ENST00000426156 ITGAEP38570 1179 aa41.4■■■■■ 4.22
FAM3C-203ENST00000426156 IQGAP1P46940 1657 aa41.39■■■■■ 4.22
FAM3C-203ENST00000426156 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
FAM3C-203ENST00000426156 NOS1P29475 1434 aa41.37■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 SLIT1O75093 1534 aa41.37■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 PIK3C2BO00750 1634 aa41.36■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 CPS1P31327 1500 aa41.36■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 EID1Q9Y6B2 187 aa41.36■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.35■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 UNC13BO14795 1591 aa41.35■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 IDI1Q13907 227 aa41.35■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.34■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.34■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 TET3O43151 1660 aa41.33■■■■■ 4.21
FAM3C-203ENST00000426156 SYNMO15061 1565 aa41.3■■■■■ 4.2
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FAM3C-203ENST00000426156 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.29■■■■■ 4.2
FAM3C-203ENST00000426156 LTKP29376 864 aa41.28■■■■■ 4.2
FAM3C-203ENST00000426156 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.27■■■■■ 4.2
FAM3C-203ENST00000426156 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.27■■■■■ 4.2
FAM3C-203ENST00000426156 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.2■■■■■ 4.19
FAM3C-203ENST00000426156 NUP155O75694 1391 aa41.2■■■■■ 4.19
FAM3C-203ENST00000426156 ADGRB3O60242 1522 aa41.18■■■■■ 4.18
FAM3C-203ENST00000426156 TOM1O60784 492 aa41.12■■■■■ 4.17
FAM3C-203ENST00000426156 E9PCH4 1651 aa41.11■■■■■ 4.17
FAM3C-203ENST00000426156 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
FAM3C-203ENST00000426156 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.06■■■■■ 4.16
FAM3C-203ENST00000426156 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.02■■■■■ 4.16
FAM3C-203ENST00000426156 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41■■■■■ 4.15
FAM3C-203ENST00000426156 NAIPQ13075 1403 aa40.98■■■■■ 4.15
FAM3C-203ENST00000426156 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.97■■■■■ 4.15
FAM3C-203ENST00000426156 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
FAM3C-203ENST00000426156 BCANQ96GW7 911 aa40.95■■■■■ 4.15
FAM3C-203ENST00000426156 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.15
FAM3C-203ENST00000426156 ZFYVE9O95405 1425 aa40.94■■■■■ 4.14
FAM3C-203ENST00000426156 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.94■■■■■ 4.14
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