RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.55■■■□□ 2.64
PITX3-201ENST00000370002 PTPRTO14522 1441 aa31.52■■■□□ 2.64
PITX3-201ENST00000370002 FBXO41Q8TF61 875 aa31.52■■■□□ 2.64
PITX3-201ENST00000370002 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.51■■■□□ 2.64
PITX3-201ENST00000370002 DAPK1P53355 1430 aa31.5■■■□□ 2.63
PITX3-201ENST00000370002 PZPP20742 1482 aa31.5■■■□□ 2.63
PITX3-201ENST00000370002 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
PITX3-201ENST00000370002 NCOA1Q15788 1441 aa31.49■■■□□ 2.63
PITX3-201ENST00000370002 KIF15Q9NS87 1388 aa31.48■■■□□ 2.63
PITX3-201ENST00000370002 ERBINQ96RT1 1412 aa31.46■■■□□ 2.63
PITX3-201ENST00000370002 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
PITX3-201ENST00000370002 STRCQ7RTU9 1775 aa31.44■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 PLA2R1Q13018 1463 aa31.44■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.44■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 PKD2Q13563 968 aa31.43■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 TNRQ92752 1358 aa31.43■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.43■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.4■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 CERKQ8TCT0 537 aa31.4■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.39■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.39■■■□□ 2.62
PITX3-201ENST00000370002 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.37■■■□□ 2.61
PITX3-201ENST00000370002 ABCC3O15438 1527 aa31.37■■■□□ 2.61
PITX3-201ENST00000370002 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
PITX3-201ENST00000370002 NLRP1Q9C000 1473 aa31.35■■■□□ 2.61
PITX3-201ENST00000370002 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
PITX3-201ENST00000370002 ADGRL2O95490 1459 aa31.32■■■□□ 2.61
PITX3-201ENST00000370002 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.31■■■□□ 2.6
PITX3-201ENST00000370002 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.31■■■□□ 2.6
PITX3-201ENST00000370002 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.3■■■□□ 2.6
PITX3-201ENST00000370002 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
PITX3-201ENST00000370002 KANK1Q14678 1352 aa31.29■■■□□ 2.6
PITX3-201ENST00000370002 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.28■■■□□ 2.6
PITX3-201ENST00000370002 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.26■■■□□ 2.59
PITX3-201ENST00000370002 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.24■■■□□ 2.59
PITX3-201ENST00000370002 ERVK-7P63135 1459 aa31.23■■■□□ 2.59
PITX3-201ENST00000370002 DEPDC5O75140 1603 aa31.2■■■□□ 2.59
PITX3-201ENST00000370002 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.2■■■□□ 2.59
PITX3-201ENST00000370002 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.19■■■□□ 2.58
PITX3-201ENST00000370002 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.19■■■□□ 2.58
PITX3-201ENST00000370002 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.19■■■□□ 2.58
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.18■■■□□ 2.58
PITX3-201ENST00000370002 ROCK1Q13464 1354 aa31.18■■■□□ 2.58
PITX3-201ENST00000370002 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.16■■■□□ 2.58
PITX3-201ENST00000370002 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.15■■■□□ 2.58
PITX3-201ENST00000370002 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.14■■■□□ 2.58
PITX3-201ENST00000370002 MED14O60244 1454 aa31.09■■■□□ 2.57
PITX3-201ENST00000370002 CEP152O94986 1710 aa31.09■■■□□ 2.57
PITX3-201ENST00000370002 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
PITX3-201ENST00000370002 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.02■■■□□ 2.56
PITX3-201ENST00000370002 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PITX3-201ENST00000370002 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
PITX3-201ENST00000370002 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.01■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 NOS1P29475 1434 aa31■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.99■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 SLIT1O75093 1534 aa30.96■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.96■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 IDI1Q13907 227 aa30.96■■■□□ 2.55
PITX3-201ENST00000370002 EID1Q9Y6B2 187 aa30.94■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.93■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 CPS1P31327 1500 aa30.93■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.92■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.92■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.92■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 ITGAEP38570 1179 aa30.91■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 UNC13BO14795 1591 aa30.9■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 LTKP29376 864 aa30.89■■■□□ 2.54
PITX3-201ENST00000370002 TET3O43151 1660 aa30.85■■■□□ 2.53
PITX3-201ENST00000370002 SYNMO15061 1565 aa30.84■■■□□ 2.53
PITX3-201ENST00000370002 NUP155O75694 1391 aa30.84■■■□□ 2.53
PITX3-201ENST00000370002 IQGAP1P46940 1657 aa30.84■■■□□ 2.53
PITX3-201ENST00000370002 PIK3C2BO00750 1634 aa30.83■■■□□ 2.53
PITX3-201ENST00000370002 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
PITX3-201ENST00000370002 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.79■■■□□ 2.52
PITX3-201ENST00000370002 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
PITX3-201ENST00000370002 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.78■■■□□ 2.52
PITX3-201ENST00000370002 ADGRB3O60242 1522 aa30.77■■■□□ 2.52
PITX3-201ENST00000370002 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.75■■■□□ 2.51
PITX3-201ENST00000370002 TOM1O60784 492 aa30.75■■■□□ 2.51
PITX3-201ENST00000370002 NAIPQ13075 1403 aa30.71■■■□□ 2.51
PITX3-201ENST00000370002 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
PITX3-201ENST00000370002 HFM1A2PYH4 1435 aa30.67■■■□□ 2.5
PITX3-201ENST00000370002 ZFYVE9O95405 1425 aa30.66■■■□□ 2.5
PITX3-201ENST00000370002 E9PCH4 1651 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX3-201ENST00000370002 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.65■■■□□ 2.5
PITX3-201ENST00000370002 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.63■■■□□ 2.49
PITX3-201ENST00000370002 KCNA6P17658 529 aa30.62■■■□□ 2.49
PITX3-201ENST00000370002 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX3-201ENST00000370002 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
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