RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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GTF3C6-201ENST00000329970 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6-201ENST00000329970 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6-201ENST00000329970 KIF3BO15066 747 aa21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6-201ENST00000329970 PLA2R1Q13018 1463 aa21.37■■□□□ 1.01
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GTF3C6-201ENST00000329970 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.36■■□□□ 1.01
GTF3C6-201ENST00000329970 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.35■■□□□ 1.01
GTF3C6-201ENST00000329970 APLP2Q06481 763 aa21.35■■□□□ 1.01
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GTF3C6-201ENST00000329970 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.32■■□□□ 1
GTF3C6-201ENST00000329970 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
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GTF3C6-201ENST00000329970 ABCC3O15438 1527 aa21.28■■□□□ 1
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCC5O15440 1437 aa21.28■■□□□ 1
GTF3C6-201ENST00000329970 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.27■■□□□ 1
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GTF3C6-201ENST00000329970 TNRQ92752 1358 aa21.26■□□□□ 0.99
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GTF3C6-201ENST00000329970 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.26■□□□□ 0.99
GTF3C6-201ENST00000329970 DAPK1P53355 1430 aa21.25■□□□□ 0.99
GTF3C6-201ENST00000329970 ERBINQ96RT1 1412 aa21.25■□□□□ 0.99
GTF3C6-201ENST00000329970 NLRP1Q9C000 1473 aa21.25■□□□□ 0.99
GTF3C6-201ENST00000329970 CEP152O94986 1710 aa21.24■□□□□ 0.99
GTF3C6-201ENST00000329970 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.24■□□□□ 0.99
GTF3C6-201ENST00000329970 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
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GTF3C6-201ENST00000329970 KIF15Q9NS87 1388 aa21.22■□□□□ 0.99
GTF3C6-201ENST00000329970 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
GTF3C6-201ENST00000329970 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.19■□□□□ 0.98
GTF3C6-201ENST00000329970 ERVK-7P63135 1459 aa21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6-201ENST00000329970 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6-201ENST00000329970 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.17■□□□□ 0.98
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GTF3C6-201ENST00000329970 ADGRL2O95490 1459 aa21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6-201ENST00000329970 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6-201ENST00000329970 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6-201ENST00000329970 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.13■□□□□ 0.97
GTF3C6-201ENST00000329970 MED14O60244 1454 aa21.12■□□□□ 0.97
GTF3C6-201ENST00000329970 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6-201ENST00000329970 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6-201ENST00000329970 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.11■□□□□ 0.97
GTF3C6-201ENST00000329970 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.11■□□□□ 0.97
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GTF3C6-201ENST00000329970 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.02■□□□□ 0.96
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GTF3C6-201ENST00000329970 PIK3C2BO00750 1634 aa21■□□□□ 0.95
GTF3C6-201ENST00000329970 UNC13BO14795 1591 aa20.97■□□□□ 0.95
GTF3C6-201ENST00000329970 TET3O43151 1660 aa20.97■□□□□ 0.95
GTF3C6-201ENST00000329970 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
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GTF3C6-201ENST00000329970 NOS1P29475 1434 aa20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6-201ENST00000329970 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.96■□□□□ 0.95
GTF3C6-201ENST00000329970 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
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GTF3C6-201ENST00000329970 NWD1Q149M9 1564 aa20.74■□□□□ 0.91
GTF3C6-201ENST00000329970 NUP155O75694 1391 aa20.72■□□□□ 0.91
GTF3C6-201ENST00000329970 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.72■□□□□ 0.91
GTF3C6-201ENST00000329970 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.72■□□□□ 0.91
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GTF3C6-201ENST00000329970 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.71■□□□□ 0.91
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