RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-201ENST00000311008 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-201ENST00000311008 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS1-201ENST00000311008 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS1-201ENST00000311008 PLCH2O75038 1416 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-201ENST00000311008 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-201ENST00000311008 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-201ENST00000311008 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-201ENST00000311008 ERBINQ96RT1 1412 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-201ENST00000311008 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-201ENST00000311008 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 ATP10AO60312 1499 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 PLA2R1Q13018 1463 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC1P33527 1531 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 LAMC1P11047 1609 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 A2MP01023 1474 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 RALBP1Q15311 655 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 E9PCH4 1651 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS1-201ENST00000311008 RGL3Q3MIN7 710 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 TMC1Q8TDI8 760 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SPNS1-201ENST00000311008 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-201ENST00000311008 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-201ENST00000311008 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SPNS1-201ENST00000311008 STAC3Q96MF2 364 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-201ENST00000311008 NUDCQ9Y266 331 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-201ENST00000311008 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-201ENST00000311008 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-201ENST00000311008 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.45■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.45■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.41■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 TESK2Q96S53 571 aa26.41■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 TRPM2O94759 1503 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP13Q86W25 1043 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 DEPDC5O75140 1603 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-201ENST00000311008 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 TMF1P82094 1093 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 PTPRTO14522 1441 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 AFAP1Q8N556 730 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 FANCAO15360 1455 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 KANK1Q14678 1352 aa26.36■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 ATP7AQ04656 1500 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 TET3O43151 1660 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS1-201ENST00000311008 CEP152O94986 1710 aa26.32■■□□□ 1.8
SPNS1-201ENST00000311008 INSRP06213 1382 aa26.32■■□□□ 1.8
SPNS1-201ENST00000311008 MADDQ8WXG6 1647 aa26.32■■□□□ 1.8
SPNS1-201ENST00000311008 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS1-201ENST00000311008 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS1-201ENST00000311008 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-201ENST00000311008 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.28■■□□□ 1.8
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRL1O94910 1474 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-201ENST00000311008 PANK3Q9H999 370 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 IQGAP1P46940 1657 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 CDCA8Q53HL2 280 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 CLTCL1P53675 1640 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 PDE3BQ13370 1112 aa26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 ASXL2Q76L83 1435 aa26.22■■□□□ 1.79
SPNS1-201ENST00000311008 KIF3BO15066 747 aa26.2■■□□□ 1.78
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-201ENST00000311008 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-201ENST00000311008 SLC24A1O60721 1099 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-201ENST00000311008 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-201ENST00000311008 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-201ENST00000311008 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-201ENST00000311008 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS1-201ENST00000311008 SYNMO15061 1565 aa26.14■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 MYOM2P54296 1465 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.12■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.12■■□□□ 1.77
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