RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC6-201ENST00000243108 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC6-201ENST00000243108 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXC6-201ENST00000243108 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXC6-201ENST00000243108 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 DAPK1P53355 1430 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 NCOA1Q15788 1441 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 PZPP20742 1482 aa26.51■■□□□ 1.84
HOXC6-201ENST00000243108 KIF15Q9NS87 1388 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC6-201ENST00000243108 ABCC3O15438 1527 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC6-201ENST00000243108 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC6-201ENST00000243108 CEP152O94986 1710 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC6-201ENST00000243108 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC6-201ENST00000243108 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC6-201ENST00000243108 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXC6-201ENST00000243108 PTPRTO14522 1441 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXC6-201ENST00000243108 TNRQ92752 1358 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 HRCP23327 699 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 ERBINQ96RT1 1412 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 FBXO41Q8TF61 875 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 DEPDC5O75140 1603 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 PLA2R1Q13018 1463 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 CERKQ8TCT0 537 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.39■■□□□ 1.81
HOXC6-201ENST00000243108 ADGRL2O95490 1459 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXC6-201ENST00000243108 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXC6-201ENST00000243108 ERVK-7P63135 1459 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXC6-201ENST00000243108 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 NLRP1Q9C000 1473 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 PKD2Q13563 968 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXC6-201ENST00000243108 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
HOXC6-201ENST00000243108 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXC6-201ENST00000243108 KANK1Q14678 1352 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXC6-201ENST00000243108 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXC6-201ENST00000243108 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXC6-201ENST00000243108 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXC6-201ENST00000243108 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXC6-201ENST00000243108 ROCK1Q13464 1354 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXC6-201ENST00000243108 ITGAEP38570 1179 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXC6-201ENST00000243108 PIK3C2BO00750 1634 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXC6-201ENST00000243108 SYNMO15061 1565 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXC6-201ENST00000243108 MED14O60244 1454 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 UNC13BO14795 1591 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 NOS1P29475 1434 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 IQGAP1P46940 1657 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 TET3O43151 1660 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXC6-201ENST00000243108 IDI1Q13907 227 aa26.08■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 SLIT1O75093 1534 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 LTKP29376 864 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 E9PCH4 1651 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26■■□□□ 1.75
HOXC6-201ENST00000243108 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26■■□□□ 1.75
HOXC6-201ENST00000243108 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXC6-201ENST00000243108 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXC6-201ENST00000243108 ADGRB3O60242 1522 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXC6-201ENST00000243108 CPS1P31327 1500 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXC6-201ENST00000243108 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXC6-201ENST00000243108 NUP155O75694 1391 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXC6-201ENST00000243108 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXC6-201ENST00000243108 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXC6-201ENST00000243108 EID1Q9Y6B2 187 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXC6-201ENST00000243108 NAIPQ13075 1403 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXC6-201ENST00000243108 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.86■■□□□ 1.73
HOXC6-201ENST00000243108 ZFYVE9O95405 1425 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXC6-201ENST00000243108 ALKQ9UM73 1620 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXC6-201ENST00000243108 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
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