RNA–Protein interactions for RNA: YOR075W

UFE1, Transcript of t-SNARE protein required for retrograde vesicular traffic, yeast

Gene UFE1, Length 1,041 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UFE1	YOR075W	TIM17	P39515	158 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	MLC1	P53141	149 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	MKC7	P53379	596 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	VHS1	Q03785	461 aa		3.14	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	PUP2	P32379	260 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	JEM1	P40358	645 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	ABM1	P47146	123 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YPS5	P53057	165 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YIP5	P53108	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	HMS1	Q12398	434 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	STE7	P06784	515 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	MRPS9	P38120	278 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	PFS1	P38872	237 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	EPL1	P43572	832 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YFH1	Q07540	174 aa		3.12	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	MRPL8	P22353	238 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	GIT1	P25346	518 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YHR177W	P38867	453 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	SEO1	P39709	593 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	IGD1	P43598	195 aa		3.11	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YBL028C	P38202	106 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	BMT2	P38278	337 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	KTR6	P54070	446 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	MSC3	Q05812	728 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.1	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	WSS1	P38838	269 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	KEG1	P43614	200 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	CIN2	P46670	268 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	PGU1	P47180	361 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	VHT1	P53241	593 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	ECM11	Q04110	302 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YPQ1	Q12010	308 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YDR061W	Q12298	539 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.09	□□□□□ -1.91
UFE1	YOR075W	CMK2	P22517	447 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	SOL2	P37262	315 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	SEC9	P40357	651 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	RCF1	Q03713	159 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	GAT3	Q07928	141 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	SFM1	Q12314	213 aa		3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	DPH2	P32461	534 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	RXT2	P38255	430 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	YGL262W	P53054	175 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	RET3	P53600	189 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	VAC7	P53950	1165 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	MCH1	Q07376	486 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	SHS1	Q07657	551 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	PEX27	Q08580	376 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	MCT1	Q12283	360 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	HIF1	Q12373	385 aa		3.07	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	HEM4	P06174	275 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	MAS2	P11914	482 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	PSO2	P30620	661 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	LDS1	P31379	325 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	YGR018C	P53211	109 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	YPR078C	Q06813	372 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	MSP1	P28737	362 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	MSK1	P32048	576 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	ANP1	P32629	500 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	VAM7	P32912	316 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	ECT1	P33412	323 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	YSW1	P38280	609 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	SKS1	Q12505	502 aa		3.05	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	YKR015C	P36111	568 aa		3.04	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	DAD2	P36162	133 aa		3.04	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	PEX22	P39718	180 aa		3.04	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	HEM14	P40012	539 aa		3.04	□□□□□ -1.92
UFE1	YOR075W	MPS2	P53159	387 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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