Protein–RNA interactions for Protein: P54070

KTR6, Mannosyltransferase KTR6, yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR6	P54070	YML009W-B	YML009W-B	477 nt		21.24	■□□□□ 0.99
KTR6	P54070	NSR1	YGR159C	1245 nt		21.07	■□□□□ 0.96
KTR6	P54070	NOP1	YDL014W	984 nt		20.65	■□□□□ 0.9
KTR6	P54070	YKL036C	YKL036C	393 nt		19.11	■□□□□ 0.65
KTR6	P54070	MDJ1	YFL016C	1536 nt		18.69	■□□□□ 0.58
KTR6	P54070	Q0297	Q0297	156 nt		18.11	■□□□□ 0.49
KTR6	P54070	SRX1	YKL086W	384 nt		18.06	■□□□□ 0.48
KTR6	P54070	YJL027C	YJL027C	417 nt		17.85	■□□□□ 0.45
KTR6	P54070	SCS3	YGL126W	1143 nt		17.43	■□□□□ 0.38
KTR6	P54070	YCR051W	YCR051W	669 nt		17.14	■□□□□ 0.33
KTR6	P54070	YOL085C	YOL085C	342 nt		16.57	■□□□□ 0.24
KTR6	P54070	DBP2	YNL112W	1641 nt		16.56	■□□□□ 0.24
KTR6	P54070	PKP1	YIL042C	1185 nt		16.32	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	TRN1	tP(UGG)A	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	SUF9	tP(UGG)F	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	SUF8	tP(UGG)H	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	tP(UGG)L	tP(UGG)L	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	SUF7	tP(UGG)M	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	tP(UGG)N1	tP(UGG)N1	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	tP(UGG)N2	tP(UGG)N2	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	tP(UGG)O1	tP(UGG)O1	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	SUF11	tP(UGG)O2	72 nt		16.31	■□□□□ 0.2
KTR6	P54070	RPP1B	YDL130W	321 nt		16.25	■□□□□ 0.19
KTR6	P54070	CCC1	YLR220W	969 nt		16.15	■□□□□ 0.18
KTR6	P54070	YBR190W	YBR190W	312 nt		15.9	■□□□□ 0.14
KTR6	P54070	ATS1	YAL020C	1002 nt		15.6	■□□□□ 0.09
KTR6	P54070	RTC3	YHR087W	336 nt		15.55	■□□□□ 0.08
KTR6	P54070	RVS167	YDR388W	1449 nt		15.54	■□□□□ 0.08
KTR6	P54070	PET122	YER153C	765 nt		15.53	■□□□□ 0.08
KTR6	P54070	SCJ1	YMR214W	1134 nt		15.52	■□□□□ 0.08
KTR6	P54070	tP(UGG)O3	tP(UGG)O3	72 nt		15.44	■□□□□ 0.06
KTR6	P54070	SCR1	SCR1	522 nt		15.35	■□□□□ 0.05
KTR6	P54070	RRN5	YLR141W	1092 nt		15.09	■□□□□ 0.01
KTR6	P54070	SHR5	YOL110W	714 nt		15.02	■□□□□ -0
KTR6	P54070	YDJ1	YNL064C	1230 nt		14.94	□□□□□ -0.02
KTR6	P54070	YER088W-B	YER088W-B	147 nt		14.79	□□□□□ -0.04
KTR6	P54070	RSB1	YOR049C	1065 nt		14.78	□□□□□ -0.04
KTR6	P54070	GAR1	YHR089C	618 nt		14.6	□□□□□ -0.07
KTR6	P54070	DEP1	YAL013W	1218 nt		14.6	□□□□□ -0.07
KTR6	P54070	URN1	YPR152C	1398 nt		14.58	□□□□□ -0.08
KTR6	P54070	PST2	YDR032C	597 nt		14.45	□□□□□ -0.1
KTR6	P54070	PUT4	YOR348C	1884 nt		14.42	□□□□□ -0.1
KTR6	P54070	OPI9	YLR338W	858 nt		14.36	□□□□□ -0.11
KTR6	P54070	YNL208W	YNL208W	600 nt		14.36	□□□□□ -0.11
KTR6	P54070	RPN10	YHR200W	807 nt		14.35	□□□□□ -0.11
KTR6	P54070	SAH1	YER043C	1350 nt		14.27	□□□□□ -0.12
KTR6	P54070	ARE1	YCR048W	1833 nt		14.18	□□□□□ -0.14
KTR6	P54070	TIR1	YER011W	765 nt		14.11	□□□□□ -0.15
KTR6	P54070	YHR049C-A	YHR049C-A	297 nt		13.98	□□□□□ -0.17
KTR6	P54070	POA1	YBR022W	534 nt		13.97	□□□□□ -0.17
KTR6	P54070	SSA1	YAL005C	1929 nt		13.95	□□□□□ -0.18
KTR6	P54070	PUN1	YLR414C	792 nt		13.93	□□□□□ -0.18
KTR6	P54070	YJR018W	YJR018W	363 nt		13.91	□□□□□ -0.18
KTR6	P54070	YKL097C	YKL097C	411 nt		13.88	□□□□□ -0.19
KTR6	P54070	SHU1	YHL006C	453 nt		13.86	□□□□□ -0.19
KTR6	P54070	PTC2	YER089C	1395 nt		13.77	□□□□□ -0.21
KTR6	P54070	SRB2	YHR041C	633 nt		13.76	□□□□□ -0.21
KTR6	P54070	YJR120W	YJR120W	351 nt		13.75	□□□□□ -0.21
KTR6	P54070	BUD23	YCR047C	828 nt		13.66	□□□□□ -0.22
KTR6	P54070	BSC6	YOL137W	1494 nt		13.66	□□□□□ -0.22
KTR6	P54070	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		13.63	□□□□□ -0.23
KTR6	P54070	RPP2B	YDR382W	333 nt		13.62	□□□□□ -0.23
KTR6	P54070	NAB2	YGL122C	1578 nt		13.57	□□□□□ -0.24
KTR6	P54070	WWM1	YFL010C	636 nt		13.51	□□□□□ -0.25
KTR6	P54070	YGR021W	YGR021W	873 nt		13.41	□□□□□ -0.26
KTR6	P54070	FIS1	YIL065C	468 nt		13.41	□□□□□ -0.26
KTR6	P54070	DAL1	YIR027C	1383 nt		13.41	□□□□□ -0.26
KTR6	P54070	INM2	YDR287W	879 nt		13.4	□□□□□ -0.26
KTR6	P54070	HOM6	YJR139C	1080 nt		13.4	□□□□□ -0.26
KTR6	P54070	BDH2	YAL061W	1254 nt		13.37	□□□□□ -0.27
KTR6	P54070	FPR4	YLR449W	1179 nt		13.37	□□□□□ -0.27
KTR6	P54070	SSA3	YBL075C	1950 nt		13.36	□□□□□ -0.27
KTR6	P54070	MNP1	YGL068W	585 nt		13.35	□□□□□ -0.27
KTR6	P54070	YOR139C	YOR139C	393 nt		13.34	□□□□□ -0.27
KTR6	P54070	PHO4	YFR034C	939 nt		13.28	□□□□□ -0.28
KTR6	P54070	YBL100C	YBL100C	315 nt		13.28	□□□□□ -0.28
KTR6	P54070	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		13.27	□□□□□ -0.29
KTR6	P54070	LSM3	YLR438C-A	270 nt		13.21	□□□□□ -0.29
KTR6	P54070	RKM5	YLR137W	1104 nt		13.2	□□□□□ -0.3
KTR6	P54070	NPL3	YDR432W	1245 nt		13.19	□□□□□ -0.3
KTR6	P54070	FUN26	YAL022C	1554 nt		13.14	□□□□□ -0.31
KTR6	P54070	YOL037C	YOL037C	354 nt		13.12	□□□□□ -0.31
KTR6	P54070	TRM9	YML014W	840 nt		13.11	□□□□□ -0.31
KTR6	P54070	YPS1	YLR120C	1710 nt		13.02	□□□□□ -0.33
KTR6	P54070	SPT5	YML010W	3192 nt		12.99	□□□□□ -0.33
KTR6	P54070	CCT6	YDR188W	1641 nt		12.99	□□□□□ -0.33
KTR6	P54070	YDR095C	YDR095C	411 nt		12.94	□□□□□ -0.34
KTR6	P54070	ALF1	YNL148C	765 nt		12.92	□□□□□ -0.34
KTR6	P54070	SUF2	tP(AGG)C	72 nt		12.85	□□□□□ -0.35
KTR6	P54070	SUF10	tP(AGG)N	72 nt		12.85	□□□□□ -0.35
KTR6	P54070	YHR165W-A	YHR165W-A	312 nt		12.85	□□□□□ -0.35
KTR6	P54070	YLR281C	YLR281C	468 nt		12.83	□□□□□ -0.36
KTR6	P54070	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		12.82	□□□□□ -0.36
KTR6	P54070	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		12.82	□□□□□ -0.36
KTR6	P54070	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		12.82	□□□□□ -0.36
KTR6	P54070	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		12.82	□□□□□ -0.36
KTR6	P54070	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		12.82	□□□□□ -0.36
KTR6	P54070	MEP2	YNL142W	1500 nt		12.81	□□□□□ -0.36
KTR6	P54070	WHI5	YOR083W	888 nt		12.78	□□□□□ -0.36
KTR6	P54070	SIS1	YNL007C	1059 nt		12.75	□□□□□ -0.37

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