Protein–RNA interactions for Protein: Q12489

YDL012C, Cysteine-rich and transmembrane domain-containing protein YDL012C, yeastyeast

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL012CQ12489 NSR1YGR159C 1245 nt11.96□□□□□ -0.49
YDL012CQ12489 YML009W-BYML009W-B 477 nt11.69□□□□□ -0.54
YDL012CQ12489 NOP1YDL014W 984 nt11.17□□□□□ -0.62
YDL012CQ12489 MDJ1YFL016C 1536 nt11.06□□□□□ -0.64
YDL012CQ12489 YJL027CYJL027C 417 nt10.14□□□□□ -0.79
YDL012CQ12489 YKL036CYKL036C 393 nt9.92□□□□□ -0.82
YDL012CQ12489 SRX1YKL086W 384 nt9.77□□□□□ -0.85
YDL012CQ12489 Q0297Q0297 156 nt9.65□□□□□ -0.86
YDL012CQ12489 DBP2YNL112W 1641 nt9.6□□□□□ -0.87
YDL012CQ12489 YBR190WYBR190W 312 nt9.53□□□□□ -0.88
YDL012CQ12489 SSA3YBL075C 1950 nt9.44□□□□□ -0.9
YDL012CQ12489 RTC3YHR087W 336 nt9.27□□□□□ -0.93
YDL012CQ12489 YCR051WYCR051W 669 nt9.22□□□□□ -0.93
YDL012CQ12489 TRN1tP(UGG)A 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 SUF9tP(UGG)F 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 SUF8tP(UGG)H 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 SUF7tP(UGG)M 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 SUF11tP(UGG)O2 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL012CQ12489 PUT4YOR348C 1884 nt8.98□□□□□ -0.97
YDL012CQ12489 CCC1YLR220W 969 nt8.97□□□□□ -0.97
YDL012CQ12489 RVS167YDR388W 1449 nt8.92□□□□□ -0.98
YDL012CQ12489 SCS3YGL126W 1143 nt8.83□□□□□ -1
YDL012CQ12489 SCJ1YMR214W 1134 nt8.83□□□□□ -1
YDL012CQ12489 ARE1YCR048W 1833 nt8.69□□□□□ -1.02
YDL012CQ12489 RPP1BYDL130W 321 nt8.66□□□□□ -1.02
YDL012CQ12489 POA1YBR022W 534 nt8.64□□□□□ -1.03
YDL012CQ12489 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt8.6□□□□□ -1.03
YDL012CQ12489 YOL085CYOL085C 342 nt8.59□□□□□ -1.03
YDL012CQ12489 BSC6YOL137W 1494 nt8.57□□□□□ -1.04
YDL012CQ12489 SAH1YER043C 1350 nt8.56□□□□□ -1.04
YDL012CQ12489 URN1YPR152C 1398 nt8.54□□□□□ -1.04
YDL012CQ12489 PKP1YIL042C 1185 nt8.52□□□□□ -1.05
YDL012CQ12489 SHR5YOL110W 714 nt8.52□□□□□ -1.05
YDL012CQ12489 OPI9YLR338W 858 nt8.51□□□□□ -1.05
YDL012CQ12489 SPT5YML010W 3192 nt8.49□□□□□ -1.05
YDL012CQ12489 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt8.45□□□□□ -1.06
YDL012CQ12489 DEP1YAL013W 1218 nt8.41□□□□□ -1.06
YDL012CQ12489 SSA4YER103W 1929 nt8.41□□□□□ -1.06
YDL012CQ12489 BUD23YCR047C 828 nt8.34□□□□□ -1.07
YDL012CQ12489 PET122YER153C 765 nt8.34□□□□□ -1.07
YDL012CQ12489 RPN10YHR200W 807 nt8.32□□□□□ -1.08
YDL012CQ12489 PUN1YLR414C 792 nt8.26□□□□□ -1.09
YDL012CQ12489 YNL208WYNL208W 600 nt8.23□□□□□ -1.09
YDL012CQ12489 PTC2YER089C 1395 nt8.22□□□□□ -1.09
YDL012CQ12489 YDJ1YNL064C 1230 nt8.19□□□□□ -1.1
YDL012CQ12489 NAB2YGL122C 1578 nt8.17□□□□□ -1.1
YDL012CQ12489 BDF1YLR399C 2061 nt8.12□□□□□ -1.11
YDL012CQ12489 YJR018WYJR018W 363 nt8.12□□□□□ -1.11
YDL012CQ12489 SCR1SCR1 522 nt8.1□□□□□ -1.11
YDL012CQ12489 MEP2YNL142W 1500 nt8.08□□□□□ -1.12
YDL012CQ12489 FIS1YIL065C 468 nt8.07□□□□□ -1.12
YDL012CQ12489 GAR1YHR089C 618 nt8.05□□□□□ -1.12
YDL012CQ12489 TAT1YBR069C 1860 nt8.02□□□□□ -1.12
YDL012CQ12489 RRN5YLR141W 1092 nt8.01□□□□□ -1.13
YDL012CQ12489 DAL1YIR027C 1383 nt7.99□□□□□ -1.13
YDL012CQ12489 DCW1YKL046C 1350 nt7.96□□□□□ -1.14
YDL012CQ12489 YJR120WYJR120W 351 nt7.94□□□□□ -1.14
YDL012CQ12489 FPR4YLR449W 1179 nt7.94□□□□□ -1.14
YDL012CQ12489 YPS1YLR120C 1710 nt7.93□□□□□ -1.14
YDL012CQ12489 PHO4YFR034C 939 nt7.93□□□□□ -1.14
YDL012CQ12489 YER088W-BYER088W-B 147 nt7.87□□□□□ -1.15
YDL012CQ12489 PAC11YDR488C 1602 nt7.86□□□□□ -1.15
YDL012CQ12489 INM2YDR287W 879 nt7.86□□□□□ -1.15
YDL012CQ12489 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt7.85□□□□□ -1.15
YDL012CQ12489 YBR220CYBR220C 1683 nt7.83□□□□□ -1.16
YDL012CQ12489 RPP2BYDR382W 333 nt7.83□□□□□ -1.16
YDL012CQ12489 EMI2YDR516C 1503 nt7.83□□□□□ -1.16
YDL012CQ12489 YDR095CYDR095C 411 nt7.82□□□□□ -1.16
YDL012CQ12489 TIR1YER011W 765 nt7.82□□□□□ -1.16
YDL012CQ12489 SSA1YAL005C 1929 nt7.81□□□□□ -1.16
YDL012CQ12489 YMR090WYMR090W 684 nt7.79□□□□□ -1.16
YDL012CQ12489 YBL100CYBL100C 315 nt7.75□□□□□ -1.17
YDL012CQ12489 NVJ2YPR091C 2313 nt7.74□□□□□ -1.17
YDL012CQ12489 YDL221WYDL221W 552 nt7.74□□□□□ -1.17
YDL012CQ12489 ATS1YAL020C 1002 nt7.74□□□□□ -1.17
YDL012CQ12489 RSB1YOR049C 1065 nt7.74□□□□□ -1.17
YDL012CQ12489 SDH1YKL148C 1923 nt7.73□□□□□ -1.17
YDL012CQ12489 CAC2YML102W 1407 nt7.69□□□□□ -1.18
YDL012CQ12489 PTP1YDL230W 1008 nt7.67□□□□□ -1.18
YDL012CQ12489 RPP2AYOL039W 321 nt7.65□□□□□ -1.18
YDL012CQ12489 PCH2YBR186W 1695 nt7.64□□□□□ -1.19
YDL012CQ12489 FUN26YAL022C 1554 nt7.63□□□□□ -1.19
YDL012CQ12489 SRB2YHR041C 633 nt7.62□□□□□ -1.19
YDL012CQ12489 BDH2YAL061W 1254 nt7.62□□□□□ -1.19
YDL012CQ12489 GUT2YIL155C 1950 nt7.62□□□□□ -1.19
YDL012CQ12489 SCC4YER147C 1875 nt7.62□□□□□ -1.19
YDL012CQ12489 SEC11YIR022W 504 nt7.61□□□□□ -1.19
YDL012CQ12489 ALF1YNL148C 765 nt7.61□□□□□ -1.19
YDL012CQ12489 IRC15YPL017C 1500 nt7.58□□□□□ -1.2
YDL012CQ12489 GIS3YLR094C 1509 nt7.52□□□□□ -1.2
YDL012CQ12489 FPS1YLL043W 2010 nt7.52□□□□□ -1.2
YDL012CQ12489 TRM9YML014W 840 nt7.51□□□□□ -1.21
YDL012CQ12489 CCT6YDR188W 1641 nt7.5□□□□□ -1.21
YDL012CQ12489 SIS1YNL007C 1059 nt7.5□□□□□ -1.21
YDL012CQ12489 PIB2YGL023C 1908 nt7.49□□□□□ -1.21
YDL012CQ12489 YSC84YHR016C 1407 nt7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms