Protein–RNA interactions for Protein: P53211

YGR018C, Uncharacterized protein YGR018C, yeastyeast

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR018CP53211 NSR1YGR159C 1245 nt16.21■□□□□ 0.19
YGR018CP53211 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.13■□□□□ 0.17
YGR018CP53211 NOP1YDL014W 984 nt15.54■□□□□ 0.08
YGR018CP53211 MDJ1YFL016C 1536 nt14.69□□□□□ -0.06
YGR018CP53211 YKL036CYKL036C 393 nt14.11□□□□□ -0.15
YGR018CP53211 SRX1YKL086W 384 nt13.58□□□□□ -0.24
YGR018CP53211 Q0297Q0297 156 nt13.52□□□□□ -0.25
YGR018CP53211 YJL027CYJL027C 417 nt13.51□□□□□ -0.25
YGR018CP53211 YCR051WYCR051W 669 nt12.88□□□□□ -0.35
YGR018CP53211 DBP2YNL112W 1641 nt12.87□□□□□ -0.35
YGR018CP53211 SCS3YGL126W 1143 nt12.72□□□□□ -0.37
YGR018CP53211 YBR190WYBR190W 312 nt12.55□□□□□ -0.4
YGR018CP53211 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR018CP53211 CCC1YLR220W 969 nt12.33□□□□□ -0.44
YGR018CP53211 RTC3YHR087W 336 nt12.28□□□□□ -0.44
YGR018CP53211 YOL085CYOL085C 342 nt12.23□□□□□ -0.45
YGR018CP53211 RPP1BYDL130W 321 nt12.13□□□□□ -0.47
YGR018CP53211 PKP1YIL042C 1185 nt12.1□□□□□ -0.47
YGR018CP53211 RVS167YDR388W 1449 nt12.04□□□□□ -0.48
YGR018CP53211 SCJ1YMR214W 1134 nt11.96□□□□□ -0.49
YGR018CP53211 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.68□□□□□ -0.54
YGR018CP53211 PET122YER153C 765 nt11.65□□□□□ -0.54
YGR018CP53211 PUT4YOR348C 1884 nt11.61□□□□□ -0.55
YGR018CP53211 SHR5YOL110W 714 nt11.56□□□□□ -0.56
YGR018CP53211 SSA3YBL075C 1950 nt11.43□□□□□ -0.58
YGR018CP53211 SCR1SCR1 522 nt11.43□□□□□ -0.58
YGR018CP53211 URN1YPR152C 1398 nt11.41□□□□□ -0.58
YGR018CP53211 DEP1YAL013W 1218 nt11.34□□□□□ -0.59
YGR018CP53211 ARE1YCR048W 1833 nt11.32□□□□□ -0.6
YGR018CP53211 YDJ1YNL064C 1230 nt11.3□□□□□ -0.6
YGR018CP53211 SAH1YER043C 1350 nt11.28□□□□□ -0.6
YGR018CP53211 ATS1YAL020C 1002 nt11.28□□□□□ -0.6
YGR018CP53211 OPI9YLR338W 858 nt11.28□□□□□ -0.6
YGR018CP53211 RRN5YLR141W 1092 nt11.27□□□□□ -0.61
YGR018CP53211 POA1YBR022W 534 nt11.23□□□□□ -0.61
YGR018CP53211 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.2□□□□□ -0.62
YGR018CP53211 RPN10YHR200W 807 nt11.16□□□□□ -0.62
YGR018CP53211 GAR1YHR089C 618 nt11.11□□□□□ -0.63
YGR018CP53211 YNL208WYNL208W 600 nt11.11□□□□□ -0.63
YGR018CP53211 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.05□□□□□ -0.64
YGR018CP53211 BSC6YOL137W 1494 nt11.05□□□□□ -0.64
YGR018CP53211 RSB1YOR049C 1065 nt10.97□□□□□ -0.65
YGR018CP53211 PUN1YLR414C 792 nt10.95□□□□□ -0.66
YGR018CP53211 BUD23YCR047C 828 nt10.92□□□□□ -0.66
YGR018CP53211 PTC2YER089C 1395 nt10.88□□□□□ -0.67
YGR018CP53211 YJR018WYJR018W 363 nt10.85□□□□□ -0.67
YGR018CP53211 NAB2YGL122C 1578 nt10.74□□□□□ -0.69
YGR018CP53211 TIR1YER011W 765 nt10.74□□□□□ -0.69
YGR018CP53211 SPT5YML010W 3192 nt10.68□□□□□ -0.7
YGR018CP53211 SSA1YAL005C 1929 nt10.66□□□□□ -0.7
YGR018CP53211 YJR120WYJR120W 351 nt10.66□□□□□ -0.7
YGR018CP53211 FIS1YIL065C 468 nt10.61□□□□□ -0.71
YGR018CP53211 DAL1YIR027C 1383 nt10.57□□□□□ -0.72
YGR018CP53211 RPP2BYDR382W 333 nt10.56□□□□□ -0.72
YGR018CP53211 FPR4YLR449W 1179 nt10.56□□□□□ -0.72
YGR018CP53211 PST2YDR032C 597 nt10.49□□□□□ -0.73
YGR018CP53211 PHO4YFR034C 939 nt10.49□□□□□ -0.73
YGR018CP53211 INM2YDR287W 879 nt10.48□□□□□ -0.73
YGR018CP53211 SRB2YHR041C 633 nt10.47□□□□□ -0.73
YGR018CP53211 SSA4YER103W 1929 nt10.43□□□□□ -0.74
YGR018CP53211 MEP2YNL142W 1500 nt10.38□□□□□ -0.75
YGR018CP53211 YBL100CYBL100C 315 nt10.37□□□□□ -0.75
YGR018CP53211 YPS1YLR120C 1710 nt10.36□□□□□ -0.75
YGR018CP53211 BDH2YAL061W 1254 nt10.31□□□□□ -0.76
YGR018CP53211 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.27□□□□□ -0.77
YGR018CP53211 YDR095CYDR095C 411 nt10.26□□□□□ -0.77
YGR018CP53211 DCW1YKL046C 1350 nt10.24□□□□□ -0.77
YGR018CP53211 FUN26YAL022C 1554 nt10.23□□□□□ -0.77
YGR018CP53211 WWM1YFL010C 636 nt10.23□□□□□ -0.77
YGR018CP53211 TRM9YML014W 840 nt10.15□□□□□ -0.78
YGR018CP53211 SHU1YHL006C 453 nt10.14□□□□□ -0.79
YGR018CP53211 ALF1YNL148C 765 nt10.14□□□□□ -0.79
YGR018CP53211 LSM3YLR438C-A 270 nt10.11□□□□□ -0.79
YGR018CP53211 EMI2YDR516C 1503 nt10.08□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 YGR021WYGR021W 873 nt10.07□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.07□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 CCT6YDR188W 1641 nt10.07□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 RPP2AYOL039W 321 nt10.06□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 PTP1YDL230W 1008 nt10.05□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.05□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 BDF1YLR399C 2061 nt10.04□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 HOM6YJR139C 1080 nt10.04□□□□□ -0.8
YGR018CP53211 CAC2YML102W 1407 nt10.01□□□□□ -0.81
YGR018CP53211 YMR090WYMR090W 684 nt10.01□□□□□ -0.81
YGR018CP53211 SUF2tP(AGG)C 72 nt10□□□□□ -0.81
YGR018CP53211 SUF10tP(AGG)N 72 nt10□□□□□ -0.81
YGR018CP53211 YDL221WYDL221W 552 nt9.99□□□□□ -0.81
YGR018CP53211 MNP1YGL068W 585 nt9.98□□□□□ -0.81
YGR018CP53211 SIS1YNL007C 1059 nt9.98□□□□□ -0.81
YGR018CP53211 YBR220CYBR220C 1683 nt9.97□□□□□ -0.81
YGR018CP53211 YKL097CYKL097C 411 nt9.95□□□□□ -0.82
YGR018CP53211 SDH1YKL148C 1923 nt9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms