RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MDY2	Q12285	212 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	PST1	Q12355	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	RGS2	Q99188	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	PMT2	P31382	759 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	COX13	P32799	129 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	PTM1	P32857	523 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	KKQ8	P36004	724 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ETR1	P38071	380 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SER3	P40054	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	APQ12	P40532	138 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YNL320W	P42840	284 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MDE1	P47095	244 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	UBC11	P52492	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RCF2	P53721	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	GOT1	Q03554	138 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	DLT1	Q04216	342 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MDM30	Q05930	598 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CRN1	Q06440	651 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YET3	Q07451	203 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	REX3	Q12090	404 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	UBX3	Q12229	455 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RGT2	Q12300	763 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TRA1	P38811	3744 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	UBR1	P19812	1950 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CPR2	P23285	205 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MGR1	P25573	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	PHA2	P32452	334 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CDC5	P32562	705 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MNN2	P38069	597 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SPC97	P38863	823 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MET30	P39014	640 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SDT1	P53078	280 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	IBD2	P53892	351 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	EOS1	P53938	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	AAT1	Q01802	451 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TAF12	Q03761	539 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	AKR2	Q12013	749 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MLH3	Q12083	715 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MET3	P08536	511 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	NMT1	P14743	455 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	VMA16	P23968	213 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YCR102C	P25608	368 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CPR3	P25719	182 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	ATO2	P32907	282 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
RRN9	YMR270C	SEF1	P34228	1148 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RRF1	P38771	230 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SWP82	P43554	623 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	MIC19	P43594	170 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YGL260W	P53056	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	HOT1	Q03213	719 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	BOP2	Q06150	570 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SEC10	Q06245	871 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RAX1	Q08760	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	YMC1	P32331	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	SDH3	P33421	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CMC1	P36064	111 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	BMT2	P38278	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	VPS52	P39904	641 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	BUR6	P40096	142 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	CUP9	P41817	306 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TIS11	P47977	285 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	TWF1	P53250	332 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRN9	YMR270C	RMI1	Q02685	241 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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