RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	IRC7	P43623	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YJR056C	P47115	236 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RFX1	P48743	811 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PHO23	P50947	330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	COX18	P53239	316 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YIP3	P53633	176 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	CTF19	Q02732	369 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YMR209C	Q03648	457 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	GIS1	Q03833	894 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PEX12	Q04370	399 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	AIM41	Q12032	185 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SWM1	Q12379	170 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PNS1	Q12412	539 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SEY1	Q99287	776 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	HTB2	P02294	131 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RPO26	P20435	155 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	ELO2	P25358	347 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RRT12	P25381	491 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	GSH1	P32477	678 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	STE14	P32584	239 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YBR144C	P34215	104 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	TAF14	P35189	244 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	CAF4	P36130	643 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	HMT1	P38074	348 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RTC2	P38279	296 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YHR078W	P38799	552 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YHR177W	P38867	453 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	CTF8	P38877	133 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	LNP1	P38878	278 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YJL206C	P39529	758 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	DSE1	P40077	573 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YNL194C	P40169	301 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PFA3	P42836	336 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SPG5	P42933	373 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SWP82	P43554	623 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	TAX4	P47030	604 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	APS3	P47064	194 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SSN8	P47821	323 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	IMO32	P53219	342 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YAT1	P80235	687 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	IRC4	Q03036	179 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RIM13	Q03792	727 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SML1	Q04964	104 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SHS1	Q07657	551 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PEX27	Q08580	376 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	AFT2	Q08957	416 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	TRM11	Q12463	433 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	ECM3	Q99252	613 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	POM152	P39685	1337 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	QCR7	P00128	127 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	AAC1	P04710	309 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	QCR2	P07257	368 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SPS4	P09937	338 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SNA3	P14359	133 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	CKI1	P20485	582 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RBK1	P25332	333 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	NAM9	P27929	486 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	ERG9	P29704	444 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	DCG1	P32460	244 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YSC83	P32792	385 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	DUG2	P38149	878 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YBR259W	P38338	688 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	UBA4	P38820	440 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YHR122W	P38829	231 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	FRT2	P39734	528 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	JLP2	P40206	208 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.72	□□□□□ -1.81	not detected
PAM18	YLR008C	TAF6	P53040	516 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YGR042W	P53227	271 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YGR079W	P53249	370 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	MRPL50	P53724	139 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	COQ9	Q05779	260 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	MUM3	Q08750	479 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	POM34	Q12445	299 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RMD5	Q12508	421 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82

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