Protein–RNA interactions for Protein: Q12379

SWM1, Anaphase-promoting complex subunit SWM1, yeastyeast

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWM1Q12379 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.42■□□□□ 0.54
SWM1Q12379 NSR1YGR159C 1245 nt18.29■□□□□ 0.52
SWM1Q12379 NOP1YDL014W 984 nt17.93■□□□□ 0.46
SWM1Q12379 YKL036CYKL036C 393 nt16.57■□□□□ 0.24
SWM1Q12379 MDJ1YFL016C 1536 nt16.19■□□□□ 0.18
SWM1Q12379 Q0297Q0297 156 nt15.72■□□□□ 0.11
SWM1Q12379 SRX1YKL086W 384 nt15.67■□□□□ 0.1
SWM1Q12379 YJL027CYJL027C 417 nt15.48■□□□□ 0.07
SWM1Q12379 SCS3YGL126W 1143 nt15.1■□□□□ 0.01
SWM1Q12379 YCR051WYCR051W 669 nt14.86□□□□□ -0.03
SWM1Q12379 YOL085CYOL085C 342 nt14.37□□□□□ -0.11
SWM1Q12379 DBP2YNL112W 1641 nt14.37□□□□□ -0.11
SWM1Q12379 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
SWM1Q12379 PKP1YIL042C 1185 nt14.13□□□□□ -0.15
SWM1Q12379 RPP1BYDL130W 321 nt14.1□□□□□ -0.15
SWM1Q12379 CCC1YLR220W 969 nt14□□□□□ -0.17
SWM1Q12379 YBR190WYBR190W 312 nt13.81□□□□□ -0.2
SWM1Q12379 ATS1YAL020C 1002 nt13.53□□□□□ -0.24
SWM1Q12379 RVS167YDR388W 1449 nt13.49□□□□□ -0.25
SWM1Q12379 RTC3YHR087W 336 nt13.49□□□□□ -0.25
SWM1Q12379 PET122YER153C 765 nt13.47□□□□□ -0.25
SWM1Q12379 SCJ1YMR214W 1134 nt13.44□□□□□ -0.26
SWM1Q12379 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.4□□□□□ -0.26
SWM1Q12379 SCR1SCR1 522 nt13.32□□□□□ -0.28
SWM1Q12379 RRN5YLR141W 1092 nt13.08□□□□□ -0.32
SWM1Q12379 SHR5YOL110W 714 nt13.04□□□□□ -0.32
SWM1Q12379 YDJ1YNL064C 1230 nt12.96□□□□□ -0.33
SWM1Q12379 SSA3YBL075C 1950 nt12.86□□□□□ -0.35
SWM1Q12379 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.83□□□□□ -0.36
SWM1Q12379 RSB1YOR049C 1065 nt12.81□□□□□ -0.36
SWM1Q12379 GAR1YHR089C 618 nt12.65□□□□□ -0.38
SWM1Q12379 DEP1YAL013W 1218 nt12.65□□□□□ -0.38
SWM1Q12379 URN1YPR152C 1398 nt12.65□□□□□ -0.38
SWM1Q12379 PST2YDR032C 597 nt12.53□□□□□ -0.4
SWM1Q12379 PUT4YOR348C 1884 nt12.52□□□□□ -0.41
SWM1Q12379 RPN10YHR200W 807 nt12.47□□□□□ -0.41
SWM1Q12379 OPI9YLR338W 858 nt12.47□□□□□ -0.41
SWM1Q12379 YNL208WYNL208W 600 nt12.47□□□□□ -0.41
SWM1Q12379 SAH1YER043C 1350 nt12.37□□□□□ -0.43
SWM1Q12379 ARE1YCR048W 1833 nt12.3□□□□□ -0.44
SWM1Q12379 Q0182Q0182 405 nt12.25□□□□□ -0.45
SWM1Q12379 TIR1YER011W 765 nt12.24□□□□□ -0.45
SWM1Q12379 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.13□□□□□ -0.47
SWM1Q12379 POA1YBR022W 534 nt12.12□□□□□ -0.47
SWM1Q12379 PUN1YLR414C 792 nt12.1□□□□□ -0.47
SWM1Q12379 SSA1YAL005C 1929 nt12.09□□□□□ -0.47
SWM1Q12379 YJR018WYJR018W 363 nt12.07□□□□□ -0.48
SWM1Q12379 YKL097CYKL097C 411 nt12.03□□□□□ -0.48
SWM1Q12379 SHU1YHL006C 453 nt12.01□□□□□ -0.49
SWM1Q12379 PTC2YER089C 1395 nt11.94□□□□□ -0.5
SWM1Q12379 YJR120WYJR120W 351 nt11.91□□□□□ -0.5
SWM1Q12379 SRB2YHR041C 633 nt11.9□□□□□ -0.5
SWM1Q12379 MOT3YMR070W 1473 nt11.89□□□□□ -0.51
SWM1Q12379 BSC6YOL137W 1494 nt11.85□□□□□ -0.51
SWM1Q12379 BUD23YCR047C 828 nt11.85□□□□□ -0.51
SWM1Q12379 RPP2BYDR382W 333 nt11.83□□□□□ -0.52
SWM1Q12379 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.8□□□□□ -0.52
SWM1Q12379 NAB2YGL122C 1578 nt11.79□□□□□ -0.52
SWM1Q12379 WWM1YFL010C 636 nt11.71□□□□□ -0.53
SWM1Q12379 DAL1YIR027C 1383 nt11.65□□□□□ -0.55
SWM1Q12379 INM2YDR287W 879 nt11.64□□□□□ -0.55
SWM1Q12379 YGR021WYGR021W 873 nt11.64□□□□□ -0.55
SWM1Q12379 FIS1YIL065C 468 nt11.63□□□□□ -0.55
SWM1Q12379 HOM6YJR139C 1080 nt11.61□□□□□ -0.55
SWM1Q12379 BDH2YAL061W 1254 nt11.61□□□□□ -0.55
SWM1Q12379 FPR4YLR449W 1179 nt11.6□□□□□ -0.55
SWM1Q12379 YOR139CYOR139C 393 nt11.56□□□□□ -0.56
SWM1Q12379 MNP1YGL068W 585 nt11.55□□□□□ -0.56
SWM1Q12379 PHO4YFR034C 939 nt11.53□□□□□ -0.56
SWM1Q12379 YBL100CYBL100C 315 nt11.53□□□□□ -0.56
SWM1Q12379 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.52□□□□□ -0.57
SWM1Q12379 LSM3YLR438C-A 270 nt11.48□□□□□ -0.57
SWM1Q12379 NPL3YDR432W 1245 nt11.44□□□□□ -0.58
SWM1Q12379 RKM5YLR137W 1104 nt11.44□□□□□ -0.58
SWM1Q12379 FUN26YAL022C 1554 nt11.4□□□□□ -0.58
SWM1Q12379 TRM9YML014W 840 nt11.38□□□□□ -0.59
SWM1Q12379 YOL037CYOL037C 354 nt11.38□□□□□ -0.59
SWM1Q12379 YPS1YLR120C 1710 nt11.29□□□□□ -0.6
SWM1Q12379 SPT5YML010W 3192 nt11.29□□□□□ -0.6
SWM1Q12379 CCT6YDR188W 1641 nt11.27□□□□□ -0.6
SWM1Q12379 YDR095CYDR095C 411 nt11.23□□□□□ -0.61
SWM1Q12379 ALF1YNL148C 765 nt11.21□□□□□ -0.61
SWM1Q12379 SSA4YER103W 1929 nt11.21□□□□□ -0.62
SWM1Q12379 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.16□□□□□ -0.62
SWM1Q12379 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.16□□□□□ -0.62
SWM1Q12379 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.15□□□□□ -0.62
SWM1Q12379 YLR281CYLR281C 468 nt11.13□□□□□ -0.63
SWM1Q12379 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.12□□□□□ -0.63
SWM1Q12379 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.12□□□□□ -0.63
SWM1Q12379 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.12□□□□□ -0.63
SWM1Q12379 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.12□□□□□ -0.63
SWM1Q12379 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.12□□□□□ -0.63
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