Protein–RNA interactions for Protein: Q12445

POM34, Nucleoporin POM34, yeastyeast

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34Q12445 NSR1YGR159C 1245 nt16.36■□□□□ 0.21
POM34Q12445 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.12■□□□□ 0.17
POM34Q12445 NOP1YDL014W 984 nt15.53■□□□□ 0.08
POM34Q12445 MDJ1YFL016C 1536 nt14.87□□□□□ -0.03
POM34Q12445 YKL036CYKL036C 393 nt14.01□□□□□ -0.17
POM34Q12445 YJL027CYJL027C 417 nt13.67□□□□□ -0.22
POM34Q12445 SRX1YKL086W 384 nt13.59□□□□□ -0.23
POM34Q12445 Q0297Q0297 156 nt13.51□□□□□ -0.25
POM34Q12445 DBP2YNL112W 1641 nt13.03□□□□□ -0.32
POM34Q12445 YCR051WYCR051W 669 nt12.84□□□□□ -0.35
POM34Q12445 YBR190WYBR190W 312 nt12.77□□□□□ -0.37
POM34Q12445 SCS3YGL126W 1143 nt12.57□□□□□ -0.4
POM34Q12445 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.51□□□□□ -0.41
POM34Q12445 RTC3YHR087W 336 nt12.44□□□□□ -0.42
POM34Q12445 CCC1YLR220W 969 nt12.35□□□□□ -0.43
POM34Q12445 Q0182Q0182 405 nt12.32□□□□□ -0.44
POM34Q12445 YOL085CYOL085C 342 nt12.16□□□□□ -0.46
POM34Q12445 RPP1BYDL130W 321 nt12.11□□□□□ -0.47
POM34Q12445 RVS167YDR388W 1449 nt12.11□□□□□ -0.47
POM34Q12445 SCJ1YMR214W 1134 nt12.03□□□□□ -0.48
POM34Q12445 PKP1YIL042C 1185 nt12.01□□□□□ -0.49
POM34Q12445 SSA3YBL075C 1950 nt11.98□□□□□ -0.49
POM34Q12445 MOT3YMR070W 1473 nt11.94□□□□□ -0.5
POM34Q12445 PUT4YOR348C 1884 nt11.89□□□□□ -0.51
POM34Q12445 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.7□□□□□ -0.54
POM34Q12445 SHR5YOL110W 714 nt11.63□□□□□ -0.55
POM34Q12445 PET122YER153C 765 nt11.62□□□□□ -0.55
POM34Q12445 ARE1YCR048W 1833 nt11.57□□□□□ -0.56
POM34Q12445 URN1YPR152C 1398 nt11.53□□□□□ -0.56
POM34Q12445 SAH1YER043C 1350 nt11.47□□□□□ -0.57
POM34Q12445 OPI9YLR338W 858 nt11.46□□□□□ -0.57
POM34Q12445 POA1YBR022W 534 nt11.46□□□□□ -0.57
POM34Q12445 DEP1YAL013W 1218 nt11.41□□□□□ -0.58
POM34Q12445 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.39□□□□□ -0.59
POM34Q12445 SCR1SCR1 522 nt11.36□□□□□ -0.59
POM34Q12445 YDJ1YNL064C 1230 nt11.34□□□□□ -0.59
POM34Q12445 BSC6YOL137W 1494 nt11.3□□□□□ -0.6
POM34Q12445 RPN10YHR200W 807 nt11.25□□□□□ -0.61
POM34Q12445 RRN5YLR141W 1092 nt11.25□□□□□ -0.61
POM34Q12445 YNL208WYNL208W 600 nt11.19□□□□□ -0.62
POM34Q12445 ATS1YAL020C 1002 nt11.14□□□□□ -0.63
POM34Q12445 GAR1YHR089C 618 nt11.12□□□□□ -0.63
POM34Q12445 PUN1YLR414C 792 nt11.11□□□□□ -0.63
POM34Q12445 SPT5YML010W 3192 nt11.1□□□□□ -0.63
POM34Q12445 BUD23YCR047C 828 nt11.09□□□□□ -0.63
POM34Q12445 PTC2YER089C 1395 nt11.03□□□□□ -0.64
POM34Q12445 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.02□□□□□ -0.65
POM34Q12445 YJR018WYJR018W 363 nt10.98□□□□□ -0.65
POM34Q12445 NAB2YGL122C 1578 nt10.93□□□□□ -0.66
POM34Q12445 RSB1YOR049C 1065 nt10.88□□□□□ -0.67
POM34Q12445 SSA4YER103W 1929 nt10.82□□□□□ -0.68
POM34Q12445 TIR1YER011W 765 nt10.78□□□□□ -0.68
POM34Q12445 YJR120WYJR120W 351 nt10.78□□□□□ -0.68
POM34Q12445 FIS1YIL065C 468 nt10.77□□□□□ -0.69
POM34Q12445 SSA1YAL005C 1929 nt10.74□□□□□ -0.69
POM34Q12445 DAL1YIR027C 1383 nt10.72□□□□□ -0.69
POM34Q12445 FPR4YLR449W 1179 nt10.66□□□□□ -0.7
POM34Q12445 MEP2YNL142W 1500 nt10.64□□□□□ -0.71
POM34Q12445 INM2YDR287W 879 nt10.63□□□□□ -0.71
POM34Q12445 RPP2BYDR382W 333 nt10.63□□□□□ -0.71
POM34Q12445 PHO4YFR034C 939 nt10.62□□□□□ -0.71
POM34Q12445 YPS1YLR120C 1710 nt10.56□□□□□ -0.72
POM34Q12445 SRB2YHR041C 633 nt10.52□□□□□ -0.73
POM34Q12445 DCW1YKL046C 1350 nt10.48□□□□□ -0.73
POM34Q12445 BDF1YLR399C 2061 nt10.47□□□□□ -0.73
POM34Q12445 YBL100CYBL100C 315 nt10.46□□□□□ -0.73
POM34Q12445 YDR095CYDR095C 411 nt10.44□□□□□ -0.74
POM34Q12445 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.43□□□□□ -0.74
POM34Q12445 PST2YDR032C 597 nt10.4□□□□□ -0.74
POM34Q12445 BDH2YAL061W 1254 nt10.39□□□□□ -0.75
POM34Q12445 FUN26YAL022C 1554 nt10.35□□□□□ -0.75
POM34Q12445 EMI2YDR516C 1503 nt10.33□□□□□ -0.76
POM34Q12445 TAT1YBR069C 1860 nt10.32□□□□□ -0.76
POM34Q12445 PTP1YDL230W 1008 nt10.27□□□□□ -0.77
POM34Q12445 YBR220CYBR220C 1683 nt10.26□□□□□ -0.77
POM34Q12445 WWM1YFL010C 636 nt10.25□□□□□ -0.77
POM34Q12445 YMR090WYMR090W 684 nt10.25□□□□□ -0.77
POM34Q12445 CAC2YML102W 1407 nt10.24□□□□□ -0.77
POM34Q12445 TRM9YML014W 840 nt10.24□□□□□ -0.77
POM34Q12445 ALF1YNL148C 765 nt10.24□□□□□ -0.77
POM34Q12445 RPP2AYOL039W 321 nt10.23□□□□□ -0.77
POM34Q12445 YDL221WYDL221W 552 nt10.22□□□□□ -0.77
POM34Q12445 PAC11YDR488C 1602 nt10.22□□□□□ -0.77
POM34Q12445 FPS1YLL043W 2010 nt10.21□□□□□ -0.78
POM34Q12445 LSM3YLR438C-A 270 nt10.19□□□□□ -0.78
POM34Q12445 NVJ2YPR091C 2313 nt10.18□□□□□ -0.78
POM34Q12445 CCT6YDR188W 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
POM34Q12445 SDH1YKL148C 1923 nt10.17□□□□□ -0.78
POM34Q12445 SIS1YNL007C 1059 nt10.14□□□□□ -0.79
POM34Q12445 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.09□□□□□ -0.79
POM34Q12445 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.09□□□□□ -0.79
POM34Q12445 IRC15YPL017C 1500 nt10.08□□□□□ -0.8
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