Protein–RNA interactions for Protein: P53040

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, yeastyeast

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF6P53040 NSR1YGR159C 1245 nt20.31■□□□□ 0.84
TAF6P53040 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.03■□□□□ 0.8
TAF6P53040 NOP1YDL014W 984 nt19.29■□□□□ 0.68
TAF6P53040 MDJ1YFL016C 1536 nt18.47■□□□□ 0.55
TAF6P53040 YKL036CYKL036C 393 nt17.34■□□□□ 0.37
TAF6P53040 YJL027CYJL027C 417 nt17.02■□□□□ 0.32
TAF6P53040 SRX1YKL086W 384 nt16.83■□□□□ 0.28
TAF6P53040 Q0297Q0297 156 nt16.7■□□□□ 0.26
TAF6P53040 DBP2YNL112W 1641 nt16.14■□□□□ 0.17
TAF6P53040 YCR051WYCR051W 669 nt15.95■□□□□ 0.14
TAF6P53040 YBR190WYBR190W 312 nt15.88■□□□□ 0.13
TAF6P53040 RTC3YHR087W 336 nt15.53■□□□□ 0.08
TAF6P53040 SCS3YGL126W 1143 nt15.51■□□□□ 0.07
TAF6P53040 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.48■□□□□ 0.07
TAF6P53040 CCC1YLR220W 969 nt15.36■□□□□ 0.05
TAF6P53040 RVS167YDR388W 1449 nt15.09■□□□□ 0.01
TAF6P53040 YOL085CYOL085C 342 nt15.03■□□□□ -0
TAF6P53040 RPP1BYDL130W 321 nt15□□□□□ -0.01
TAF6P53040 SSA3YBL075C 1950 nt14.93□□□□□ -0.02
TAF6P53040 SCJ1YMR214W 1134 nt14.88□□□□□ -0.03
TAF6P53040 PKP1YIL042C 1185 nt14.87□□□□□ -0.03
TAF6P53040 PUT4YOR348C 1884 nt14.76□□□□□ -0.05
TAF6P53040 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.51□□□□□ -0.09
TAF6P53040 SHR5YOL110W 714 nt14.44□□□□□ -0.1
TAF6P53040 PET122YER153C 765 nt14.38□□□□□ -0.11
TAF6P53040 ARE1YCR048W 1833 nt14.36□□□□□ -0.11
TAF6P53040 URN1YPR152C 1398 nt14.34□□□□□ -0.11
TAF6P53040 POA1YBR022W 534 nt14.29□□□□□ -0.12
TAF6P53040 SAH1YER043C 1350 nt14.26□□□□□ -0.13
TAF6P53040 OPI9YLR338W 858 nt14.22□□□□□ -0.13
TAF6P53040 DEP1YAL013W 1218 nt14.21□□□□□ -0.13
TAF6P53040 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.18□□□□□ -0.14
TAF6P53040 SCR1SCR1 522 nt14.12□□□□□ -0.15
TAF6P53040 BSC6YOL137W 1494 nt14.06□□□□□ -0.16
TAF6P53040 RPN10YHR200W 807 nt14.03□□□□□ -0.16
TAF6P53040 YDJ1YNL064C 1230 nt14.03□□□□□ -0.16
TAF6P53040 YNL208WYNL208W 600 nt13.93□□□□□ -0.18
TAF6P53040 RRN5YLR141W 1092 nt13.92□□□□□ -0.18
TAF6P53040 BUD23YCR047C 828 nt13.84□□□□□ -0.19
TAF6P53040 PUN1YLR414C 792 nt13.81□□□□□ -0.2
TAF6P53040 GAR1YHR089C 618 nt13.8□□□□□ -0.2
TAF6P53040 ATS1YAL020C 1002 nt13.75□□□□□ -0.21
TAF6P53040 PTC2YER089C 1395 nt13.72□□□□□ -0.21
TAF6P53040 SPT5YML010W 3192 nt13.72□□□□□ -0.21
TAF6P53040 YJR018WYJR018W 363 nt13.65□□□□□ -0.22
TAF6P53040 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.64□□□□□ -0.23
TAF6P53040 NAB2YGL122C 1578 nt13.62□□□□□ -0.23
TAF6P53040 RSB1YOR049C 1065 nt13.5□□□□□ -0.25
TAF6P53040 SSA4YER103W 1929 nt13.48□□□□□ -0.25
TAF6P53040 TIR1YER011W 765 nt13.37□□□□□ -0.27
TAF6P53040 DAL1YIR027C 1383 nt13.34□□□□□ -0.27
TAF6P53040 FIS1YIL065C 468 nt13.34□□□□□ -0.27
TAF6P53040 FPR4YLR449W 1179 nt13.32□□□□□ -0.28
TAF6P53040 YJR120WYJR120W 351 nt13.3□□□□□ -0.28
TAF6P53040 SSA1YAL005C 1929 nt13.29□□□□□ -0.28
TAF6P53040 RPP2BYDR382W 333 nt13.27□□□□□ -0.29
TAF6P53040 MEP2YNL142W 1500 nt13.24□□□□□ -0.29
TAF6P53040 INM2YDR287W 879 nt13.23□□□□□ -0.29
TAF6P53040 PHO4YFR034C 939 nt13.21□□□□□ -0.29
TAF6P53040 YPS1YLR120C 1710 nt13.12□□□□□ -0.31
TAF6P53040 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.03□□□□□ -0.32
TAF6P53040 YBL100CYBL100C 315 nt13.03□□□□□ -0.32
TAF6P53040 DCW1YKL046C 1350 nt13.02□□□□□ -0.33
TAF6P53040 BDF1YLR399C 2061 nt12.98□□□□□ -0.33
TAF6P53040 YDR095CYDR095C 411 nt12.95□□□□□ -0.34
TAF6P53040 SRB2YHR041C 633 nt12.95□□□□□ -0.34
TAF6P53040 BDH2YAL061W 1254 nt12.91□□□□□ -0.34
TAF6P53040 FUN26YAL022C 1554 nt12.86□□□□□ -0.35
TAF6P53040 EMI2YDR516C 1503 nt12.85□□□□□ -0.35
TAF6P53040 YMR090WYMR090W 684 nt12.83□□□□□ -0.36
TAF6P53040 PST2YDR032C 597 nt12.82□□□□□ -0.36
TAF6P53040 TAT1YBR069C 1860 nt12.8□□□□□ -0.36
TAF6P53040 ALF1YNL148C 765 nt12.78□□□□□ -0.36
TAF6P53040 TRM9YML014W 840 nt12.76□□□□□ -0.37
TAF6P53040 YBR220CYBR220C 1683 nt12.76□□□□□ -0.37
TAF6P53040 RPP2AYOL039W 321 nt12.73□□□□□ -0.37
TAF6P53040 YDL221WYDL221W 552 nt12.71□□□□□ -0.37
TAF6P53040 PTP1YDL230W 1008 nt12.71□□□□□ -0.37
TAF6P53040 CAC2YML102W 1407 nt12.71□□□□□ -0.38
TAF6P53040 WWM1YFL010C 636 nt12.69□□□□□ -0.38
TAF6P53040 LSM3YLR438C-A 270 nt12.66□□□□□ -0.38
TAF6P53040 SDH1YKL148C 1923 nt12.64□□□□□ -0.39
TAF6P53040 CCT6YDR188W 1641 nt12.62□□□□□ -0.39
TAF6P53040 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.58□□□□□ -0.4
TAF6P53040 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.58□□□□□ -0.4
TAF6P53040 SIS1YNL007C 1059 nt12.58□□□□□ -0.4
TAF6P53040 SCC4YER147C 1875 nt12.51□□□□□ -0.41
TAF6P53040 IRC15YPL017C 1500 nt12.5□□□□□ -0.41
TAF6P53040 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.49□□□□□ -0.41
TAF6P53040 YGR021WYGR021W 873 nt12.48□□□□□ -0.41
TAF6P53040 GIS3YLR094C 1509 nt12.44□□□□□ -0.42
TAF6P53040 ART5YGR068C 1761 nt12.43□□□□□ -0.42
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