RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	MSC1	Q03104	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	TRS31	Q03337	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	CYK3	Q07533	885 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	RTT109	Q07794	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	AHC2	P25649	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	SPC29	P33419	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	LST4	P34239	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	YIL089W	P40500	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	SER2	P42941	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	PMT4	P46971	762 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	RTA1	P53047	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	GPI1	P53306	609 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	COG5	P53951	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	ARK1	P53974	638 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	YSA1	Q01976	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	ALE1	Q08548	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	THI21	Q08975	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	TGL5	Q12043	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	SFM1	Q12314	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CYK3	YDL117W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CYK3	YDL117W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	BEM1	P29366	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HYM1	P32464	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NUP2	P32499	720 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	UTR4	P32626	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PTM1	P32857	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	DUT1	P33317	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ECT1	P33412	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FMP23	P38231	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HSL7	P38274	827 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HXT9	P40885	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	OPT1	P40897	799 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YGR201C	P42936	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CYK3	YDL117W	TIM44	Q01852	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RSC9	Q03124	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SLD7	Q08457	257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PSY3	Q12318	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SUL2	Q12325	893 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CYK3	YDL117W	MAS2	P11914	482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TGL1	P34163	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YBR220C	P38318	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	BIT2	P38346	545 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	LTP1	P40347	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	OTU1	P43558	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RMD8	P43620	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	UBC12	P52491	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HHO1	P53551	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FMP45	Q07651	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PSF1	Q12488	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SKS1	Q12505	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CDC34	P14682	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	COQ1	P18900	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YBR032W	P38223	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FAT1	P38225	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	DUN1	P39009	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YER085C	P40058	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PFA3	P42836	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	GUF1	P46943	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MRX5	P47007	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SOL1	P50278	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TIM21	P53220	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
CYK3	YDL117W	TPP1	Q03796	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ADY4	Q05955	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TMA10	Q06177	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CDC73	Q06697	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SNF8	Q12483	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FSH3	Q99369	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 137.3 ms