Protein–RNA interactions for Protein: Q12040

YOR283W, Broad-specificity phosphatase YOR283W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR283WQ12040 NSR1YGR159C 1245 nt17.79■□□□□ 0.44
YOR283WQ12040 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.43■□□□□ 0.38
YOR283WQ12040 NOP1YDL014W 984 nt16.73■□□□□ 0.27
YOR283WQ12040 MDJ1YFL016C 1536 nt16.29■□□□□ 0.2
YOR283WQ12040 YJL027CYJL027C 417 nt14.98□□□□□ -0.01
YOR283WQ12040 YKL036CYKL036C 393 nt14.94□□□□□ -0.02
YOR283WQ12040 SRX1YKL086W 384 nt14.62□□□□□ -0.07
YOR283WQ12040 Q0297Q0297 156 nt14.47□□□□□ -0.09
YOR283WQ12040 DBP2YNL112W 1641 nt14.21□□□□□ -0.13
YOR283WQ12040 YBR190WYBR190W 312 nt14.04□□□□□ -0.16
YOR283WQ12040 SSA3YBL075C 1950 nt13.87□□□□□ -0.19
YOR283WQ12040 YCR051WYCR051W 669 nt13.82□□□□□ -0.2
YOR283WQ12040 RTC3YHR087W 336 nt13.69□□□□□ -0.22
YOR283WQ12040 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR283WQ12040 CCC1YLR220W 969 nt13.39□□□□□ -0.27
YOR283WQ12040 SCS3YGL126W 1143 nt13.32□□□□□ -0.28
YOR283WQ12040 RVS167YDR388W 1449 nt13.23□□□□□ -0.29
YOR283WQ12040 PUT4YOR348C 1884 nt13.16□□□□□ -0.3
YOR283WQ12040 SCJ1YMR214W 1134 nt13.05□□□□□ -0.32
YOR283WQ12040 RPP1BYDL130W 321 nt12.98□□□□□ -0.33
YOR283WQ12040 YOL085CYOL085C 342 nt12.95□□□□□ -0.34
YOR283WQ12040 PKP1YIL042C 1185 nt12.81□□□□□ -0.36
YOR283WQ12040 ARE1YCR048W 1833 nt12.76□□□□□ -0.37
YOR283WQ12040 POA1YBR022W 534 nt12.7□□□□□ -0.38
YOR283WQ12040 SHR5YOL110W 714 nt12.65□□□□□ -0.38
YOR283WQ12040 URN1YPR152C 1398 nt12.63□□□□□ -0.39
YOR283WQ12040 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.62□□□□□ -0.39
YOR283WQ12040 SAH1YER043C 1350 nt12.61□□□□□ -0.39
YOR283WQ12040 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.59□□□□□ -0.39
YOR283WQ12040 OPI9YLR338W 858 nt12.56□□□□□ -0.4
YOR283WQ12040 BSC6YOL137W 1494 nt12.53□□□□□ -0.4
YOR283WQ12040 PET122YER153C 765 nt12.46□□□□□ -0.41
YOR283WQ12040 DEP1YAL013W 1218 nt12.46□□□□□ -0.41
YOR283WQ12040 SPT5YML010W 3192 nt12.37□□□□□ -0.43
YOR283WQ12040 RPN10YHR200W 807 nt12.31□□□□□ -0.44
YOR283WQ12040 BUD23YCR047C 828 nt12.26□□□□□ -0.45
YOR283WQ12040 YDJ1YNL064C 1230 nt12.22□□□□□ -0.45
YOR283WQ12040 YNL208WYNL208W 600 nt12.22□□□□□ -0.45
YOR283WQ12040 SCR1SCR1 522 nt12.19□□□□□ -0.46
YOR283WQ12040 PUN1YLR414C 792 nt12.18□□□□□ -0.46
YOR283WQ12040 SSA4YER103W 1929 nt12.17□□□□□ -0.46
YOR283WQ12040 PTC2YER089C 1395 nt12.13□□□□□ -0.47
YOR283WQ12040 NAB2YGL122C 1578 nt12.05□□□□□ -0.48
YOR283WQ12040 RRN5YLR141W 1092 nt12.05□□□□□ -0.48
YOR283WQ12040 GAR1YHR089C 618 nt12.02□□□□□ -0.49
YOR283WQ12040 YJR018WYJR018W 363 nt12.01□□□□□ -0.49
YOR283WQ12040 MEP2YNL142W 1500 nt11.82□□□□□ -0.52
YOR283WQ12040 FIS1YIL065C 468 nt11.82□□□□□ -0.52
YOR283WQ12040 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.8□□□□□ -0.52
YOR283WQ12040 DAL1YIR027C 1383 nt11.78□□□□□ -0.52
YOR283WQ12040 BDF1YLR399C 2061 nt11.77□□□□□ -0.52
YOR283WQ12040 ATS1YAL020C 1002 nt11.76□□□□□ -0.53
YOR283WQ12040 FPR4YLR449W 1179 nt11.74□□□□□ -0.53
YOR283WQ12040 YJR120WYJR120W 351 nt11.71□□□□□ -0.53
YOR283WQ12040 PHO4YFR034C 939 nt11.67□□□□□ -0.54
YOR283WQ12040 INM2YDR287W 879 nt11.66□□□□□ -0.54
YOR283WQ12040 TIR1YER011W 765 nt11.65□□□□□ -0.54
YOR283WQ12040 YPS1YLR120C 1710 nt11.64□□□□□ -0.55
YOR283WQ12040 RSB1YOR049C 1065 nt11.64□□□□□ -0.55
YOR283WQ12040 SSA1YAL005C 1929 nt11.62□□□□□ -0.55
YOR283WQ12040 RPP2BYDR382W 333 nt11.62□□□□□ -0.55
YOR283WQ12040 DCW1YKL046C 1350 nt11.62□□□□□ -0.55
YOR283WQ12040 TAT1YBR069C 1860 nt11.6□□□□□ -0.55
YOR283WQ12040 PAC11YDR488C 1602 nt11.59□□□□□ -0.55
YOR283WQ12040 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.54□□□□□ -0.56
YOR283WQ12040 YDR095CYDR095C 411 nt11.48□□□□□ -0.57
YOR283WQ12040 YBL100CYBL100C 315 nt11.46□□□□□ -0.57
YOR283WQ12040 EMI2YDR516C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
YOR283WQ12040 YBR220CYBR220C 1683 nt11.43□□□□□ -0.58
YOR283WQ12040 YMR090WYMR090W 684 nt11.42□□□□□ -0.58
YOR283WQ12040 YDL221WYDL221W 552 nt11.33□□□□□ -0.6
YOR283WQ12040 NVJ2YPR091C 2313 nt11.33□□□□□ -0.6
YOR283WQ12040 SRB2YHR041C 633 nt11.32□□□□□ -0.6
YOR283WQ12040 BDH2YAL061W 1254 nt11.31□□□□□ -0.6
YOR283WQ12040 FUN26YAL022C 1554 nt11.3□□□□□ -0.6
YOR283WQ12040 SDH1YKL148C 1923 nt11.3□□□□□ -0.6
YOR283WQ12040 CAC2YML102W 1407 nt11.28□□□□□ -0.6
YOR283WQ12040 PTP1YDL230W 1008 nt11.27□□□□□ -0.61
YOR283WQ12040 RPP2AYOL039W 321 nt11.26□□□□□ -0.61
YOR283WQ12040 ALF1YNL148C 765 nt11.25□□□□□ -0.61
YOR283WQ12040 TRM9YML014W 840 nt11.18□□□□□ -0.62
YOR283WQ12040 SCC4YER147C 1875 nt11.15□□□□□ -0.63
YOR283WQ12040 PCH2YBR186W 1695 nt11.12□□□□□ -0.63
YOR283WQ12040 IRC15YPL017C 1500 nt11.11□□□□□ -0.63
YOR283WQ12040 CCT6YDR188W 1641 nt11.1□□□□□ -0.63
YOR283WQ12040 SIS1YNL007C 1059 nt11.1□□□□□ -0.63
YOR283WQ12040 SEC11YIR022W 504 nt11.09□□□□□ -0.63
YOR283WQ12040 GUT2YIL155C 1950 nt11.08□□□□□ -0.64
YOR283WQ12040 LSM3YLR438C-A 270 nt11.07□□□□□ -0.64
YOR283WQ12040 GIS3YLR094C 1509 nt11.05□□□□□ -0.64
YOR283WQ12040 WWM1YFL010C 636 nt11.04□□□□□ -0.64
YOR283WQ12040 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms