Protein–RNA interactions for Protein: Q07533

CYK3, Cytokinesis protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3Q07533 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.71■□□□□ 0.59
CYK3Q07533 NSR1YGR159C 1245 nt18.52■□□□□ 0.56
CYK3Q07533 NOP1YDL014W 984 nt18.35■□□□□ 0.53
CYK3Q07533 YKL036CYKL036C 393 nt17.08■□□□□ 0.32
CYK3Q07533 MDJ1YFL016C 1536 nt16.49■□□□□ 0.23
CYK3Q07533 Q0297Q0297 156 nt16.12■□□□□ 0.17
CYK3Q07533 SRX1YKL086W 384 nt16.02■□□□□ 0.16
CYK3Q07533 YJL027CYJL027C 417 nt15.94■□□□□ 0.14
CYK3Q07533 SCS3YGL126W 1143 nt15.6■□□□□ 0.09
CYK3Q07533 YCR051WYCR051W 669 nt15.15■□□□□ 0.02
CYK3Q07533 YOL085CYOL085C 342 nt14.77□□□□□ -0.05
CYK3Q07533 DBP2YNL112W 1641 nt14.59□□□□□ -0.07
CYK3Q07533 RPP1BYDL130W 321 nt14.45□□□□□ -0.1
CYK3Q07533 PKP1YIL042C 1185 nt14.45□□□□□ -0.1
CYK3Q07533 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.36□□□□□ -0.11
CYK3Q07533 SCJ1YMR214W 1134 nt14.16□□□□□ -0.14
CYK3Q07533 CCC1YLR220W 969 nt14.14□□□□□ -0.15
CYK3Q07533 YBR190WYBR190W 312 nt14.07□□□□□ -0.16
CYK3Q07533 ATS1YAL020C 1002 nt14.03□□□□□ -0.16
CYK3Q07533 PET122YER153C 765 nt13.73□□□□□ -0.21
CYK3Q07533 RTC3YHR087W 336 nt13.72□□□□□ -0.21
CYK3Q07533 SCR1SCR1 522 nt13.7□□□□□ -0.22
CYK3Q07533 RVS167YDR388W 1449 nt13.64□□□□□ -0.23
CYK3Q07533 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.64□□□□□ -0.23
CYK3Q07533 SSA3YBL075C 1950 nt13.63□□□□□ -0.23
CYK3Q07533 RRN5YLR141W 1092 nt13.36□□□□□ -0.27
CYK3Q07533 YDJ1YNL064C 1230 nt13.24□□□□□ -0.29
CYK3Q07533 SHR5YOL110W 714 nt13.21□□□□□ -0.29
CYK3Q07533 RSB1YOR049C 1065 nt13.14□□□□□ -0.31
CYK3Q07533 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.11□□□□□ -0.31
CYK3Q07533 PUT4YOR348C 1884 nt12.97□□□□□ -0.33
CYK3Q07533 PST2YDR032C 597 nt12.97□□□□□ -0.33
CYK3Q07533 GAR1YHR089C 618 nt12.83□□□□□ -0.36
CYK3Q07533 URN1YPR152C 1398 nt12.82□□□□□ -0.36
CYK3Q07533 DEP1YAL013W 1218 nt12.79□□□□□ -0.36
CYK3Q07533 OPI9YLR338W 858 nt12.68□□□□□ -0.38
CYK3Q07533 ARE1YCR048W 1833 nt12.67□□□□□ -0.38
CYK3Q07533 SAH1YER043C 1350 nt12.65□□□□□ -0.38
CYK3Q07533 RPN10YHR200W 807 nt12.6□□□□□ -0.39
CYK3Q07533 YNL208WYNL208W 600 nt12.59□□□□□ -0.39
CYK3Q07533 YKL097CYKL097C 411 nt12.54□□□□□ -0.4
CYK3Q07533 POA1YBR022W 534 nt12.54□□□□□ -0.4
CYK3Q07533 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.47□□□□□ -0.41
CYK3Q07533 TIR1YER011W 765 nt12.43□□□□□ -0.42
CYK3Q07533 SHU1YHL006C 453 nt12.36□□□□□ -0.43
CYK3Q07533 BSC6YOL137W 1494 nt12.34□□□□□ -0.43
CYK3Q07533 PUN1YLR414C 792 nt12.27□□□□□ -0.45
CYK3Q07533 YJR018WYJR018W 363 nt12.22□□□□□ -0.45
CYK3Q07533 SSA1YAL005C 1929 nt12.21□□□□□ -0.46
CYK3Q07533 PTC2YER089C 1395 nt12.18□□□□□ -0.46
CYK3Q07533 BUD23YCR047C 828 nt12.15□□□□□ -0.46
CYK3Q07533 YJR120WYJR120W 351 nt12.09□□□□□ -0.47
CYK3Q07533 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.06□□□□□ -0.48
CYK3Q07533 SPT5YML010W 3192 nt12.02□□□□□ -0.48
CYK3Q07533 NAB2YGL122C 1578 nt12.02□□□□□ -0.49
CYK3Q07533 SRB2YHR041C 633 nt12□□□□□ -0.49
CYK3Q07533 YOR139CYOR139C 393 nt11.98□□□□□ -0.49
CYK3Q07533 RPP2BYDR382W 333 nt11.96□□□□□ -0.49
CYK3Q07533 YGR021WYGR021W 873 nt11.95□□□□□ -0.5
CYK3Q07533 FIS1YIL065C 468 nt11.88□□□□□ -0.51
CYK3Q07533 WWM1YFL010C 636 nt11.87□□□□□ -0.51
CYK3Q07533 HOM6YJR139C 1080 nt11.87□□□□□ -0.51
CYK3Q07533 NPL3YDR432W 1245 nt11.86□□□□□ -0.51
CYK3Q07533 DAL1YIR027C 1383 nt11.84□□□□□ -0.51
CYK3Q07533 INM2YDR287W 879 nt11.79□□□□□ -0.52
CYK3Q07533 MNP1YGL068W 585 nt11.78□□□□□ -0.52
CYK3Q07533 FPR4YLR449W 1179 nt11.78□□□□□ -0.52
CYK3Q07533 YOL037CYOL037C 354 nt11.76□□□□□ -0.53
CYK3Q07533 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.75□□□□□ -0.53
CYK3Q07533 BDH2YAL061W 1254 nt11.75□□□□□ -0.53
CYK3Q07533 SSA4YER103W 1929 nt11.75□□□□□ -0.53
CYK3Q07533 PHO4YFR034C 939 nt11.74□□□□□ -0.53
CYK3Q07533 RKM5YLR137W 1104 nt11.69□□□□□ -0.54
CYK3Q07533 LSM3YLR438C-A 270 nt11.68□□□□□ -0.54
CYK3Q07533 YBL100CYBL100C 315 nt11.66□□□□□ -0.54
CYK3Q07533 Q0182Q0182 405 nt11.63□□□□□ -0.55
CYK3Q07533 MEP2YNL142W 1500 nt11.61□□□□□ -0.55
CYK3Q07533 YPS1YLR120C 1710 nt11.57□□□□□ -0.56
CYK3Q07533 FUN26YAL022C 1554 nt11.54□□□□□ -0.56
CYK3Q07533 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.52□□□□□ -0.57
CYK3Q07533 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.52□□□□□ -0.57
CYK3Q07533 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.52□□□□□ -0.57
CYK3Q07533 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.52□□□□□ -0.57
CYK3Q07533 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.52□□□□□ -0.57
CYK3Q07533 TRM9YML014W 840 nt11.49□□□□□ -0.57
CYK3Q07533 BDF1YLR399C 2061 nt11.48□□□□□ -0.57
CYK3Q07533 YDR095CYDR095C 411 nt11.48□□□□□ -0.57
CYK3Q07533 YLR281CYLR281C 468 nt11.45□□□□□ -0.58
CYK3Q07533 DCW1YKL046C 1350 nt11.43□□□□□ -0.58
CYK3Q07533 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.43□□□□□ -0.58
CYK3Q07533 PAC11YDR488C 1602 nt11.41□□□□□ -0.58
CYK3Q07533 CCT6YDR188W 1641 nt11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms