Protein–RNA interactions for Protein: P29366

BEM1, Bud emergence protein 1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BEM1P29366 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.44■□□□□ 0.86
BEM1P29366 NSR1YGR159C 1245 nt20.42■□□□□ 0.86
BEM1P29366 NOP1YDL014W 984 nt19.82■□□□□ 0.76
BEM1P29366 YKL036CYKL036C 393 nt18.23■□□□□ 0.51
BEM1P29366 MDJ1YFL016C 1536 nt18.22■□□□□ 0.51
BEM1P29366 Q0297Q0297 156 nt17.37■□□□□ 0.37
BEM1P29366 SRX1YKL086W 384 nt17.35■□□□□ 0.37
BEM1P29366 YJL027CYJL027C 417 nt16.98■□□□□ 0.31
BEM1P29366 SCS3YGL126W 1143 nt16.56■□□□□ 0.24
BEM1P29366 YCR051WYCR051W 669 nt16.42■□□□□ 0.22
BEM1P29366 DBP2YNL112W 1641 nt16.14■□□□□ 0.17
BEM1P29366 YOL085CYOL085C 342 nt15.82■□□□□ 0.12
BEM1P29366 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.76■□□□□ 0.11
BEM1P29366 RPP1BYDL130W 321 nt15.57■□□□□ 0.08
BEM1P29366 PKP1YIL042C 1185 nt15.56■□□□□ 0.08
BEM1P29366 YBR190WYBR190W 312 nt15.56■□□□□ 0.08
BEM1P29366 CCC1YLR220W 969 nt15.55■□□□□ 0.08
BEM1P29366 RTC3YHR087W 336 nt15.16■□□□□ 0.02
BEM1P29366 SCJ1YMR214W 1134 nt15.16■□□□□ 0.02
BEM1P29366 RVS167YDR388W 1449 nt15.06■□□□□ 0
BEM1P29366 PET122YER153C 765 nt14.9□□□□□ -0.02
BEM1P29366 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.87□□□□□ -0.03
BEM1P29366 ATS1YAL020C 1002 nt14.85□□□□□ -0.03
BEM1P29366 SCR1SCR1 522 nt14.66□□□□□ -0.06
BEM1P29366 SHR5YOL110W 714 nt14.55□□□□□ -0.08
BEM1P29366 RRN5YLR141W 1092 nt14.46□□□□□ -0.09
BEM1P29366 YDJ1YNL064C 1230 nt14.39□□□□□ -0.11
BEM1P29366 PUT4YOR348C 1884 nt14.24□□□□□ -0.13
BEM1P29366 URN1YPR152C 1398 nt14.2□□□□□ -0.14
BEM1P29366 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.18□□□□□ -0.14
BEM1P29366 DEP1YAL013W 1218 nt14.15□□□□□ -0.14
BEM1P29366 RSB1YOR049C 1065 nt14.1□□□□□ -0.15
BEM1P29366 GAR1YHR089C 618 nt14.06□□□□□ -0.16
BEM1P29366 OPI9YLR338W 858 nt14.02□□□□□ -0.17
BEM1P29366 SAH1YER043C 1350 nt13.96□□□□□ -0.18
BEM1P29366 ARE1YCR048W 1833 nt13.95□□□□□ -0.18
BEM1P29366 RPN10YHR200W 807 nt13.93□□□□□ -0.18
BEM1P29366 YNL208WYNL208W 600 nt13.93□□□□□ -0.18
BEM1P29366 POA1YBR022W 534 nt13.75□□□□□ -0.21
BEM1P29366 PST2YDR032C 597 nt13.73□□□□□ -0.21
BEM1P29366 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.73□□□□□ -0.21
BEM1P29366 SSA3YBL075C 1950 nt13.63□□□□□ -0.23
BEM1P29366 TIR1YER011W 765 nt13.6□□□□□ -0.23
BEM1P29366 PUN1YLR414C 792 nt13.59□□□□□ -0.23
BEM1P29366 YJR018WYJR018W 363 nt13.53□□□□□ -0.24
BEM1P29366 SSA1YAL005C 1929 nt13.49□□□□□ -0.25
BEM1P29366 BSC6YOL137W 1494 nt13.48□□□□□ -0.25
BEM1P29366 PTC2YER089C 1395 nt13.45□□□□□ -0.26
BEM1P29366 YJR120WYJR120W 351 nt13.38□□□□□ -0.27
BEM1P29366 YKL097CYKL097C 411 nt13.38□□□□□ -0.27
BEM1P29366 BUD23YCR047C 828 nt13.37□□□□□ -0.27
BEM1P29366 SRB2YHR041C 633 nt13.29□□□□□ -0.28
BEM1P29366 NAB2YGL122C 1578 nt13.28□□□□□ -0.28
BEM1P29366 RPP2BYDR382W 333 nt13.2□□□□□ -0.3
BEM1P29366 SHU1YHL006C 453 nt13.19□□□□□ -0.3
BEM1P29366 FIS1YIL065C 468 nt13.13□□□□□ -0.31
BEM1P29366 DAL1YIR027C 1383 nt13.09□□□□□ -0.31
BEM1P29366 INM2YDR287W 879 nt13.06□□□□□ -0.32
BEM1P29366 FPR4YLR449W 1179 nt13.02□□□□□ -0.33
BEM1P29366 SPT5YML010W 3192 nt13□□□□□ -0.33
BEM1P29366 WWM1YFL010C 636 nt13□□□□□ -0.33
BEM1P29366 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.99□□□□□ -0.33
BEM1P29366 PHO4YFR034C 939 nt12.98□□□□□ -0.33
BEM1P29366 BDH2YAL061W 1254 nt12.96□□□□□ -0.33
BEM1P29366 YBL100CYBL100C 315 nt12.92□□□□□ -0.34
BEM1P29366 YGR021WYGR021W 873 nt12.87□□□□□ -0.35
BEM1P29366 HOM6YJR139C 1080 nt12.86□□□□□ -0.35
BEM1P29366 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.78□□□□□ -0.36
BEM1P29366 LSM3YLR438C-A 270 nt12.78□□□□□ -0.36
BEM1P29366 FUN26YAL022C 1554 nt12.77□□□□□ -0.36
BEM1P29366 YPS1YLR120C 1710 nt12.77□□□□□ -0.36
BEM1P29366 MNP1YGL068W 585 nt12.77□□□□□ -0.37
BEM1P29366 TRM9YML014W 840 nt12.71□□□□□ -0.37
BEM1P29366 YOR139CYOR139C 393 nt12.71□□□□□ -0.37
BEM1P29366 YDR095CYDR095C 411 nt12.69□□□□□ -0.38
BEM1P29366 MEP2YNL142W 1500 nt12.67□□□□□ -0.38
BEM1P29366 RKM5YLR137W 1104 nt12.66□□□□□ -0.38
BEM1P29366 CCT6YDR188W 1641 nt12.62□□□□□ -0.39
BEM1P29366 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.59□□□□□ -0.39
BEM1P29366 NPL3YDR432W 1245 nt12.58□□□□□ -0.4
BEM1P29366 ALF1YNL148C 765 nt12.56□□□□□ -0.4
BEM1P29366 YOL037CYOL037C 354 nt12.51□□□□□ -0.41
BEM1P29366 SSA4YER103W 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
BEM1P29366 DCW1YKL046C 1350 nt12.48□□□□□ -0.41
BEM1P29366 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.47□□□□□ -0.41
BEM1P29366 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.47□□□□□ -0.41
BEM1P29366 SIS1YNL007C 1059 nt12.45□□□□□ -0.42
BEM1P29366 PTP1YDL230W 1008 nt12.44□□□□□ -0.42
BEM1P29366 RPP2AYOL039W 321 nt12.43□□□□□ -0.42
BEM1P29366 CAC2YML102W 1407 nt12.34□□□□□ -0.43
BEM1P29366 EMI2YDR516C 1503 nt12.31□□□□□ -0.44
BEM1P29366 ART5YGR068C 1761 nt12.25□□□□□ -0.45
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