RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	SGT1	Q08446	395 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RUP1	Q12242	671 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	COX3	P00420	269 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	CTR86	P25355	563 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PMU1	P36069	295 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	WSS1	P38838	269 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YAL037W	P39728	267 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	SSN8	P47821	323 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	AVT4	P50944	713 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YGR016W	P53209	190 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	POP6	P53218	158 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	AYT1	Q12226	474 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	SET6	Q12529	373 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ALG1	P16661	449 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	DAD2	P36162	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PFF1	P38244	976 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RPH1	P39956	796 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	GAT2	P40209	560 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	GCD10	P41814	478 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ARK1	P53974	638 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PIR3	Q03180	325 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ORT1	Q12375	292 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RAD57	P25301	460 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	LSB5	P25369	354 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RTT107	P38850	1070 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RPR2	P40571	144 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	EPL1	P43572	832 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	BRO1	P48582	844 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YNR048W	P53740	393 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	GPI15	P53961	229 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	MRP51	Q02950	344 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RSN1	Q03516	953 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	BET5	Q03630	159 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	URH1	Q04179	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	NDL1	Q06568	189 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	TIM18	Q08749	192 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	NFI1	Q12216	726 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.05	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ATS1	P31386	333 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	MDM31	P38880	579 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	STN1	P38960	494 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YPS6	P40583	537 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	CAF40	P53829	373 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	CRZ1	P53968	678 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	NSE1	Q07913	336 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ATG34	Q12292	412 aa		4.04	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YUR1	P26725	428 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PHO91	P27514	894 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	MSP1	P28737	362 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	ANP1	P32629	500 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	MRPL4	P36517	319 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	MLH1	P38920	769 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	MST28	P39552	234 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	LAM5	P43560	674 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RRT5	P43607	289 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	PHB2	P50085	310 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	RMD5	Q12508	421 aa		4.03	□□□□□ -1.76
HMS1	YOR032C	CDC21	P06785	304 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	COS10	P52924	374 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	ROG1	P53118	685 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	BTN2	P53286	410 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MMT1	Q03218	510 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	TIP41	Q12199	356 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	HEM2	P05373	342 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	CHS1	P08004	1131 aa		4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
HMS1	YOR032C	YBR056W	P38081	501 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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