Protein–RNA interactions for Protein: P25369

LSB5, LAS seventeen-binding protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSB5P25369 NSR1YGR159C 1245 nt16.95■□□□□ 0.3
LSB5P25369 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.84■□□□□ 0.29
LSB5P25369 NOP1YDL014W 984 nt16.36■□□□□ 0.21
LSB5P25369 MDJ1YFL016C 1536 nt15.16■□□□□ 0.02
LSB5P25369 YKL036CYKL036C 393 nt14.86□□□□□ -0.03
LSB5P25369 SRX1YKL086W 384 nt14.25□□□□□ -0.13
LSB5P25369 Q0297Q0297 156 nt14.22□□□□□ -0.13
LSB5P25369 YJL027CYJL027C 417 nt14.06□□□□□ -0.16
LSB5P25369 YCR051WYCR051W 669 nt13.48□□□□□ -0.25
LSB5P25369 SCS3YGL126W 1143 nt13.36□□□□□ -0.27
LSB5P25369 DBP2YNL112W 1641 nt13.31□□□□□ -0.28
LSB5P25369 YBR190WYBR190W 312 nt13.06□□□□□ -0.32
LSB5P25369 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSB5P25369 SSA3YBL075C 1950 nt12.94□□□□□ -0.34
LSB5P25369 YOL085CYOL085C 342 nt12.84□□□□□ -0.35
LSB5P25369 CCC1YLR220W 969 nt12.82□□□□□ -0.36
LSB5P25369 RPP1BYDL130W 321 nt12.75□□□□□ -0.37
LSB5P25369 RTC3YHR087W 336 nt12.73□□□□□ -0.37
LSB5P25369 PKP1YIL042C 1185 nt12.63□□□□□ -0.39
LSB5P25369 RVS167YDR388W 1449 nt12.59□□□□□ -0.39
LSB5P25369 SCJ1YMR214W 1134 nt12.38□□□□□ -0.43
LSB5P25369 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.21□□□□□ -0.45
LSB5P25369 PET122YER153C 765 nt12.16□□□□□ -0.46
LSB5P25369 SHR5YOL110W 714 nt12.08□□□□□ -0.48
LSB5P25369 PUT4YOR348C 1884 nt12.06□□□□□ -0.48
LSB5P25369 SCR1SCR1 522 nt12.05□□□□□ -0.48
LSB5P25369 ATS1YAL020C 1002 nt11.9□□□□□ -0.5
LSB5P25369 YDJ1YNL064C 1230 nt11.86□□□□□ -0.51
LSB5P25369 URN1YPR152C 1398 nt11.82□□□□□ -0.52
LSB5P25369 RRN5YLR141W 1092 nt11.79□□□□□ -0.52
LSB5P25369 DEP1YAL013W 1218 nt11.73□□□□□ -0.53
LSB5P25369 OPI9YLR338W 858 nt11.73□□□□□ -0.53
LSB5P25369 RPN10YHR200W 807 nt11.71□□□□□ -0.53
LSB5P25369 ARE1YCR048W 1833 nt11.65□□□□□ -0.54
LSB5P25369 SAH1YER043C 1350 nt11.65□□□□□ -0.55
LSB5P25369 POA1YBR022W 534 nt11.63□□□□□ -0.55
LSB5P25369 YNL208WYNL208W 600 nt11.6□□□□□ -0.55
LSB5P25369 GAR1YHR089C 618 nt11.57□□□□□ -0.56
LSB5P25369 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.56□□□□□ -0.56
LSB5P25369 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.55□□□□□ -0.56
LSB5P25369 RSB1YOR049C 1065 nt11.51□□□□□ -0.57
LSB5P25369 BSC6YOL137W 1494 nt11.51□□□□□ -0.57
LSB5P25369 PUN1YLR414C 792 nt11.42□□□□□ -0.58
LSB5P25369 SPT5YML010W 3192 nt11.4□□□□□ -0.59
LSB5P25369 SSA4YER103W 1929 nt11.33□□□□□ -0.6
LSB5P25369 YJR018WYJR018W 363 nt11.29□□□□□ -0.6
LSB5P25369 BUD23YCR047C 828 nt11.26□□□□□ -0.61
LSB5P25369 PTC2YER089C 1395 nt11.25□□□□□ -0.61
LSB5P25369 TIR1YER011W 765 nt11.21□□□□□ -0.61
LSB5P25369 NAB2YGL122C 1578 nt11.16□□□□□ -0.62
LSB5P25369 SSA1YAL005C 1929 nt11.06□□□□□ -0.64
LSB5P25369 RPP2BYDR382W 333 nt11.06□□□□□ -0.64
LSB5P25369 PST2YDR032C 597 nt11.05□□□□□ -0.64
LSB5P25369 YJR120WYJR120W 351 nt11.01□□□□□ -0.65
LSB5P25369 DAL1YIR027C 1383 nt10.98□□□□□ -0.65
LSB5P25369 FIS1YIL065C 468 nt10.96□□□□□ -0.65
LSB5P25369 INM2YDR287W 879 nt10.95□□□□□ -0.66
LSB5P25369 BDF1YLR399C 2061 nt10.95□□□□□ -0.66
LSB5P25369 FPR4YLR449W 1179 nt10.92□□□□□ -0.66
LSB5P25369 PAC11YDR488C 1602 nt10.9□□□□□ -0.66
LSB5P25369 Q0182Q0182 405 nt10.88□□□□□ -0.67
LSB5P25369 MEP2YNL142W 1500 nt10.88□□□□□ -0.67
LSB5P25369 PHO4YFR034C 939 nt10.86□□□□□ -0.67
LSB5P25369 TAT1YBR069C 1860 nt10.79□□□□□ -0.68
LSB5P25369 YBL100CYBL100C 315 nt10.79□□□□□ -0.68
LSB5P25369 SRB2YHR041C 633 nt10.77□□□□□ -0.69
LSB5P25369 BDH2YAL061W 1254 nt10.77□□□□□ -0.69
LSB5P25369 YPS1YLR120C 1710 nt10.7□□□□□ -0.7
LSB5P25369 NVJ2YPR091C 2313 nt10.67□□□□□ -0.7
LSB5P25369 DCW1YKL046C 1350 nt10.65□□□□□ -0.7
LSB5P25369 WWM1YFL010C 636 nt10.65□□□□□ -0.7
LSB5P25369 FUN26YAL022C 1554 nt10.64□□□□□ -0.71
LSB5P25369 YDR095CYDR095C 411 nt10.63□□□□□ -0.71
LSB5P25369 SHU1YHL006C 453 nt10.63□□□□□ -0.71
LSB5P25369 YGR021WYGR021W 873 nt10.62□□□□□ -0.71
LSB5P25369 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.62□□□□□ -0.71
LSB5P25369 LSM3YLR438C-A 270 nt10.62□□□□□ -0.71
LSB5P25369 TRM9YML014W 840 nt10.61□□□□□ -0.71
LSB5P25369 ALF1YNL148C 765 nt10.58□□□□□ -0.72
LSB5P25369 YMR090WYMR090W 684 nt10.57□□□□□ -0.72
LSB5P25369 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.55□□□□□ -0.72
LSB5P25369 YKL097CYKL097C 411 nt10.55□□□□□ -0.72
LSB5P25369 YBR220CYBR220C 1683 nt10.53□□□□□ -0.72
LSB5P25369 EMI2YDR516C 1503 nt10.53□□□□□ -0.72
LSB5P25369 HOM6YJR139C 1080 nt10.5□□□□□ -0.73
LSB5P25369 CCT6YDR188W 1641 nt10.49□□□□□ -0.73
LSB5P25369 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.49□□□□□ -0.73
LSB5P25369 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.48□□□□□ -0.73
LSB5P25369 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.48□□□□□ -0.73
LSB5P25369 RPP2AYOL039W 321 nt10.44□□□□□ -0.74
LSB5P25369 YDL221WYDL221W 552 nt10.4□□□□□ -0.74
LSB5P25369 SDH1YKL148C 1923 nt10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms