RNA–Protein interactions for RNA: YBL089W

AVT5, Transcript of Putative transporter, yeast

Gene AVT5, Length 1,380 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT5	YBL089W	GAC1	P28006	793 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	YIM1	P28625	365 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	LTV1	P34078	463 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	UBA4	P38820	440 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	SER3	P40054	469 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	YIL152W	P40455	235 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	BUD32	P53323	261 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
AVT5	YBL089W	DCI1	Q08558	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	VPS54	Q12071	889 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	EDE1	P34216	1381 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AVT5	YBL089W	STF1	P01098	86 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	COR1	P07256	457 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	BRF1	P29056	596 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	NIP100	P33420	868 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SWH1	P35845	1188 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	STV1	P37296	890 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SIF2	P38262	535 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	LEU5	P38702	357 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SNG1	P46950	547 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	MDE1	P47095	244 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	GPI8	P49018	411 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	FMS1	P50264	508 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YGL138C	P53122	345 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YGR126W	P53274	230 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	TOF1	P53840	1238 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	DUG3	P53871	357 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	TOF2	Q02208	771 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	HOT1	Q03213	719 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	ACL4	Q03771	387 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SWF1	Q04629	336 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YLR456W	Q06199	204 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	CDC45	Q08032	650 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SMI1	P32566	505 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	ROT2	P38138	954 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	MBB1	P39534	108 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	VRG4	P40107	337 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	MEP1	P40260	492 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	FET5	P43561	622 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	ATG27	P46989	271 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	COS5	P47187	383 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YGR149W	P48236	432 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	UBP8	P50102	471 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SKO1	Q02100	647 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SCW10	Q04951	389 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	COS7	Q07788	383 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	MLH2	Q07980	695 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	REX3	Q12090	404 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YML002W	P0CF17	737 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	DAP2	P18962	818 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	URA4	P20051	364 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RPB8	P20436	146 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RAD14	P28519	371 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	MSP1	P28737	362 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	AFG1	P32317	509 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	UIP5	P36137	443 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	DAD2	P36162	133 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	PIM1	P36775	1133 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YSW1	P38280	609 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	NAS2	P40555	220 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YJL132W	P47014	750 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	URB2	P47108	1174 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	VPS25	P47142	202 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	ECM27	P47144	725 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YGL108C	P53139	140 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SOL4	P53315	255 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SLG1	P54867	378 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	MCP2	Q06567	569 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	GSH2	Q08220	491 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	THP1	Q08231	455 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RDR1	Q08904	546 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RRD2	Q12461	358 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	CBP1	P07252	654 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AVT5	YBL089W	SPS4	P09937	338 aa		3.06	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms