Protein–RNA interactions for Protein: P53139

YGL108C, Uncharacterized protein YGL108C, yeastyeast

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGL108CP53139 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.3■□□□□ 0.84
YGL108CP53139 NSR1YGR159C 1245 nt20.05■□□□□ 0.8
YGL108CP53139 NOP1YDL014W 984 nt19.83■□□□□ 0.77
YGL108CP53139 YKL036CYKL036C 393 nt18.39■□□□□ 0.53
YGL108CP53139 MDJ1YFL016C 1536 nt17.65■□□□□ 0.42
YGL108CP53139 Q0297Q0297 156 nt17.35■□□□□ 0.37
YGL108CP53139 SRX1YKL086W 384 nt17.28■□□□□ 0.36
YGL108CP53139 YJL027CYJL027C 417 nt17.2■□□□□ 0.34
YGL108CP53139 SCS3YGL126W 1143 nt16.77■□□□□ 0.28
YGL108CP53139 YCR051WYCR051W 669 nt16.41■□□□□ 0.22
YGL108CP53139 YOL085CYOL085C 342 nt15.88■□□□□ 0.13
YGL108CP53139 PKP1YIL042C 1185 nt15.62■□□□□ 0.09
YGL108CP53139 DBP2YNL112W 1641 nt15.61■□□□□ 0.09
YGL108CP53139 RPP1BYDL130W 321 nt15.57■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.54■□□□□ 0.08
YGL108CP53139 CCC1YLR220W 969 nt15.39■□□□□ 0.05
YGL108CP53139 YBR190WYBR190W 312 nt15.13■□□□□ 0.01
YGL108CP53139 SCJ1YMR214W 1134 nt15.06■□□□□ 0
YGL108CP53139 ATS1YAL020C 1002 nt15.02■□□□□ -0
YGL108CP53139 RVS167YDR388W 1449 nt14.85□□□□□ -0.03
YGL108CP53139 PET122YER153C 765 nt14.85□□□□□ -0.03
YGL108CP53139 SSA3YBL075C 1950 nt14.83□□□□□ -0.04
YGL108CP53139 SCR1SCR1 522 nt14.79□□□□□ -0.04
YGL108CP53139 RTC3YHR087W 336 nt14.78□□□□□ -0.04
YGL108CP53139 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.74□□□□□ -0.05
YGL108CP53139 RRN5YLR141W 1092 nt14.43□□□□□ -0.1
YGL108CP53139 SHR5YOL110W 714 nt14.32□□□□□ -0.12
YGL108CP53139 YDJ1YNL064C 1230 nt14.28□□□□□ -0.12
YGL108CP53139 PUT4YOR348C 1884 nt14.21□□□□□ -0.13
YGL108CP53139 RSB1YOR049C 1065 nt14.2□□□□□ -0.14
YGL108CP53139 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.14□□□□□ -0.15
YGL108CP53139 GAR1YHR089C 618 nt13.92□□□□□ -0.18
YGL108CP53139 PST2YDR032C 597 nt13.87□□□□□ -0.19
YGL108CP53139 DEP1YAL013W 1218 nt13.83□□□□□ -0.2
YGL108CP53139 URN1YPR152C 1398 nt13.83□□□□□ -0.2
YGL108CP53139 ARE1YCR048W 1833 nt13.76□□□□□ -0.21
YGL108CP53139 POA1YBR022W 534 nt13.73□□□□□ -0.21
YGL108CP53139 RPN10YHR200W 807 nt13.72□□□□□ -0.21
YGL108CP53139 YNL208WYNL208W 600 nt13.67□□□□□ -0.22
YGL108CP53139 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.62□□□□□ -0.23
YGL108CP53139 SAH1YER043C 1350 nt13.59□□□□□ -0.23
YGL108CP53139 OPI9YLR338W 858 nt13.59□□□□□ -0.23
YGL108CP53139 BSC6YOL137W 1494 nt13.56□□□□□ -0.24
YGL108CP53139 YKL097CYKL097C 411 nt13.46□□□□□ -0.25
YGL108CP53139 TIR1YER011W 765 nt13.45□□□□□ -0.26
YGL108CP53139 SPT5YML010W 3192 nt13.35□□□□□ -0.27
YGL108CP53139 SHU1YHL006C 453 nt13.28□□□□□ -0.28
YGL108CP53139 BUD23YCR047C 828 nt13.26□□□□□ -0.29
YGL108CP53139 PUN1YLR414C 792 nt13.24□□□□□ -0.29
YGL108CP53139 SSA4YER103W 1929 nt13.23□□□□□ -0.29
YGL108CP53139 SSA1YAL005C 1929 nt13.22□□□□□ -0.29
YGL108CP53139 YJR018WYJR018W 363 nt13.21□□□□□ -0.29
YGL108CP53139 PTC2YER089C 1395 nt13.07□□□□□ -0.32
YGL108CP53139 RPP2BYDR382W 333 nt13.03□□□□□ -0.32
YGL108CP53139 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.01□□□□□ -0.33
YGL108CP53139 NAB2YGL122C 1578 nt12.99□□□□□ -0.33
YGL108CP53139 SRB2YHR041C 633 nt12.96□□□□□ -0.33
YGL108CP53139 YJR120WYJR120W 351 nt12.95□□□□□ -0.34
YGL108CP53139 YGR021WYGR021W 873 nt12.9□□□□□ -0.34
YGL108CP53139 WWM1YFL010C 636 nt12.86□□□□□ -0.35
YGL108CP53139 YOR139CYOR139C 393 nt12.82□□□□□ -0.36
YGL108CP53139 HOM6YJR139C 1080 nt12.8□□□□□ -0.36
YGL108CP53139 MEP2YNL142W 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
YGL108CP53139 NPL3YDR432W 1245 nt12.77□□□□□ -0.37
YGL108CP53139 BDF1YLR399C 2061 nt12.76□□□□□ -0.37
YGL108CP53139 MNP1YGL068W 585 nt12.75□□□□□ -0.37
YGL108CP53139 FIS1YIL065C 468 nt12.75□□□□□ -0.37
YGL108CP53139 BDH2YAL061W 1254 nt12.75□□□□□ -0.37
YGL108CP53139 INM2YDR287W 879 nt12.74□□□□□ -0.37
YGL108CP53139 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.71□□□□□ -0.37
YGL108CP53139 DAL1YIR027C 1383 nt12.7□□□□□ -0.38
YGL108CP53139 FPR4YLR449W 1179 nt12.68□□□□□ -0.38
YGL108CP53139 YOL037CYOL037C 354 nt12.66□□□□□ -0.38
YGL108CP53139 RKM5YLR137W 1104 nt12.63□□□□□ -0.39
YGL108CP53139 YBL100CYBL100C 315 nt12.63□□□□□ -0.39
YGL108CP53139 LSM3YLR438C-A 270 nt12.61□□□□□ -0.39
YGL108CP53139 TAT1YBR069C 1860 nt12.59□□□□□ -0.39
YGL108CP53139 PHO4YFR034C 939 nt12.59□□□□□ -0.39
YGL108CP53139 DCW1YKL046C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
YGL108CP53139 YPS1YLR120C 1710 nt12.56□□□□□ -0.4
YGL108CP53139 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.49□□□□□ -0.41
YGL108CP53139 TRM9YML014W 840 nt12.49□□□□□ -0.41
YGL108CP53139 FUN26YAL022C 1554 nt12.47□□□□□ -0.41
YGL108CP53139 EMI2YDR516C 1503 nt12.4□□□□□ -0.42
YGL108CP53139 YMR090WYMR090W 684 nt12.39□□□□□ -0.43
YGL108CP53139 YDR095CYDR095C 411 nt12.38□□□□□ -0.43
YGL108CP53139 YBR220CYBR220C 1683 nt12.37□□□□□ -0.43
YGL108CP53139 CCT6YDR188W 1641 nt12.33□□□□□ -0.43
YGL108CP53139 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.32□□□□□ -0.44
YGL108CP53139 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.32□□□□□ -0.44
YGL108CP53139 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.32□□□□□ -0.44
YGL108CP53139 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.32□□□□□ -0.44
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