Protein–RNA interactions for Protein: P38302

NTC20, Pre-mRNA-splicing factor NTC20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTC20P38302 NSR1YGR159C 1245 nt17.18■□□□□ 0.34
NTC20P38302 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.08■□□□□ 0.32
NTC20P38302 NOP1YDL014W 984 nt16.58■□□□□ 0.24
NTC20P38302 MDJ1YFL016C 1536 nt15.39■□□□□ 0.05
NTC20P38302 YKL036CYKL036C 393 nt15.06■□□□□ 0
NTC20P38302 SRX1YKL086W 384 nt14.45□□□□□ -0.1
NTC20P38302 Q0297Q0297 156 nt14.4□□□□□ -0.1
NTC20P38302 YJL027CYJL027C 417 nt14.25□□□□□ -0.13
NTC20P38302 YCR051WYCR051W 669 nt13.69□□□□□ -0.22
NTC20P38302 SCS3YGL126W 1143 nt13.56□□□□□ -0.24
NTC20P38302 DBP2YNL112W 1641 nt13.51□□□□□ -0.25
NTC20P38302 YBR190WYBR190W 312 nt13.23□□□□□ -0.29
NTC20P38302 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.16□□□□□ -0.3
NTC20P38302 CCC1YLR220W 969 nt13.04□□□□□ -0.32
NTC20P38302 YOL085CYOL085C 342 nt13.03□□□□□ -0.32
NTC20P38302 RTC3YHR087W 336 nt12.94□□□□□ -0.34
NTC20P38302 RPP1BYDL130W 321 nt12.92□□□□□ -0.34
NTC20P38302 PKP1YIL042C 1185 nt12.84□□□□□ -0.35
NTC20P38302 RVS167YDR388W 1449 nt12.76□□□□□ -0.37
NTC20P38302 SCJ1YMR214W 1134 nt12.55□□□□□ -0.4
NTC20P38302 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.39□□□□□ -0.43
NTC20P38302 PET122YER153C 765 nt12.33□□□□□ -0.44
NTC20P38302 SSA3YBL075C 1950 nt12.29□□□□□ -0.44
NTC20P38302 SHR5YOL110W 714 nt12.23□□□□□ -0.45
NTC20P38302 SCR1SCR1 522 nt12.22□□□□□ -0.45
NTC20P38302 PUT4YOR348C 1884 nt12.12□□□□□ -0.47
NTC20P38302 ATS1YAL020C 1002 nt12.08□□□□□ -0.48
NTC20P38302 Q0182Q0182 405 nt12.01□□□□□ -0.49
NTC20P38302 YDJ1YNL064C 1230 nt12.01□□□□□ -0.49
NTC20P38302 URN1YPR152C 1398 nt12.01□□□□□ -0.49
NTC20P38302 RRN5YLR141W 1092 nt11.98□□□□□ -0.49
NTC20P38302 DEP1YAL013W 1218 nt11.92□□□□□ -0.5
NTC20P38302 OPI9YLR338W 858 nt11.89□□□□□ -0.51
NTC20P38302 SAH1YER043C 1350 nt11.85□□□□□ -0.51
NTC20P38302 ARE1YCR048W 1833 nt11.83□□□□□ -0.51
NTC20P38302 RPN10YHR200W 807 nt11.83□□□□□ -0.52
NTC20P38302 GAR1YHR089C 618 nt11.76□□□□□ -0.53
NTC20P38302 YNL208WYNL208W 600 nt11.75□□□□□ -0.53
NTC20P38302 POA1YBR022W 534 nt11.75□□□□□ -0.53
NTC20P38302 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.74□□□□□ -0.53
NTC20P38302 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.7□□□□□ -0.54
NTC20P38302 RSB1YOR049C 1065 nt11.68□□□□□ -0.54
NTC20P38302 SSA1YAL005C 1929 nt11.63□□□□□ -0.55
NTC20P38302 PUN1YLR414C 792 nt11.56□□□□□ -0.56
NTC20P38302 BSC6YOL137W 1494 nt11.52□□□□□ -0.56
NTC20P38302 YJR018WYJR018W 363 nt11.46□□□□□ -0.57
NTC20P38302 BUD23YCR047C 828 nt11.44□□□□□ -0.58
NTC20P38302 PTC2YER089C 1395 nt11.42□□□□□ -0.58
NTC20P38302 TIR1YER011W 765 nt11.38□□□□□ -0.59
NTC20P38302 NAB2YGL122C 1578 nt11.33□□□□□ -0.6
NTC20P38302 MOT3YMR070W 1473 nt11.3□□□□□ -0.6
NTC20P38302 FPS1YLL043W 2010 nt11.23□□□□□ -0.61
NTC20P38302 PST2YDR032C 597 nt11.22□□□□□ -0.61
NTC20P38302 RPP2BYDR382W 333 nt11.21□□□□□ -0.61
NTC20P38302 YJR120WYJR120W 351 nt11.16□□□□□ -0.62
NTC20P38302 DAL1YIR027C 1383 nt11.14□□□□□ -0.63
NTC20P38302 INM2YDR287W 879 nt11.11□□□□□ -0.63
NTC20P38302 FPR4YLR449W 1179 nt11.1□□□□□ -0.63
NTC20P38302 FIS1YIL065C 468 nt11.09□□□□□ -0.63
NTC20P38302 SPT5YML010W 3192 nt11.06□□□□□ -0.64
NTC20P38302 PHO4YFR034C 939 nt11□□□□□ -0.65
NTC20P38302 SRB2YHR041C 633 nt10.96□□□□□ -0.65
NTC20P38302 YBL100CYBL100C 315 nt10.93□□□□□ -0.66
NTC20P38302 BDH2YAL061W 1254 nt10.91□□□□□ -0.66
NTC20P38302 YPS1YLR120C 1710 nt10.87□□□□□ -0.67
NTC20P38302 NVJ2YPR091C 2313 nt10.85□□□□□ -0.67
NTC20P38302 MEP2YNL142W 1500 nt10.84□□□□□ -0.67
NTC20P38302 WWM1YFL010C 636 nt10.82□□□□□ -0.68
NTC20P38302 SSA4YER103W 1929 nt10.8□□□□□ -0.68
NTC20P38302 SHU1YHL006C 453 nt10.8□□□□□ -0.68
NTC20P38302 FUN26YAL022C 1554 nt10.79□□□□□ -0.68
NTC20P38302 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.78□□□□□ -0.68
NTC20P38302 YDR095CYDR095C 411 nt10.77□□□□□ -0.69
NTC20P38302 TRM9YML014W 840 nt10.77□□□□□ -0.69
NTC20P38302 LSM3YLR438C-A 270 nt10.76□□□□□ -0.69
NTC20P38302 YGR021WYGR021W 873 nt10.74□□□□□ -0.69
NTC20P38302 ALF1YNL148C 765 nt10.72□□□□□ -0.69
NTC20P38302 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.69□□□□□ -0.7
NTC20P38302 YKL097CYKL097C 411 nt10.69□□□□□ -0.7
NTC20P38302 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.68□□□□□ -0.7
NTC20P38302 HOM6YJR139C 1080 nt10.65□□□□□ -0.7
NTC20P38302 CCT6YDR188W 1641 nt10.64□□□□□ -0.71
NTC20P38302 DCW1YKL046C 1350 nt10.64□□□□□ -0.71
NTC20P38302 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.61□□□□□ -0.71
NTC20P38302 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.61□□□□□ -0.71
NTC20P38302 RPP2AYOL039W 321 nt10.58□□□□□ -0.72
NTC20P38302 EMI2YDR516C 1503 nt10.54□□□□□ -0.72
NTC20P38302 YMR090WYMR090W 684 nt10.54□□□□□ -0.72
NTC20P38302 PAC11YDR488C 1602 nt10.54□□□□□ -0.72
NTC20P38302 MNP1YGL068W 585 nt10.53□□□□□ -0.72
NTC20P38302 SIS1YNL007C 1059 nt10.53□□□□□ -0.72
NTC20P38302 PTP1YDL230W 1008 nt10.51□□□□□ -0.73
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