Protein–RNA interactions for Protein: P37296

STV1, V-type proton ATPase subunit a, Golgi isoform, yeastyeast

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
STV1P37296 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.37■■□□□ 1.49
STV1P37296 NOP1YDL014W 984 nt23.81■■□□□ 1.4
STV1P37296 NSR1YGR159C 1245 nt23.66■■□□□ 1.38
STV1P37296 YKL036CYKL036C 393 nt22.58■■□□□ 1.21
STV1P37296 YJL027CYJL027C 417 nt21.19■□□□□ 0.98
STV1P37296 Q0297Q0297 156 nt21.12■□□□□ 0.97
STV1P37296 SCS3YGL126W 1143 nt20.92■□□□□ 0.94
STV1P37296 SRX1YKL086W 384 nt20.89■□□□□ 0.93
STV1P37296 MDJ1YFL016C 1536 nt20.58■□□□□ 0.89
STV1P37296 YCR051WYCR051W 669 nt19.84■□□□□ 0.77
STV1P37296 YOL085CYOL085C 342 nt19.58■□□□□ 0.72
STV1P37296 PKP1YIL042C 1185 nt19.26■□□□□ 0.67
STV1P37296 SCJ1YMR214W 1134 nt19.15■□□□□ 0.66
STV1P37296 RPP1BYDL130W 321 nt18.94■□□□□ 0.62
STV1P37296 ATS1YAL020C 1002 nt18.84■□□□□ 0.61
STV1P37296 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.6■□□□□ 0.57
STV1P37296 DBP2YNL112W 1641 nt18.49■□□□□ 0.55
STV1P37296 CCC1YLR220W 969 nt18.38■□□□□ 0.53
STV1P37296 PET122YER153C 765 nt18.1■□□□□ 0.49
STV1P37296 SCR1SCR1 522 nt17.93■□□□□ 0.46
STV1P37296 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.76■□□□□ 0.43
STV1P37296 RRN5YLR141W 1092 nt17.6■□□□□ 0.41
STV1P37296 RTC3YHR087W 336 nt17.47■□□□□ 0.39
STV1P37296 RSB1YOR049C 1065 nt17.38■□□□□ 0.37
STV1P37296 PST2YDR032C 597 nt17.37■□□□□ 0.37
STV1P37296 RVS167YDR388W 1449 nt17.33■□□□□ 0.36
STV1P37296 YBR190WYBR190W 312 nt17.3■□□□□ 0.36
STV1P37296 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.27■□□□□ 0.36
STV1P37296 YDJ1YNL064C 1230 nt17.15■□□□□ 0.34
STV1P37296 YKL097CYKL097C 411 nt16.94■□□□□ 0.3
STV1P37296 SHR5YOL110W 714 nt16.93■□□□□ 0.3
STV1P37296 GAR1YHR089C 618 nt16.69■□□□□ 0.26
STV1P37296 SHU1YHL006C 453 nt16.56■□□□□ 0.24
STV1P37296 DEP1YAL013W 1218 nt16.3■□□□□ 0.2
STV1P37296 YOR139CYOR139C 393 nt16.26■□□□□ 0.19
STV1P37296 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.12■□□□□ 0.17
STV1P37296 URN1YPR152C 1398 nt16.12■□□□□ 0.17
STV1P37296 TIR1YER011W 765 nt16.1■□□□□ 0.17
STV1P37296 YNL208WYNL208W 600 nt16.05■□□□□ 0.16
STV1P37296 RPN10YHR200W 807 nt15.91■□□□□ 0.14
STV1P37296 NPL3YDR432W 1245 nt15.88■□□□□ 0.13
STV1P37296 SSA1YAL005C 1929 nt15.86■□□□□ 0.13
STV1P37296 SRB2YHR041C 633 nt15.82■□□□□ 0.12
STV1P37296 OPI9YLR338W 858 nt15.75■□□□□ 0.11
STV1P37296 MNP1YGL068W 585 nt15.66■□□□□ 0.1
STV1P37296 HOM6YJR139C 1080 nt15.61■□□□□ 0.09
STV1P37296 SAH1YER043C 1350 nt15.54■□□□□ 0.08
STV1P37296 WWM1YFL010C 636 nt15.54■□□□□ 0.08
STV1P37296 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.54■□□□□ 0.08
STV1P37296 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.54■□□□□ 0.08
STV1P37296 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.54■□□□□ 0.08
STV1P37296 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.54■□□□□ 0.08
STV1P37296 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.54■□□□□ 0.08
STV1P37296 YGR021WYGR021W 873 nt15.54■□□□□ 0.08
STV1P37296 YOL037CYOL037C 354 nt15.53■□□□□ 0.08
STV1P37296 YJR120WYJR120W 351 nt15.43■□□□□ 0.06
STV1P37296 YJR018WYJR018W 363 nt15.38■□□□□ 0.05
STV1P37296 RKM5YLR137W 1104 nt15.36■□□□□ 0.05
STV1P37296 PUT4YOR348C 1884 nt15.35■□□□□ 0.05
STV1P37296 SSA3YBL075C 1950 nt15.29■□□□□ 0.04
STV1P37296 ARE1YCR048W 1833 nt15.27■□□□□ 0.04
STV1P37296 PUN1YLR414C 792 nt15.26■□□□□ 0.03
STV1P37296 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.22■□□□□ 0.03
STV1P37296 PUS2YGL063W 1113 nt15.18■□□□□ 0.02
STV1P37296 MOT3YMR070W 1473 nt15.18■□□□□ 0.02
STV1P37296 RPP2BYDR382W 333 nt15.16■□□□□ 0.02
STV1P37296 YLR281CYLR281C 468 nt15.15■□□□□ 0.02
STV1P37296 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.05■□□□□ -0
STV1P37296 BDH2YAL061W 1254 nt15.03■□□□□ -0
STV1P37296 PTC2YER089C 1395 nt15.02■□□□□ -0
STV1P37296 WHI5YOR083W 888 nt15.01□□□□□ -0.01
STV1P37296 BSC6YOL137W 1494 nt14.9□□□□□ -0.02
STV1P37296 LSM3YLR438C-A 270 nt14.9□□□□□ -0.02
STV1P37296 POA1YBR022W 534 nt14.89□□□□□ -0.03
STV1P37296 YPR011CYPR011C 981 nt14.89□□□□□ -0.03
STV1P37296 FMP45YDL222C 930 nt14.83□□□□□ -0.04
STV1P37296 YLR236CYLR236C 324 nt14.82□□□□□ -0.04
STV1P37296 DSK2YMR276W 1122 nt14.76□□□□□ -0.05
STV1P37296 YBL100CYBL100C 315 nt14.73□□□□□ -0.05
STV1P37296 MRPL8YJL063C 717 nt14.72□□□□□ -0.05
STV1P37296 INM2YDR287W 879 nt14.71□□□□□ -0.05
STV1P37296 NAB2YGL122C 1578 nt14.7□□□□□ -0.06
STV1P37296 BUD23YCR047C 828 nt14.69□□□□□ -0.06
STV1P37296 FIS1YIL065C 468 nt14.68□□□□□ -0.06
STV1P37296 YCH1YGR203W 447 nt14.67□□□□□ -0.06
STV1P37296 DAL1YIR027C 1383 nt14.65□□□□□ -0.06
STV1P37296 FPR4YLR449W 1179 nt14.62□□□□□ -0.07
STV1P37296 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.59□□□□□ -0.07
STV1P37296 TRM9YML014W 840 nt14.59□□□□□ -0.07
STV1P37296 FUN26YAL022C 1554 nt14.59□□□□□ -0.07
STV1P37296 IMP2'YIL154C 1041 nt14.58□□□□□ -0.08
STV1P37296 PHO4YFR034C 939 nt14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms