Protein–RNA interactions for Protein: Q12130

YLR112W, Uncharacterized protein YLR112W, yeastyeast

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR112WQ12130 NSR1YGR159C 1245 nt14.68□□□□□ -0.06
YLR112WQ12130 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.33□□□□□ -0.12
YLR112WQ12130 NOP1YDL014W 984 nt13.69□□□□□ -0.22
YLR112WQ12130 MDJ1YFL016C 1536 nt13.59□□□□□ -0.23
YLR112WQ12130 YJL027CYJL027C 417 nt12.47□□□□□ -0.41
YLR112WQ12130 YKL036CYKL036C 393 nt12.13□□□□□ -0.47
YLR112WQ12130 SRX1YKL086W 384 nt11.96□□□□□ -0.49
YLR112WQ12130 Q0297Q0297 156 nt11.81□□□□□ -0.52
YLR112WQ12130 DBP2YNL112W 1641 nt11.78□□□□□ -0.52
YLR112WQ12130 YBR190WYBR190W 312 nt11.7□□□□□ -0.54
YLR112WQ12130 SSA3YBL075C 1950 nt11.63□□□□□ -0.55
YLR112WQ12130 RTC3YHR087W 336 nt11.42□□□□□ -0.58
YLR112WQ12130 YCR051WYCR051W 669 nt11.33□□□□□ -0.6
YLR112WQ12130 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR112WQ12130 PUT4YOR348C 1884 nt11.04□□□□□ -0.64
YLR112WQ12130 CCC1YLR220W 969 nt11.03□□□□□ -0.64
YLR112WQ12130 RVS167YDR388W 1449 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR112WQ12130 SCJ1YMR214W 1134 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR112WQ12130 SCS3YGL126W 1143 nt10.78□□□□□ -0.68
YLR112WQ12130 ARE1YCR048W 1833 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR112WQ12130 POA1YBR022W 534 nt10.65□□□□□ -0.7
YLR112WQ12130 RPP1BYDL130W 321 nt10.6□□□□□ -0.71
YLR112WQ12130 Q0182Q0182 405 nt10.56□□□□□ -0.72
YLR112WQ12130 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.56□□□□□ -0.72
YLR112WQ12130 BSC6YOL137W 1494 nt10.54□□□□□ -0.72
YLR112WQ12130 YOL085CYOL085C 342 nt10.53□□□□□ -0.72
YLR112WQ12130 SAH1YER043C 1350 nt10.52□□□□□ -0.72
YLR112WQ12130 URN1YPR152C 1398 nt10.49□□□□□ -0.73
YLR112WQ12130 PKP1YIL042C 1185 nt10.46□□□□□ -0.73
YLR112WQ12130 OPI9YLR338W 858 nt10.45□□□□□ -0.74
YLR112WQ12130 SHR5YOL110W 714 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR112WQ12130 SPT5YML010W 3192 nt10.41□□□□□ -0.74
YLR112WQ12130 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.36□□□□□ -0.75
YLR112WQ12130 DEP1YAL013W 1218 nt10.35□□□□□ -0.75
YLR112WQ12130 SSA4YER103W 1929 nt10.34□□□□□ -0.75
YLR112WQ12130 BUD23YCR047C 828 nt10.27□□□□□ -0.77
YLR112WQ12130 MOT3YMR070W 1473 nt10.24□□□□□ -0.77
YLR112WQ12130 PET122YER153C 765 nt10.21□□□□□ -0.77
YLR112WQ12130 RPN10YHR200W 807 nt10.21□□□□□ -0.77
YLR112WQ12130 PUN1YLR414C 792 nt10.13□□□□□ -0.79
YLR112WQ12130 PTC2YER089C 1395 nt10.11□□□□□ -0.79
YLR112WQ12130 YNL208WYNL208W 600 nt10.1□□□□□ -0.79
YLR112WQ12130 NAB2YGL122C 1578 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR112WQ12130 YDJ1YNL064C 1230 nt10.02□□□□□ -0.81
YLR112WQ12130 BDF1YLR399C 2061 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR112WQ12130 YJR018WYJR018W 363 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR112WQ12130 MEP2YNL142W 1500 nt9.94□□□□□ -0.82
YLR112WQ12130 SCR1SCR1 522 nt9.93□□□□□ -0.82
YLR112WQ12130 GAR1YHR089C 618 nt9.89□□□□□ -0.83
YLR112WQ12130 FIS1YIL065C 468 nt9.87□□□□□ -0.83
YLR112WQ12130 RRN5YLR141W 1092 nt9.84□□□□□ -0.83
YLR112WQ12130 TAT1YBR069C 1860 nt9.84□□□□□ -0.83
YLR112WQ12130 DAL1YIR027C 1383 nt9.82□□□□□ -0.84
YLR112WQ12130 FPR4YLR449W 1179 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR112WQ12130 DCW1YKL046C 1350 nt9.78□□□□□ -0.84
YLR112WQ12130 PHO4YFR034C 939 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR112WQ12130 YJR120WYJR120W 351 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR112WQ12130 YPS1YLR120C 1710 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR112WQ12130 INM2YDR287W 879 nt9.67□□□□□ -0.86
YLR112WQ12130 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.66□□□□□ -0.86
YLR112WQ12130 YER088W-BYER088W-B 147 nt9.65□□□□□ -0.86
YLR112WQ12130 EMI2YDR516C 1503 nt9.63□□□□□ -0.87
YLR112WQ12130 YBR220CYBR220C 1683 nt9.63□□□□□ -0.87
YLR112WQ12130 PAC11YDR488C 1602 nt9.63□□□□□ -0.87
YLR112WQ12130 RPP2BYDR382W 333 nt9.62□□□□□ -0.87
YLR112WQ12130 YMR090WYMR090W 684 nt9.6□□□□□ -0.87
YLR112WQ12130 TIR1YER011W 765 nt9.59□□□□□ -0.87
YLR112WQ12130 SSA1YAL005C 1929 nt9.58□□□□□ -0.88
YLR112WQ12130 YDR095CYDR095C 411 nt9.58□□□□□ -0.88
YLR112WQ12130 YDL221WYDL221W 552 nt9.51□□□□□ -0.89
YLR112WQ12130 YBL100CYBL100C 315 nt9.51□□□□□ -0.89
YLR112WQ12130 SDH1YKL148C 1923 nt9.49□□□□□ -0.89
YLR112WQ12130 RSB1YOR049C 1065 nt9.49□□□□□ -0.89
YLR112WQ12130 ATS1YAL020C 1002 nt9.47□□□□□ -0.89
YLR112WQ12130 CAC2YML102W 1407 nt9.46□□□□□ -0.9
YLR112WQ12130 PTP1YDL230W 1008 nt9.42□□□□□ -0.9
YLR112WQ12130 PCH2YBR186W 1695 nt9.4□□□□□ -0.9
YLR112WQ12130 RPP2AYOL039W 321 nt9.4□□□□□ -0.9
YLR112WQ12130 FUN26YAL022C 1554 nt9.37□□□□□ -0.91
YLR112WQ12130 GUT2YIL155C 1950 nt9.37□□□□□ -0.91
YLR112WQ12130 SEC11YIR022W 504 nt9.36□□□□□ -0.91
YLR112WQ12130 SCC4YER147C 1875 nt9.36□□□□□ -0.91
YLR112WQ12130 ALF1YNL148C 765 nt9.35□□□□□ -0.91
YLR112WQ12130 SRB2YHR041C 633 nt9.34□□□□□ -0.91
YLR112WQ12130 BDH2YAL061W 1254 nt9.34□□□□□ -0.91
YLR112WQ12130 IRC15YPL017C 1500 nt9.31□□□□□ -0.92
YLR112WQ12130 NVJ2YPR091C 2313 nt9.27□□□□□ -0.92
YLR112WQ12130 GIS3YLR094C 1509 nt9.26□□□□□ -0.93
YLR112WQ12130 TRM9YML014W 840 nt9.25□□□□□ -0.93
YLR112WQ12130 YSC84YHR016C 1407 nt9.22□□□□□ -0.93
YLR112WQ12130 SIS1YNL007C 1059 nt9.21□□□□□ -0.94
YLR112WQ12130 FPS1YLL043W 2010 nt9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms