RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W PDS5Q04264 1277 aa6.17□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W AVT3P36062 692 aa6.16□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W MRX12P47084 519 aa6.16□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W RIA1P53893 1110 aa6.16□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W ENP1P38333 483 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W AIM44Q99299 758 aa6.16□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W KRI1P42846 591 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
YMR196WYMR196W YML133CQ03099 1374 aa6.15□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W YLL067CQ07888 1374 aa6.15□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W YLL066CQ99208 1374 aa6.15□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W NST1P53935 1240 aa6.15□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W SCT1P32784 759 aa6.13□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W FKH1P40466 484 aa6.13□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W RTG3P38165 486 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W LEU3P08638 886 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W PPH3P32345 308 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W RCM1P53972 490 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W PSK1P31374 1356 aa6.12□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W CPS1P27614 576 aa6.09□□□□□ -1.43
YMR196WYMR196W NOP2P40991 618 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W YMR196WQ04336 1088 aa6.07□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W MIF2P35201 549 aa6.07□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W TY4B-HP0C2J7 1802 aa6.06□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W TY4B-JP47024 1803 aa6.06□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W THI12P42883 340 aa6.05□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W THI5P43534 340 aa6.05□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W THI11P47183 340 aa6.05□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W THI13Q07748 340 aa6.05□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W PRS1P32895 427 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W TRK1P12685 1235 aa6.04□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
YMR196WYMR196W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W AUS1Q08409 1394 aa6.02□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W YIL177CP40434 1758 aa6.02□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W YJL225CP40889 1758 aa6.02□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W SNF2P22082 1703 aa6.01□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W PRP43P53131 767 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W TAP42Q04372 366 aa6.01□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W MNN4P36044 1178 aa6□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W PDI1P17967 522 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W SNU71P53207 620 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W HIM1Q06674 414 aa5.99□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W YRF1-2P40105 1681 aa5.97□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W TOP1P04786 769 aa5.97□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W CSE4P36012 229 aa5.97□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W KAR2P16474 682 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W GRX4P32642 244 aa5.96□□□□□ -1.45
YMR196WYMR196W RPP0P05317 312 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W RTF1P53064 558 aa5.96□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W PTP3P40048 928 aa5.95□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W YDL144CQ07589 356 aa5.95□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W APC1P53886 1748 aa5.95□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W URB1P34241 1764 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W GAS4Q08271 471 aa5.94□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W VPS27P40343 622 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W CWC22P53333 577 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W FKS3Q04952 1785 aa5.93□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W DPS1P04802 557 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W MPP10P47083 593 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W CDC45Q08032 650 aa5.92□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W SUI2P20459 304 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W YFR006WP43590 535 aa5.91□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W PRD1P25375 712 aa5.91□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W PAP2P53632 584 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W YRF1-4O13559 1382 aa5.91□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W THI22Q06490 572 aa5.91□□□□□ -1.46
YMR196WYMR196W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W SLM3Q12093 417 aa5.89□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data5.89□□□□□ -1.47not detected
YMR196WYMR196W SAP155P43612 1002 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W MDG1P53885 366 aa5.88□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W YRF1-3P0CX14 1859 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W YRF1-7P0CX15 1859 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W YRF1-6P53819 1859 aa5.87□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W RTT109Q07794 436 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W TPD3P31383 635 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W DSD1P53095 428 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W REB1P21538 810 aa5.86□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data5.85□□□□□ -1.47not detected
YMR196WYMR196W SIR4P11978 1358 aa5.84□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W RSF2P46974 1380 aa5.84□□□□□ -1.47
YMR196WYMR196W TCB1Q12466 1186 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.9 ms