Protein–RNA interactions for Protein: Q08409

AUS1, ATP-dependent permease AUS1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AUS1Q08409 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.99■■□□□ 1.91
AUS1Q08409 NSR1YGR159C 1245 nt26.34■■□□□ 1.81
AUS1Q08409 NOP1YDL014W 984 nt26.07■■□□□ 1.76
AUS1Q08409 YKL036CYKL036C 393 nt24.43■■□□□ 1.5
AUS1Q08409 MDJ1YFL016C 1536 nt23.47■■□□□ 1.35
AUS1Q08409 Q0297Q0297 156 nt22.98■■□□□ 1.27
AUS1Q08409 YJL027CYJL027C 417 nt22.89■■□□□ 1.26
AUS1Q08409 SRX1YKL086W 384 nt22.89■■□□□ 1.25
AUS1Q08409 SCS3YGL126W 1143 nt22.5■■□□□ 1.19
AUS1Q08409 YCR051WYCR051W 669 nt21.83■■□□□ 1.08
AUS1Q08409 YOL085CYOL085C 342 nt21.19■□□□□ 0.98
AUS1Q08409 PKP1YIL042C 1185 nt21■□□□□ 0.95
AUS1Q08409 DBP2YNL112W 1641 nt20.82■□□□□ 0.92
AUS1Q08409 RPP1BYDL130W 321 nt20.65■□□□□ 0.9
AUS1Q08409 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.62■□□□□ 0.89
AUS1Q08409 CCC1YLR220W 969 nt20.48■□□□□ 0.87
AUS1Q08409 ATS1YAL020C 1002 nt20.09■□□□□ 0.81
AUS1Q08409 SCJ1YMR214W 1134 nt19.95■□□□□ 0.79
AUS1Q08409 PET122YER153C 765 nt19.85■□□□□ 0.77
AUS1Q08409 YBR190WYBR190W 312 nt19.7■□□□□ 0.74
AUS1Q08409 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.58■□□□□ 0.73
AUS1Q08409 SCR1SCR1 522 nt19.51■□□□□ 0.71
AUS1Q08409 RVS167YDR388W 1449 nt19.44■□□□□ 0.7
AUS1Q08409 RTC3YHR087W 336 nt19.37■□□□□ 0.69
AUS1Q08409 RRN5YLR141W 1092 nt19.23■□□□□ 0.67
AUS1Q08409 RSB1YOR049C 1065 nt18.94■□□□□ 0.62
AUS1Q08409 SHR5YOL110W 714 nt18.88■□□□□ 0.61
AUS1Q08409 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.86■□□□□ 0.61
AUS1Q08409 YDJ1YNL064C 1230 nt18.81■□□□□ 0.6
AUS1Q08409 PST2YDR032C 597 nt18.55■□□□□ 0.56
AUS1Q08409 GAR1YHR089C 618 nt18.53■□□□□ 0.56
AUS1Q08409 DEP1YAL013W 1218 nt18.45■□□□□ 0.54
AUS1Q08409 URN1YPR152C 1398 nt18.27■□□□□ 0.52
AUS1Q08409 YKL097CYKL097C 411 nt17.98■□□□□ 0.47
AUS1Q08409 YNL208WYNL208W 600 nt17.97■□□□□ 0.47
AUS1Q08409 RPN10YHR200W 807 nt17.89■□□□□ 0.45
AUS1Q08409 OPI9YLR338W 858 nt17.86■□□□□ 0.45
AUS1Q08409 SHU1YHL006C 453 nt17.85■□□□□ 0.45
AUS1Q08409 TIR1YER011W 765 nt17.84■□□□□ 0.45
AUS1Q08409 SAH1YER043C 1350 nt17.81■□□□□ 0.44
AUS1Q08409 PUT4YOR348C 1884 nt17.8■□□□□ 0.44
AUS1Q08409 SSA1YAL005C 1929 nt17.65■□□□□ 0.42
AUS1Q08409 SRB2YHR041C 633 nt17.6■□□□□ 0.41
AUS1Q08409 ARE1YCR048W 1833 nt17.59■□□□□ 0.41
AUS1Q08409 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.59■□□□□ 0.41
AUS1Q08409 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.42■□□□□ 0.38
AUS1Q08409 YJR018WYJR018W 363 nt17.38■□□□□ 0.37
AUS1Q08409 YJR120WYJR120W 351 nt17.37■□□□□ 0.37
AUS1Q08409 YOR139CYOR139C 393 nt17.32■□□□□ 0.36
AUS1Q08409 PUN1YLR414C 792 nt17.29■□□□□ 0.36
AUS1Q08409 POA1YBR022W 534 nt17.29■□□□□ 0.36
AUS1Q08409 WWM1YFL010C 636 nt17.19■□□□□ 0.34
AUS1Q08409 MNP1YGL068W 585 nt17.19■□□□□ 0.34
AUS1Q08409 PTC2YER089C 1395 nt17.15■□□□□ 0.34
AUS1Q08409 HOM6YJR139C 1080 nt17.06■□□□□ 0.32
AUS1Q08409 BUD23YCR047C 828 nt17.02■□□□□ 0.32
AUS1Q08409 RPP2BYDR382W 333 nt17.02■□□□□ 0.31
AUS1Q08409 NPL3YDR432W 1245 nt17.01■□□□□ 0.31
AUS1Q08409 YGR021WYGR021W 873 nt16.98■□□□□ 0.31
AUS1Q08409 SSA3YBL075C 1950 nt16.9■□□□□ 0.3
AUS1Q08409 BSC6YOL137W 1494 nt16.89■□□□□ 0.29
AUS1Q08409 RKM5YLR137W 1104 nt16.81■□□□□ 0.28
AUS1Q08409 NAB2YGL122C 1578 nt16.79■□□□□ 0.28
AUS1Q08409 FIS1YIL065C 468 nt16.78■□□□□ 0.28
AUS1Q08409 BDH2YAL061W 1254 nt16.78■□□□□ 0.28
AUS1Q08409 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.76■□□□□ 0.27
AUS1Q08409 YOL037CYOL037C 354 nt16.76■□□□□ 0.27
AUS1Q08409 FPR4YLR449W 1179 nt16.75■□□□□ 0.27
AUS1Q08409 DAL1YIR027C 1383 nt16.66■□□□□ 0.26
AUS1Q08409 YBL100CYBL100C 315 nt16.65■□□□□ 0.26
AUS1Q08409 PHO4YFR034C 939 nt16.6■□□□□ 0.25
AUS1Q08409 INM2YDR287W 879 nt16.59■□□□□ 0.25
AUS1Q08409 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.53■□□□□ 0.24
AUS1Q08409 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.53■□□□□ 0.24
AUS1Q08409 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.53■□□□□ 0.24
AUS1Q08409 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.53■□□□□ 0.24
AUS1Q08409 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.53■□□□□ 0.24
AUS1Q08409 LSM3YLR438C-A 270 nt16.5■□□□□ 0.23
AUS1Q08409 FUN26YAL022C 1554 nt16.45■□□□□ 0.22
AUS1Q08409 YLR281CYLR281C 468 nt16.38■□□□□ 0.21
AUS1Q08409 PUS2YGL063W 1113 nt16.37■□□□□ 0.21
AUS1Q08409 TRM9YML014W 840 nt16.36■□□□□ 0.21
AUS1Q08409 WHI5YOR083W 888 nt16.33■□□□□ 0.2
AUS1Q08409 CCT6YDR188W 1641 nt16.22■□□□□ 0.19
AUS1Q08409 YLR236CYLR236C 324 nt16.15■□□□□ 0.18
AUS1Q08409 YPR011CYPR011C 981 nt16.14■□□□□ 0.17
AUS1Q08409 YPS1YLR120C 1710 nt16.12■□□□□ 0.17
AUS1Q08409 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.11■□□□□ 0.17
AUS1Q08409 ALF1YNL148C 765 nt16.11■□□□□ 0.17
AUS1Q08409 YDR095CYDR095C 411 nt16.08■□□□□ 0.16
AUS1Q08409 MOT3YMR070W 1473 nt16.05■□□□□ 0.16
AUS1Q08409 FMP45YDL222C 930 nt16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms