RNA–Protein interactions for RNA: YKL217W

JEN1, Transcript of Monocarboxylate/proton symporter of the plasma membrane, yeast

Gene JEN1, Length 1,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
JEN1	YKL217W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
JEN1	YKL217W	PAF1	P38351	445 aa		5.11	□□□□□ -1.59
JEN1	YKL217W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		5.1	□□□□□ -1.59
JEN1	YKL217W	TY4B-J	P47024	1803 aa		5.1	□□□□□ -1.59
JEN1	YKL217W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
JEN1	YKL217W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	RTC1	Q08281	1341 aa		5.08	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	TAF5	P38129	798 aa		5.07	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	YRF1-2	P40105	1681 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	DMA2	P53924	522 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	RCM1	P53972	490 aa		5.05	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	CPS1	P27614	576 aa		5.04	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	TAF8	Q03750	510 aa		5.04	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	YIL177C	P40434	1758 aa		5.04	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	YJL225C	P40889	1758 aa		5.04	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
JEN1	YKL217W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	PPH3	P32345	308 aa		5.01	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	UBP1	P25037	809 aa		5	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	YBL086C	P38177	466 aa		5	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.99	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	ESL2	P36168	1195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	DOT5	P40553	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	SSP1	P38871	571 aa		4.98	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	IES2	P40154	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	RIM101	P33400	625 aa		4.97	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	UGA2	P38067	497 aa		4.96	□□□□□ -1.61
JEN1	YKL217W	PSK1	P31374	1356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	SPT21	P35209	758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	NPR2	P39923	615 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YJL181W	P46987	611 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	SPE2	P21182	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	CSE4	P36012	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	ALD2	P47771	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	SLM3	Q12093	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	COB	P00163	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YKL133C	P36066	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	LAM6	Q08001	693 aa		4.92	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	APC1	P53886	1748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	GTT3	P39996	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	CTH1	P47976	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	RSF2	P46974	1380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
JEN1	YKL217W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	XKS1	P42826	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	OXP1	P28273	1286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	YKR075C	P36155	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	IOC4	Q04213	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	RLF2	Q12495	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	RIM15	P43565	1770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	EDE1	P34216	1381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	YLR271W	Q06152	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	GAS4	Q08271	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	SNF2	P22082	1703 aa		4.85	□□□□□ -1.63
JEN1	YKL217W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	RCR1	P38212	213 aa		4.82	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	EAF6	P47128	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	ALD3	P54114	506 aa		4.82	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	BDF1	P35817	686 aa		4.81	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	RTG3	P38165	486 aa		4.81	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	MEC3	Q02574	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
JEN1	YKL217W	ISW2	Q08773	1120 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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