Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

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Length 3,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.88■■□□□ 1.41
TOM1Q03280 NOP1YDL014W 984 nt23.12■■□□□ 1.29
TOM1Q03280 YKL036CYKL036C 393 nt22.51■■□□□ 1.19
TOM1Q03280 NSR1YGR159C 1245 nt22.45■■□□□ 1.18
TOM1Q03280 YJL027CYJL027C 417 nt21.29■■□□□ 1
TOM1Q03280 SCS3YGL126W 1143 nt21.2■□□□□ 0.98
TOM1Q03280 Q0297Q0297 156 nt20.69■□□□□ 0.9
TOM1Q03280 SRX1YKL086W 384 nt20.64■□□□□ 0.89
TOM1Q03280 SCJ1YMR214W 1134 nt19.62■□□□□ 0.73
TOM1Q03280 YCR051WYCR051W 669 nt19.55■□□□□ 0.72
TOM1Q03280 PKP1YIL042C 1185 nt19.42■□□□□ 0.7
TOM1Q03280 MDJ1YFL016C 1536 nt19.42■□□□□ 0.7
TOM1Q03280 YOL085CYOL085C 342 nt19.41■□□□□ 0.7
TOM1Q03280 ATS1YAL020C 1002 nt19.19■□□□□ 0.66
TOM1Q03280 RPP1BYDL130W 321 nt18.69■□□□□ 0.58
TOM1Q03280 RTC3YHR087W 336 nt18.25■□□□□ 0.51
TOM1Q03280 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.08■□□□□ 0.49
TOM1Q03280 CCC1YLR220W 969 nt17.99■□□□□ 0.47
TOM1Q03280 PET122YER153C 765 nt17.92■□□□□ 0.46
TOM1Q03280 DBP2YNL112W 1641 nt17.83■□□□□ 0.44
TOM1Q03280 SCR1SCR1 522 nt17.82■□□□□ 0.44
TOM1Q03280 PST2YDR032C 597 nt17.52■□□□□ 0.39
TOM1Q03280 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.46■□□□□ 0.39
TOM1Q03280 RSB1YOR049C 1065 nt17.43■□□□□ 0.38
TOM1Q03280 RRN5YLR141W 1092 nt17.41■□□□□ 0.38
TOM1Q03280 YKL097CYKL097C 411 nt17.28■□□□□ 0.36
TOM1Q03280 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.2■□□□□ 0.34
TOM1Q03280 SHU1YHL006C 453 nt16.68■□□□□ 0.26
TOM1Q03280 YOR139CYOR139C 393 nt16.65■□□□□ 0.26
TOM1Q03280 RVS167YDR388W 1449 nt16.51■□□□□ 0.23
TOM1Q03280 YDJ1YNL064C 1230 nt16.46■□□□□ 0.23
TOM1Q03280 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.44■□□□□ 0.22
TOM1Q03280 SHR5YOL110W 714 nt16.39■□□□□ 0.21
TOM1Q03280 GAR1YHR089C 618 nt16.33■□□□□ 0.2
TOM1Q03280 NPL3YDR432W 1245 nt16.24■□□□□ 0.19
TOM1Q03280 YBR190WYBR190W 312 nt15.96■□□□□ 0.15
TOM1Q03280 DEP1YAL013W 1218 nt15.77■□□□□ 0.12
TOM1Q03280 MOT3YMR070W 1473 nt15.74■□□□□ 0.11
TOM1Q03280 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.74■□□□□ 0.11
TOM1Q03280 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.74■□□□□ 0.11
TOM1Q03280 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.74■□□□□ 0.11
TOM1Q03280 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.74■□□□□ 0.11
TOM1Q03280 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.74■□□□□ 0.11
TOM1Q03280 MNP1YGL068W 585 nt15.72■□□□□ 0.11
TOM1Q03280 BSC6YOL137W 1494 nt15.61■□□□□ 0.09
TOM1Q03280 TIR1YER011W 765 nt15.58■□□□□ 0.08
TOM1Q03280 SSA1YAL005C 1929 nt15.55■□□□□ 0.08
TOM1Q03280 SRB2YHR041C 633 nt15.48■□□□□ 0.07
TOM1Q03280 RPN10YHR200W 807 nt15.48■□□□□ 0.07
TOM1Q03280 PUS2YGL063W 1113 nt15.46■□□□□ 0.07
TOM1Q03280 HOM6YJR139C 1080 nt15.44■□□□□ 0.06
TOM1Q03280 URN1YPR152C 1398 nt15.37■□□□□ 0.05
TOM1Q03280 SSA3YBL075C 1950 nt15.34■□□□□ 0.05
TOM1Q03280 UBX6YJL048C 1191 nt15.34■□□□□ 0.05
TOM1Q03280 YGR021WYGR021W 873 nt15.32■□□□□ 0.04
TOM1Q03280 YOL037CYOL037C 354 nt15.32■□□□□ 0.04
TOM1Q03280 YNL208WYNL208W 600 nt15.3■□□□□ 0.04
TOM1Q03280 MRPL8YJL063C 717 nt15.28■□□□□ 0.04
TOM1Q03280 WWM1YFL010C 636 nt15.25■□□□□ 0.03
TOM1Q03280 YLR281CYLR281C 468 nt15.21■□□□□ 0.03
TOM1Q03280 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.07■□□□□ 0
TOM1Q03280 YLR236CYLR236C 324 nt15.05■□□□□ -0
TOM1Q03280 YPR011CYPR011C 981 nt15.01□□□□□ -0.01
TOM1Q03280 DSK2YMR276W 1122 nt15□□□□□ -0.01
TOM1Q03280 WHI5YOR083W 888 nt14.98□□□□□ -0.01
TOM1Q03280 RKM5YLR137W 1104 nt14.91□□□□□ -0.02
TOM1Q03280 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.91□□□□□ -0.02
TOM1Q03280 YEL076CYEL076C 651 nt14.91□□□□□ -0.02
TOM1Q03280 YLR464WYLR464W 651 nt14.91□□□□□ -0.02
TOM1Q03280 FMP45YDL222C 930 nt14.9□□□□□ -0.02
TOM1Q03280 ADO1YJR105W 1023 nt14.86□□□□□ -0.03
TOM1Q03280 SBA1YKL117W 651 nt14.83□□□□□ -0.03
TOM1Q03280 YJR018WYJR018W 363 nt14.8□□□□□ -0.04
TOM1Q03280 SPP1YPL138C 1062 nt14.78□□□□□ -0.04
TOM1Q03280 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.76□□□□□ -0.05
TOM1Q03280 YDR094WYDR094W 336 nt14.75□□□□□ -0.05
TOM1Q03280 YCH1YGR203W 447 nt14.7□□□□□ -0.06
TOM1Q03280 ARE1YCR048W 1833 nt14.66□□□□□ -0.06
TOM1Q03280 OPI9YLR338W 858 nt14.66□□□□□ -0.06
TOM1Q03280 RTG1YOL067C 534 nt14.66□□□□□ -0.06
TOM1Q03280 LPX1YOR084W 1164 nt14.61□□□□□ -0.07
TOM1Q03280 RPP2BYDR382W 333 nt14.53□□□□□ -0.08
TOM1Q03280 YJR120WYJR120W 351 nt14.51□□□□□ -0.09
TOM1Q03280 BDH2YAL061W 1254 nt14.5□□□□□ -0.09
TOM1Q03280 SAH1YER043C 1350 nt14.49□□□□□ -0.09
TOM1Q03280 HUA1YGR268C 597 nt14.43□□□□□ -0.1
TOM1Q03280 ERV46YAL042W 1248 nt14.37□□□□□ -0.11
TOM1Q03280 SIS1YNL007C 1059 nt14.32□□□□□ -0.12
TOM1Q03280 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.28□□□□□ -0.12
TOM1Q03280 PUT4YOR348C 1884 nt14.27□□□□□ -0.13
TOM1Q03280 IMP2'YIL154C 1041 nt14.26□□□□□ -0.13
TOM1Q03280 LSM3YLR438C-A 270 nt14.19□□□□□ -0.14
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