RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W TAF5P38129 798 aa12.2□□□□□ -0.46
DDI1YER143W ALD4P46367 519 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
DDI1YER143W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
DDI1YER143W POL5P39985 1022 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
DDI1YER143W KRE5P22023 1365 aa12.18□□□□□ -0.46
DDI1YER143W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
DDI1YER143W CAB1Q04430 367 aa12.14□□□□□ -0.47
DDI1YER143W KIP3P53086 805 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
DDI1YER143W TAF8Q03750 510 aa12.09□□□□□ -0.47
DDI1YER143W MRX12P47084 519 aa12.07□□□□□ -0.48
DDI1YER143W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
DDI1YER143W MHP1P43638 1398 aa12.06□□□□□ -0.48
DDI1YER143W SPE2P21182 396 aa12.06□□□□□ -0.48
DDI1YER143W RIA1P53893 1110 aa12.06□□□□□ -0.48
DDI1YER143W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
DDI1YER143W TFA1P36100 482 aa11.98□□□□□ -0.49
DDI1YER143W YMR196WQ04336 1088 aa11.98□□□□□ -0.49
DDI1YER143W NAP1P25293 417 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
DDI1YER143W SCY1P53009 804 aa11.97□□□□□ -0.49
DDI1YER143W THI12P42883 340 aa11.95□□□□□ -0.5
DDI1YER143W THI5P43534 340 aa11.95□□□□□ -0.5
DDI1YER143W THI11P47183 340 aa11.95□□□□□ -0.5
DDI1YER143W THI13Q07748 340 aa11.95□□□□□ -0.5
DDI1YER143W YML133CQ03099 1374 aa11.94□□□□□ -0.5
DDI1YER143W YLL067CQ07888 1374 aa11.94□□□□□ -0.5
DDI1YER143W YLL066CQ99208 1374 aa11.94□□□□□ -0.5
DDI1YER143W BCH2P36122 765 aa11.94□□□□□ -0.5
DDI1YER143W PSK1P31374 1356 aa11.93□□□□□ -0.5
DDI1YER143W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
DDI1YER143W PPH3P32345 308 aa11.92□□□□□ -0.5
DDI1YER143W RCM1P53972 490 aa11.92□□□□□ -0.5
DDI1YER143W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
DDI1YER143W OXP1P28273 1286 aa11.9□□□□□ -0.5
DDI1YER143W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
DDI1YER143W PDS5Q04264 1277 aa11.9□□□□□ -0.5
DDI1YER143W CPS1P27614 576 aa11.89□□□□□ -0.51
DDI1YER143W SCT1P32784 759 aa11.89□□□□□ -0.51
DDI1YER143W SPT7P35177 1332 aa11.87□□□□□ -0.51
DDI1YER143W FKH1P40466 484 aa11.87□□□□□ -0.51
DDI1YER143W YFR006WP43590 535 aa11.87□□□□□ -0.51
DDI1YER143W TY4B-HP0C2J7 1802 aa11.85□□□□□ -0.51
DDI1YER143W TY4B-JP47024 1803 aa11.85□□□□□ -0.51
DDI1YER143W SLX5P32828 619 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
DDI1YER143W RTG3P38165 486 aa11.83□□□□□ -0.52
DDI1YER143W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
DDI1YER143W NST1P53935 1240 aa11.82□□□□□ -0.52
DDI1YER143W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
DDI1YER143W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
DDI1YER143W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
DDI1YER143W TGL3P40308 642 aa11.74□□□□□ -0.53
DDI1YER143W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
DDI1YER143W PTP3P40048 928 aa11.73□□□□□ -0.53
DDI1YER143W YIL177CP40434 1758 aa11.73□□□□□ -0.53
DDI1YER143W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
DDI1YER143W YJL225CP40889 1758 aa11.73□□□□□ -0.53
DDI1YER143W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
DDI1YER143W PRP43P53131 767 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
DDI1YER143W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
DDI1YER143W SIS1P25294 352 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
DDI1YER143W YRF1-2P40105 1681 aa11.7□□□□□ -0.54
DDI1YER143W AUS1Q08409 1394 aa11.69□□□□□ -0.54
DDI1YER143W LEU3P08638 886 aa11.69□□□□□ -0.54
DDI1YER143W ENP1P38333 483 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
DDI1YER143W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data11.68□□□□□ -0.54not detected
DDI1YER143W TRK1P12685 1235 aa11.66□□□□□ -0.54
DDI1YER143W TAP42Q04372 366 aa11.66□□□□□ -0.54
DDI1YER143W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDI1YER143W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDI1YER143W UBP9P39967 754 aa11.65□□□□□ -0.54
DDI1YER143W PDI1P17967 522 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
DDI1YER143W EPS1P40557 701 aa11.64□□□□□ -0.55
DDI1YER143W CSE4P36012 229 aa11.63□□□□□ -0.55
DDI1YER143W SNF2P22082 1703 aa11.63□□□□□ -0.55
DDI1YER143W BDF1P35817 686 aa11.61□□□□□ -0.55
DDI1YER143W URB1P34241 1764 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
DDI1YER143W IOC4Q04213 475 aa11.6□□□□□ -0.55
DDI1YER143W HIM1Q06674 414 aa11.6□□□□□ -0.55
DDI1YER143W FKS3Q04952 1785 aa11.59□□□□□ -0.55
DDI1YER143W GRX4P32642 244 aa11.58□□□□□ -0.56
DDI1YER143W RSM7P47150 247 aa11.58□□□□□ -0.56
DDI1YER143W RTF1P53064 558 aa11.58□□□□□ -0.56
DDI1YER143W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
DDI1YER143W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
DDI1YER143W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
DDI1YER143W APC1P53886 1748 aa11.56□□□□□ -0.56
DDI1YER143W KAR2P16474 682 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
DDI1YER143W GAS4Q08271 471 aa11.55□□□□□ -0.56
DDI1YER143W DPS1P04802 557 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
DDI1YER143W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
DDI1YER143W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
DDI1YER143W SLM3Q12093 417 aa11.52□□□□□ -0.57
DDI1YER143W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
DDI1YER143W PRS1P32895 427 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
DDI1YER143W APP1P53933 587 aa11.5□□□□□ -0.57
DDI1YER143W ENT1Q12518 454 aa11.49□□□□□ -0.57
DDI1YER143W YRF1-3P0CX14 1859 aa11.49□□□□□ -0.57
DDI1YER143W YRF1-7P0CX15 1859 aa11.49□□□□□ -0.57
DDI1YER143W YRF1-6P53819 1859 aa11.49□□□□□ -0.57
DDI1YER143W YRF1-4O13559 1382 aa11.47□□□□□ -0.57
DDI1YER143W RSF2P46974 1380 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.6 ms