RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513815.1

LINC00491-204, long intergenic non-protein coding RNA 491, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00491, Length 582 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00491-204ENST00000513815 EFCAB5A4FU69 1503 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 RICTORQ6R327 1708 aa7.93□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 TOM1O60784 492 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 KIAA0556O60303 1618 aa7.92□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 ABCA8O94911 1581 aa7.91□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
LINC00491-204ENST00000513815 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.89□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 KIF27Q86VH2 1401 aa7.89□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.89□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.89□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 POTEHQ6S545 545 aa7.88□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.88□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7.87□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 PKD2Q13563 968 aa7.87□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 PLA2R1Q13018 1463 aa7.86□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 PTPRKQ15262 1439 aa7.86□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.86□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 CPS1P31327 1500 aa7.85□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 ATP10AO60312 1499 aa7.85□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.85□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 GOLGA3Q08378 1498 aa7.84□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LINC00491-204ENST00000513815 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.83□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 C3P01024 1663 aa7.83□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 ATP10BO94823 1461 aa7.82□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 MLECQ14165 292 aa7.82□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 NPATQ14207 1427 aa7.82□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 PIP4K2BP78356 416 aa7.81□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 HECW1Q76N89 1606 aa7.81□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.81□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.8□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 AGLP35573 1532 aa7.8□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 REREQ9P2R6 1566 aa7.8□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 POTEAQ6S8J7 498 aa7.78□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 ALKQ9UM73 1620 aa7.78□□□□□ -1.16
LINC00491-204ENST00000513815 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.76□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.75□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 MROH2AA6NES4 1674 aa7.75□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.73□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.72□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.72□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.72□□□□□ -1.17
LINC00491-204ENST00000513815 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.7□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 KDM5CP41229 1560 aa7.7□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 PLCH2O75038 1416 aa7.69□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 IFFO2Q5TF58 517 aa7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.68□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 SYNMO15061 1565 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 ZMYM3Q14202 1370 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.67□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.65□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 MED14O60244 1454 aa7.65□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.65□□□□□ -1.18
LINC00491-204ENST00000513815 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.64□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.64□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 DEPDC5O75140 1603 aa7.63□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.62□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 ABCA6Q8N139 1617 aa7.61□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 ARID3CA6NKF2 412 aa7.61□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.61□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00491-204ENST00000513815 SAMD9Q5K651 1589 aa7.59□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 JCADQ9P266 1359 aa7.59□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 RXRBP28702 533 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 AFAP1Q8N556 730 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.58□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 IQGAP1P46940 1657 aa7.57□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 LRP5O75197 1615 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.2 ms