RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP2-217ENST00000510204 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SH3BP2-217ENST00000510204 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP2-217ENST00000510204 TONSLQ96HA7 1378 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2-217ENST00000510204 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-217ENST00000510204 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-217ENST00000510204 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-217ENST00000510204 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP2-217ENST00000510204 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.57■□□□□ 0.08
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SH3BP2-217ENST00000510204 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 MAP3K1Q13233 1512 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP2-217ENST00000510204 NFKBIBQ15653 356 aa15.52■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 TIAM1Q13009 1591 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.49■□□□□ 0.07
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SH3BP2-217ENST00000510204 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 MRS2Q9HD23 443 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 VGLL3A8MV65 326 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM51Q9NW97 253 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 CLCN1P35523 988 aa15.46■□□□□ 0.07
SH3BP2-217ENST00000510204 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.45■□□□□ 0.06
SH3BP2-217ENST00000510204 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP2-217ENST00000510204 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2-217ENST00000510204 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2-217ENST00000510204 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2-217ENST00000510204 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2-217ENST00000510204 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
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SH3BP2-217ENST00000510204 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 10.9
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SH3BP2-217ENST00000510204 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
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SH3BP2-217ENST00000510204 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
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SH3BP2-217ENST00000510204 NUDCQ9Y266 331 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 C14orf37Q86TY3 774 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 AKNAQ7Z591 1439 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 TPM2P07951 284 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-217ENST00000510204 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 FBLN2P98095 1184 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CCDC7Q96M83 1385 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CNPY4Q8N129 248 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 HFM1A2PYH4 1435 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 FMN1Q68DA7 1419 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 PRDM2Q13029 1718 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2-217ENST00000510204 PDE4AP27815 886 aa15.27■□□□□ 0.04
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SH3BP2-217ENST00000510204 NCOA1Q15788 1441 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 RGS22Q8NE09 1264 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PTPRKQ15262 1439 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 DMTNQ08495 405 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 BACH2Q9BYV9 841 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.23■□□□□ 0.03
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