RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504972.3

HOXB-AS1-203, HOXB cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS1, Length 680 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS1-203ENST00000504972 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS1-203ENST00000504972 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 MSH5O43196 834 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 C3P01024 1663 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 KIF27Q86VH2 1401 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ALKQ9UM73 1620 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 HECW1Q76N89 1606 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ATP10BO94823 1461 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PIP4K2BP78356 416 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXB-AS1-203ENST00000504972 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXB-AS1-203ENST00000504972 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ARID3CA6NKF2 412 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXB-AS1-203ENST00000504972 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ATP10AO60312 1499 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS1-203ENST00000504972 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS1-203ENST00000504972 POTEAQ6S8J7 498 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS1-203ENST00000504972 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXB-AS1-203ENST00000504972 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXB-AS1-203ENST00000504972 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXB-AS1-203ENST00000504972 GOLGA3Q08378 1498 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PLA2R1Q13018 1463 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS1-203ENST00000504972 TOM1O60784 492 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB-AS1-203ENST00000504972 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CPS1P31327 1500 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 REREQ9P2R6 1566 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ABCA6Q8N139 1617 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXB-AS1-203ENST00000504972 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 MROH2AA6NES4 1674 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PTPRKQ15262 1439 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 NPATQ14207 1427 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 AGLP35573 1532 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 KDM5CP41229 1560 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PKD2Q13563 968 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HOXB-AS1-203ENST00000504972 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS1-203ENST00000504972 SAMD9Q5K651 1589 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PLCH2O75038 1416 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 P3H3Q8IVL6 736 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 SYNMO15061 1565 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ZMYM3Q14202 1370 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS1-203ENST00000504972 AFAP1Q8N556 730 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS1-203ENST00000504972 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS1-203ENST00000504972 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS1-203ENST00000504972 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS1-203ENST00000504972 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS1-203ENST00000504972 IQGAP1P46940 1657 aa14.33□□□□□ -0.11
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 TRIM52Q96A61 297 aa14.32□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 DEPDC5O75140 1603 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 KIF14Q15058 1648 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 MED14O60244 1454 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.3□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 LRP6O75581 1613 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXB-AS1-203ENST00000504972 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ABCC1P33527 1531 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 EP400Q96L91 3159 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PRXQ9BXM0 1461 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PLXNC1O60486 1568 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.22□□□□□ -0.13
HOXB-AS1-203ENST00000504972 PHLPP1O60346 1717 aa14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms