RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRU-206ENST00000465525 PLCH2O75038 1416 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRU-206ENST00000465525 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRU-206ENST00000465525 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PTPRU-206ENST00000465525 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PTPRU-206ENST00000465525 MIA2Q96PC5 1412 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 TSPOAP1O95153 1857 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRU-206ENST00000465525 FANCAO15360 1455 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRU-206ENST00000465525 ITGAEP38570 1179 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRU-206ENST00000465525 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRU-206ENST00000465525 NEO1Q92859 1461 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRU-206ENST00000465525 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRU-206ENST00000465525 AKNAQ7Z591 1439 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRU-206ENST00000465525 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
PTPRU-206ENST00000465525 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRU-206ENST00000465525 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
PTPRU-206ENST00000465525 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC1P33527 1531 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRU-206ENST00000465525 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.08■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 ADGRL1O94910 1474 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 PTPRKQ15262 1439 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 DAPK1P53355 1430 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC5O15440 1437 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 MBD5Q9P267 1494 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRU-206ENST00000465525 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRU-206ENST00000465525 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26■■□□□ 1.75
PTPRU-206ENST00000465525 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PTPRU-206ENST00000465525 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRU-206ENST00000465525 RAPGEF3O95398 923 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRU-206ENST00000465525 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 AFAP1Q8N556 730 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 TSPY4P0CV99 314 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 TSPY10P0CW01 314 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 KDM6BO15054 1643 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRU-206ENST00000465525 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.89■■□□□ 1.73
PTPRU-206ENST00000465525 RICTORQ6R327 1708 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRU-206ENST00000465525 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRU-206ENST00000465525 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRU-206ENST00000465525 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRU-206ENST00000465525 KDM5CP41229 1560 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRU-206ENST00000465525 ADGRL2O95490 1459 aa25.83■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 NCOA1Q15788 1441 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 ROCK1Q13464 1354 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 ATP7AQ04656 1500 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 HFM1A2PYH4 1435 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 NAIPQ13075 1403 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 PLXNC1O60486 1568 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRU-206ENST00000465525 KIF15Q9NS87 1388 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRU-206ENST00000465525 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRU-206ENST00000465525 ABCA6Q8N139 1617 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRU-206ENST00000465525 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRU-206ENST00000465525 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRU-206ENST00000465525 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRU-206ENST00000465525 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRU-206ENST00000465525 ATP10AO60312 1499 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRU-206ENST00000465525 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRU-206ENST00000465525 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PTPRU-206ENST00000465525 A2MP01023 1474 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRU-206ENST00000465525 ERBINQ96RT1 1412 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRU-206ENST00000465525 REREQ9P2R6 1566 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM52Q96A61 297 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRU-206ENST00000465525 HRCP23327 699 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRU-206ENST00000465525 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.51■■□□□ 1.68
PTPRU-206ENST00000465525 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRU-206ENST00000465525 UNC13BO14795 1591 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-206ENST00000465525 KIF3BO15066 747 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-206ENST00000465525 AGLP35573 1532 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRU-206ENST00000465525 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
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