RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.16■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 FANCAO15360 1455 aa30.15■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.14■■■□□ 2.42
SNHG12-201ENST00000461448 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.13■■■□□ 2.41
SNHG12-201ENST00000461448 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.12■■■□□ 2.41
SNHG12-201ENST00000461448 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.12■■■□□ 2.41
SNHG12-201ENST00000461448 NEO1Q92859 1461 aa30.09■■■□□ 2.41
SNHG12-201ENST00000461448 AKNAQ7Z591 1439 aa30.08■■■□□ 2.41
SNHG12-201ENST00000461448 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.07■■■□□ 2.4
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SNHG12-201ENST00000461448 MIA2Q96PC5 1412 aa30.03■■■□□ 2.4
SNHG12-201ENST00000461448 ADGRL1O94910 1474 aa30.01■■■□□ 2.39
SNHG12-201ENST00000461448 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.01■■■□□ 2.39
SNHG12-201ENST00000461448 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.99■■■□□ 2.39
SNHG12-201ENST00000461448 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.99■■■□□ 2.39
SNHG12-201ENST00000461448 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.96■■■□□ 2.39
SNHG12-201ENST00000461448 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
SNHG12-201ENST00000461448 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.95■■■□□ 2.39
SNHG12-201ENST00000461448 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 ABCC1P33527 1531 aa29.93■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.93■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 KDM6BO15054 1643 aa29.92■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 RAPGEF3O95398 923 aa29.92■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.91■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.91■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.91■■■□□ 2.38
SNHG12-201ENST00000461448 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SNHG12-201ENST00000461448 AFAP1Q8N556 730 aa29.87■■■□□ 2.37
SNHG12-201ENST00000461448 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.86■■■□□ 2.37
SNHG12-201ENST00000461448 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.86■■■□□ 2.37
SNHG12-201ENST00000461448 MBD5Q9P267 1494 aa29.84■■■□□ 2.37
SNHG12-201ENST00000461448 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
SNHG12-201ENST00000461448 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.82■■■□□ 2.36
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.81■■■□□ 2.36
SNHG12-201ENST00000461448 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.79■■■□□ 2.36
SNHG12-201ENST00000461448 RICTORQ6R327 1708 aa29.79■■■□□ 2.36
SNHG12-201ENST00000461448 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.78■■■□□ 2.36
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.77■■■□□ 2.36
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.77■■■□□ 2.36
SNHG12-201ENST00000461448 TSPY4P0CV99 314 aa29.75■■■□□ 2.35
SNHG12-201ENST00000461448 TSPY10P0CW01 314 aa29.75■■■□□ 2.35
SNHG12-201ENST00000461448 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.351e-7■■□□□ 13.9
SNHG12-201ENST00000461448 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
SNHG12-201ENST00000461448 ITGAEP38570 1179 aa29.74■■■□□ 2.35
SNHG12-201ENST00000461448 ABCC5O15440 1437 aa29.72■■■□□ 2.35
SNHG12-201ENST00000461448 KDM5CP41229 1560 aa29.72■■■□□ 2.35
SNHG12-201ENST00000461448 DAPK1P53355 1430 aa29.72■■■□□ 2.35
SNHG12-201ENST00000461448 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
SNHG12-201ENST00000461448 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.69■■■□□ 2.34
SNHG12-201ENST00000461448 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.67■■■□□ 2.34
SNHG12-201ENST00000461448 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.67■■■□□ 2.34
SNHG12-201ENST00000461448 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.66■■■□□ 2.34
SNHG12-201ENST00000461448 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.65■■■□□ 2.34
SNHG12-201ENST00000461448 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.65■■■□□ 2.34
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
SNHG12-201ENST00000461448 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.63■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.62■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.62■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 ATP7AQ04656 1500 aa29.62■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.61■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.61■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 PTPRKQ15262 1439 aa29.6■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.59■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.59■■■□□ 2.33
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.55■■■□□ 2.32
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.54■■■□□ 2.32
SNHG12-201ENST00000461448 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.53■■■□□ 2.32
SNHG12-201ENST00000461448 ABCA6Q8N139 1617 aa29.53■■■□□ 2.32
SNHG12-201ENST00000461448 ATP10AO60312 1499 aa29.52■■■□□ 2.32
SNHG12-201ENST00000461448 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.52■■■□□ 2.32
SNHG12-201ENST00000461448 ADGRL2O95490 1459 aa29.49■■■□□ 2.31
SNHG12-201ENST00000461448 NCOA1Q15788 1441 aa29.49■■■□□ 2.31
SNHG12-201ENST00000461448 KIF15Q9NS87 1388 aa29.47■■■□□ 2.31
SNHG12-201ENST00000461448 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.47■■■□□ 2.31
SNHG12-201ENST00000461448 PLXNC1O60486 1568 aa29.47■■■□□ 2.31
SNHG12-201ENST00000461448 ROCK1Q13464 1354 aa29.46■■■□□ 2.31
SNHG12-201ENST00000461448 A2MP01023 1474 aa29.46■■■□□ 2.31
SNHG12-201ENST00000461448 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SNHG12-201ENST00000461448 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
SNHG12-201ENST00000461448 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.39■■■□□ 2.3
SNHG12-201ENST00000461448 REREQ9P2R6 1566 aa29.38■■■□□ 2.29
SNHG12-201ENST00000461448 KIF3BO15066 747 aa29.34■■■□□ 2.29
SNHG12-201ENST00000461448 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.33■■■□□ 2.29
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.32■■■□□ 2.28
SNHG12-201ENST00000461448 MLECQ14165 292 aa29.32■■■□□ 2.28
SNHG12-201ENST00000461448 ERBINQ96RT1 1412 aa29.32■■■□□ 2.28
SNHG12-201ENST00000461448 AGLP35573 1532 aa29.31■■■□□ 2.28
SNHG12-201ENST00000461448 NAIPQ13075 1403 aa29.31■■■□□ 2.28
SNHG12-201ENST00000461448 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.31■■■□□ 2.28
SNHG12-201ENST00000461448 HFM1A2PYH4 1435 aa29.3■■■□□ 2.28
SNHG12-201ENST00000461448 GGT6Q6P531 493 aa29.27■■■□□ 2.28
SNHG12-201ENST00000461448 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
SNHG12-201ENST00000461448 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.24■■■□□ 2.27
SNHG12-201ENST00000461448 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.22■■■□□ 2.27
SNHG12-201ENST00000461448 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.275e-7■■■□□ 16.9
SNHG12-201ENST00000461448 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.18■■■□□ 2.26
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