RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423421.5

CXorf40A-204, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-204ENST00000423421 PREX2Q70Z35 1606 aa31.46■■■□□ 2.63
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CXorf40A-204ENST00000423421 FANCAO15360 1455 aa31.45■■■□□ 2.63
CXorf40A-204ENST00000423421 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.45■■■□□ 2.63
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CXorf40A-204ENST00000423421 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.41■■■□□ 2.62
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CXorf40A-204ENST00000423421 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.23■■■□□ 2.59
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CXorf40A-204ENST00000423421 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.16■■■□□ 2.58
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CXorf40A-204ENST00000423421 TSPY10P0CW01 314 aa31.13■■■□□ 2.57
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CXorf40A-204ENST00000423421 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.09■■■□□ 2.57
CXorf40A-204ENST00000423421 AFAP1Q8N556 730 aa31.08■■■□□ 2.57
CXorf40A-204ENST00000423421 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.08■■■□□ 2.57
CXorf40A-204ENST00000423421 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.07■■■□□ 2.56
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CXorf40A-204ENST00000423421 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.9■■■□□ 2.54
CXorf40A-204ENST00000423421 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.9■■■□□ 2.54
CXorf40A-204ENST00000423421 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.89■■■□□ 2.54
CXorf40A-204ENST00000423421 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.88■■■□□ 2.53
CXorf40A-204ENST00000423421 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.88■■■□□ 2.53
CXorf40A-204ENST00000423421 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CXorf40A-204ENST00000423421 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CXorf40A-204ENST00000423421 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.84■■■□□ 2.53
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CXorf40A-204ENST00000423421 ATP10AO60312 1499 aa30.81■■■□□ 2.52
CXorf40A-204ENST00000423421 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.8■■■□□ 2.52
CXorf40A-204ENST00000423421 ADGRL2O95490 1459 aa30.8■■■□□ 2.52
CXorf40A-204ENST00000423421 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.8■■■□□ 2.52
CXorf40A-204ENST00000423421 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.78■■■□□ 2.52
CXorf40A-204ENST00000423421 PLXNC1O60486 1568 aa30.78■■■□□ 2.52
CXorf40A-204ENST00000423421 NCOA1Q15788 1441 aa30.78■■■□□ 2.52
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CXorf40A-204ENST00000423421 KIF15Q9NS87 1388 aa30.75■■■□□ 2.51
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CXorf40A-204ENST00000423421 NAIPQ13075 1403 aa30.57■■■□□ 2.48
CXorf40A-204ENST00000423421 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
CXorf40A-204ENST00000423421 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.54■■■□□ 2.48
CXorf40A-204ENST00000423421 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.53■■■□□ 2.48
CXorf40A-204ENST00000423421 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.52■■■□□ 2.48
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CXorf40A-204ENST00000423421 MLECQ14165 292 aa30.47■■■□□ 2.47
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