RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420515.1

FAAP20-207, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 1,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-207ENST00000420515 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.32■■■■■ 4.36
FAAP20-207ENST00000420515 FANCAO15360 1455 aa42.31■■■■■ 4.36
FAAP20-207ENST00000420515 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.26■■■■■ 4.36
FAAP20-207ENST00000420515 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.23■■■■■ 4.35
FAAP20-207ENST00000420515 NEO1Q92859 1461 aa42.23■■■■■ 4.35
FAAP20-207ENST00000420515 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.19■■■■■ 4.34
FAAP20-207ENST00000420515 AKNAQ7Z591 1439 aa42.18■■■■■ 4.34
FAAP20-207ENST00000420515 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
FAAP20-207ENST00000420515 KDM6BO15054 1643 aa42.15■■■■■ 4.34
FAAP20-207ENST00000420515 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.15■■■■■ 4.34
FAAP20-207ENST00000420515 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.15■■■■■ 4.34
FAAP20-207ENST00000420515 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
FAAP20-207ENST00000420515 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
FAAP20-207ENST00000420515 ABCC1P33527 1531 aa42.09■■■■■ 4.33
FAAP20-207ENST00000420515 ADGRL1O94910 1474 aa42.09■■■■■ 4.33
FAAP20-207ENST00000420515 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
FAAP20-207ENST00000420515 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.05■■■■■ 4.32
FAAP20-207ENST00000420515 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.04■■■■■ 4.32
FAAP20-207ENST00000420515 RICTORQ6R327 1708 aa42.03■■■■■ 4.32
FAAP20-207ENST00000420515 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.02■■■■■ 4.32
FAAP20-207ENST00000420515 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.02■■■■■ 4.32
FAAP20-207ENST00000420515 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.01■■■■■ 4.32
FAAP20-207ENST00000420515 FGD6Q6ZV73 1430 aa42■■■■■ 4.31
FAAP20-207ENST00000420515 MIA2Q96PC5 1412 aa42■■■■■ 4.31
FAAP20-207ENST00000420515 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.99■■■■■ 4.31
FAAP20-207ENST00000420515 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
FAAP20-207ENST00000420515 RAPGEF3O95398 923 aa41.95■■■■■ 4.31
FAAP20-207ENST00000420515 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.91■■■■■ 4.3
FAAP20-207ENST00000420515 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.91■■■■■ 4.3
FAAP20-207ENST00000420515 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.9■■■■■ 4.3
FAAP20-207ENST00000420515 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.89■■■■■ 4.3
FAAP20-207ENST00000420515 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.88■■■■■ 4.29
FAAP20-207ENST00000420515 MBD5Q9P267 1494 aa41.87■■■■■ 4.29
FAAP20-207ENST00000420515 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
FAAP20-207ENST00000420515 KDM5CP41229 1560 aa41.82■■■■■ 4.29
FAAP20-207ENST00000420515 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.82■■■■■ 4.28
FAAP20-207ENST00000420515 AFAP1Q8N556 730 aa41.81■■■■■ 4.28
FAAP20-207ENST00000420515 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.78■■■■■ 4.28
FAAP20-207ENST00000420515 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.78■■■■■ 4.28
FAAP20-207ENST00000420515 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
FAAP20-207ENST00000420515 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.71■■■■■ 4.27
FAAP20-207ENST00000420515 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
FAAP20-207ENST00000420515 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.71■■■■■ 4.27
FAAP20-207ENST00000420515 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.7■■■■■ 4.27
FAAP20-207ENST00000420515 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
FAAP20-207ENST00000420515 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.68■■■■■ 4.26
FAAP20-207ENST00000420515 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
FAAP20-207ENST00000420515 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.64■■■■■ 4.26
FAAP20-207ENST00000420515 ABCC5O15440 1437 aa41.63■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.63■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 DAPK1P53355 1430 aa41.61■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.61■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.61■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 ABCA6Q8N139 1617 aa41.61■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 ATP7AQ04656 1500 aa41.6■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.58■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
FAAP20-207ENST00000420515 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.56■■■■■ 4.24
FAAP20-207ENST00000420515 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.56■■■■■ 4.24
FAAP20-207ENST00000420515 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.54■■■■■ 4.24
FAAP20-207ENST00000420515 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.244e-6■■■□□ 15.7
FAAP20-207ENST00000420515 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.53■■■■■ 4.24
FAAP20-207ENST00000420515 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.52■■■■■ 4.24
FAAP20-207ENST00000420515 PTPRKQ15262 1439 aa41.51■■■■■ 4.24
FAAP20-207ENST00000420515 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.51■■■■■ 4.24
FAAP20-207ENST00000420515 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.5■■■■■ 4.23
FAAP20-207ENST00000420515 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.49■■■■■ 4.23
FAAP20-207ENST00000420515 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.46■■■■■ 4.23
FAAP20-207ENST00000420515 TSPY4P0CV99 314 aa41.46■■■■■ 4.23
FAAP20-207ENST00000420515 TSPY10P0CW01 314 aa41.46■■■■■ 4.23
FAAP20-207ENST00000420515 ITGAEP38570 1179 aa41.44■■■■■ 4.22
FAAP20-207ENST00000420515 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.41■■■■■ 4.22
FAAP20-207ENST00000420515 PLXNC1O60486 1568 aa41.41■■■■■ 4.22
FAAP20-207ENST00000420515 ATP10AO60312 1499 aa41.4■■■■■ 4.22
FAAP20-207ENST00000420515 REREQ9P2R6 1566 aa41.33■■■■■ 4.21
FAAP20-207ENST00000420515 ADGRL2O95490 1459 aa41.32■■■■■ 4.21
FAAP20-207ENST00000420515 A2MP01023 1474 aa41.29■■■■■ 4.2
FAAP20-207ENST00000420515 NCOA1Q15788 1441 aa41.27■■■■■ 4.2
FAAP20-207ENST00000420515 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.24■■■■■ 4.19
FAAP20-207ENST00000420515 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.24■■■■■ 4.19
FAAP20-207ENST00000420515 KIF15Q9NS87 1388 aa41.24■■■■■ 4.19
FAAP20-207ENST00000420515 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
FAAP20-207ENST00000420515 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.19■■■■■ 4.18
FAAP20-207ENST00000420515 ROCK1Q13464 1354 aa41.17■■■■■ 4.18
FAAP20-207ENST00000420515 AGLP35573 1532 aa41.16■■■■■ 4.18
FAAP20-207ENST00000420515 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.14■■■■■ 4.18
FAAP20-207ENST00000420515 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.18
FAAP20-207ENST00000420515 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
FAAP20-207ENST00000420515 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.09■■■■■ 4.17
FAAP20-207ENST00000420515 ERBINQ96RT1 1412 aa41.05■■■■■ 4.16
FAAP20-207ENST00000420515 MLECQ14165 292 aa41.04■■■■■ 4.16
FAAP20-207ENST00000420515 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.02■■■■■ 4.16
FAAP20-207ENST00000420515 NAIPQ13075 1403 aa41.02■■■■■ 4.16
FAAP20-207ENST00000420515 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.01■■■■■ 4.16
FAAP20-207ENST00000420515 KIF3BO15066 747 aa41■■■■■ 4.15
FAAP20-207ENST00000420515 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
FAAP20-207ENST00000420515 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.98■■■■■ 4.15
FAAP20-207ENST00000420515 HFM1A2PYH4 1435 aa40.98■■■■■ 4.15
FAAP20-207ENST00000420515 MADDQ8WXG6 1647 aa40.97■■■■■ 4.15
FAAP20-207ENST00000420515 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.96■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms