RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413574.6

CSNK1E-206, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-206ENST00000413574 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.59■■■■■ 5.21
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CSNK1E-206ENST00000413574 NEO1Q92859 1461 aa47.52■■■■■ 5.2
CSNK1E-206ENST00000413574 CFAP74Q9C0B2 1584 aa47.52■■■■■ 5.2
CSNK1E-206ENST00000413574 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa47.52■■■■■ 5.2
CSNK1E-206ENST00000413574 AKNAQ7Z591 1439 aa47.48■■■■■ 5.19
CSNK1E-206ENST00000413574 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP47.48■■■■■ 5.19
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CSNK1E-206ENST00000413574 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.18
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CSNK1E-206ENST00000413574 ADGRL1O94910 1474 aa47.37■■■■■ 5.17
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CSNK1E-206ENST00000413574 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa47.26■■■■■ 5.16
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CSNK1E-206ENST00000413574 FGD6Q6ZV73 1430 aa47.22■■■■■ 5.15
CSNK1E-206ENST00000413574 SYCP2Q9BX26 1530 aa47.22■■■■■ 5.15
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CSNK1E-206ENST00000413574 POGZQ7Z3K3 1410 aa47.15■■■■■ 5.14
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CSNK1E-206ENST00000413574 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.81■■■■■ 5.08
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CSNK1E-206ENST00000413574 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.69■■■■■ 5.07
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CSNK1E-206ENST00000413574 MAST1Q9Y2H9 1570 aa46.68■■■■■ 5.06
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CSNK1E-206ENST00000413574 SHANK2Q9UPX8 1470 aa46.64■■■■■ 5.06
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CSNK1E-206ENST00000413574 ATP10AO60312 1499 aa46.61■■■■■ 5.05
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CSNK1E-206ENST00000413574 NAIPQ13075 1403 aa46.11■■■■■ 4.97
CSNK1E-206ENST00000413574 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.11■■■■■ 4.97
CSNK1E-206ENST00000413574 GCC2Q8IWJ2 1684 aa46.1■■■■■ 4.97
CSNK1E-206ENST00000413574 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.08■■■■■ 4.97
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CSNK1E-206ENST00000413574 MADDQ8WXG6 1647 aa46.05■■■■■ 4.96
CSNK1E-206ENST00000413574 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
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