RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343017.11

SNX18-202, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

BASIC

Gene SNX18, Length 3,140 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-202ENST00000343017 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.61■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 ERCC6Q03468 1493 aa20.59■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.58■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 NEFMP07197 916 aa20.58■□□□□ 0.88
SNX18-202ENST00000343017 NUDCQ9Y266 331 aa20.58■□□□□ 0.88
SNX18-202ENST00000343017 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.58■□□□□ 0.88
SNX18-202ENST00000343017 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.56■□□□□ 0.88
SNX18-202ENST00000343017 NCOA1Q15788 1441 aa20.55■□□□□ 0.88
SNX18-202ENST00000343017 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SNX18-202ENST00000343017 FMN1Q68DA7 1419 aa20.54■□□□□ 0.88
SNX18-202ENST00000343017 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.53■□□□□ 0.88
SNX18-202ENST00000343017 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.51■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.5■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.5■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.48■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.47■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 SKAP1Q86WV1 359 aa20.46■□□□□ 0.87
SNX18-202ENST00000343017 PDE4AP27815 886 aa20.45■□□□□ 0.86
SNX18-202ENST00000343017 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.42■□□□□ 0.86
SNX18-202ENST00000343017 KDM6BO15054 1643 aa20.41■□□□□ 0.86
SNX18-202ENST00000343017 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SNX18-202ENST00000343017 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SNX18-202ENST00000343017 CUL7Q14999 1698 aa20.38■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 SLC4A3P48751 1232 aa20.38■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 TMC1Q8TDI8 760 aa20.38■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.37■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 BACH2Q9BYV9 841 aa20.37■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 USP35Q9P2H5 1018 aa20.33■□□□□ 0.85
SNX18-202ENST00000343017 GRIN2BQ13224 1484 aa20.3■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 PLIN1O60240 522 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.29■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 GSE1Q14687 1217 aa20.28■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 IFT140Q96RY7 1462 aa20.27■□□□□ 0.84
SNX18-202ENST00000343017 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.26■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 NFKBIBQ15653 356 aa20.26■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.26■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 HECW1Q76N89 1606 aa20.24■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.24■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.23■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 USP47Q96K76 1375 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-202ENST00000343017 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 MS4A1P11836 297 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 WDR62O43379 1518 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 PBRM1Q86U86 1689 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 CRBNQ96SW2 442 aa20.16■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 ADAMTS12P58397 1594 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.15■□□□□ 0.82
SNX18-202ENST00000343017 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.14■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 IQGAP2Q13576 1575 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.13■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 MIA2Q96PC5 1412 aa20.11■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.11■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 JPH4Q96JJ6 628 aa20.11■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 ARHGEF11O15085 1522 aa20.09■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.09■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.09■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 GRIN2AQ12879 1464 aa20.09■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 SAMD9Q5K651 1589 aa20.08■□□□□ 0.81
SNX18-202ENST00000343017 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.08■□□□□ 0.8
SNX18-202ENST00000343017 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.07■□□□□ 0.8
SNX18-202ENST00000343017 KIF15Q9NS87 1388 aa20.06■□□□□ 0.8
SNX18-202ENST00000343017 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SNX18-202ENST00000343017 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.03■□□□□ 0.8
SNX18-202ENST00000343017 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SNX18-202ENST00000343017 PKD2Q13563 968 aa20.03■□□□□ 0.8
SNX18-202ENST00000343017 RALBP1Q15311 655 aa20.01■□□□□ 0.79
SNX18-202ENST00000343017 DAPK1P53355 1430 aa20■□□□□ 0.79
SNX18-202ENST00000343017 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms