RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 FKBP8Q14318 412 aa26.99■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.98■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 ABCC5O15440 1437 aa26.98■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.97■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.95■■□□□ 1.91
NHLH2-201ENST00000320238 AKNAQ7Z591 1439 aa26.93■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 JPH4Q96JJ6 628 aa26.91■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.9■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.9■■□□□ 1.9
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.86■■□□□ 1.89
NHLH2-201ENST00000320238 CEP170Q5SW79 1584 aa26.85■■□□□ 1.89
NHLH2-201ENST00000320238 ROCK1Q13464 1354 aa26.84■■□□□ 1.89
NHLH2-201ENST00000320238 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
NHLH2-201ENST00000320238 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 SYNJ2O15056 1496 aa26.81■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC184Q52MB2 194 aa26.8■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.79■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.78■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NHLH2-201ENST00000320238 NEFLP07196 543 aa26.76■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 KIF14Q15058 1648 aa26.76■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.74■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.74■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 NCOA1Q15788 1441 aa26.73■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 PKD2Q13563 968 aa26.72■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.72■■□□□ 1.87
NHLH2-201ENST00000320238 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.69■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC7Q96M83 1385 aa26.69■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 PZPP20742 1482 aa26.68■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.67■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 NUP160Q12769 1436 aa26.66■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.66■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.65■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.86
NHLH2-201ENST00000320238 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.62■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 ATP10BO94823 1461 aa26.6■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.6■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 MRS2Q9HD23 443 aa26.6■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 NUP155O75694 1391 aa26.59■■□□□ 1.85
NHLH2-201ENST00000320238 TSPY4P0CV99 314 aa26.57■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 TSPY10P0CW01 314 aa26.57■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.57■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.56■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.55■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.54■■□□□ 1.84
NHLH2-201ENST00000320238 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.52■■□□□ 1.84
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NHLH2-201ENST00000320238 PTPRGP23470 1445 aa26.5■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 USP47Q96K76 1375 aa26.49■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.49■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 ABCA8O94911 1581 aa26.48■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.47■■□□□ 1.83
NHLH2-201ENST00000320238 KIF15Q9NS87 1388 aa26.45■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.44■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.43■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.42■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.42■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.41■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 MBD5Q9P267 1494 aa26.4■■□□□ 1.82
NHLH2-201ENST00000320238 RGL3Q3MIN7 710 aa26.36■■□□□ 1.81
NHLH2-201ENST00000320238 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.34■■□□□ 1.81
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NHLH2-201ENST00000320238 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.32■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.31■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.29■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.28■■□□□ 1.8
NHLH2-201ENST00000320238 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.25■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.25■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 KDM5CP41229 1560 aa26.23■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.21■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.21■■□□□ 1.79
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NHLH2-201ENST00000320238 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.21■■□□□ 1.79
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NHLH2-201ENST00000320238 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.2■■□□□ 1.79
NHLH2-201ENST00000320238 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.19■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 TMC1Q8TDI8 760 aa26.18■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.18■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.18■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.16■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.16■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.15■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.15■■□□□ 1.78
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