RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312734.8

CGREF1-202, Transcript of cell growth regulator with EF-hand domain 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene CGREF1, Length 1,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1-202ENST00000312734 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.68■■■■■ 4.26
CGREF1-202ENST00000312734 MIA2Q96PC5 1412 aa41.67■■■■■ 4.26
CGREF1-202ENST00000312734 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.67■■■■■ 4.26
CGREF1-202ENST00000312734 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
CGREF1-202ENST00000312734 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
CGREF1-202ENST00000312734 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.65■■■■■ 4.26
CGREF1-202ENST00000312734 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CGREF1-202ENST00000312734 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.59■■■■■ 4.25
CGREF1-202ENST00000312734 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.57■■■■■ 4.25
CGREF1-202ENST00000312734 FANCAO15360 1455 aa41.57■■■■■ 4.24
CGREF1-202ENST00000312734 TSPOAP1O95153 1857 aa41.57■■■■■ 4.24
CGREF1-202ENST00000312734 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
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CGREF1-202ENST00000312734 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
CGREF1-202ENST00000312734 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.49■■■■■ 4.23
CGREF1-202ENST00000312734 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
CGREF1-202ENST00000312734 ITGAEP38570 1179 aa41.45■■■■■ 4.23
CGREF1-202ENST00000312734 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
CGREF1-202ENST00000312734 AKNAQ7Z591 1439 aa41.45■■■■■ 4.23
CGREF1-202ENST00000312734 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
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CGREF1-202ENST00000312734 NEO1Q92859 1461 aa41.39■■■■■ 4.22
CGREF1-202ENST00000312734 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.39■■■■■ 4.22
CGREF1-202ENST00000312734 ADGRL1O94910 1474 aa41.37■■■■■ 4.21
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CGREF1-202ENST00000312734 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.35■■■■■ 4.21
CGREF1-202ENST00000312734 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.35■■■■■ 4.21
CGREF1-202ENST00000312734 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.35■■■■■ 4.21
CGREF1-202ENST00000312734 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.34■■■■■ 4.21
CGREF1-202ENST00000312734 ABCC1P33527 1531 aa41.34■■■■■ 4.21
CGREF1-202ENST00000312734 MBD5Q9P267 1494 aa41.31■■■■■ 4.2
CGREF1-202ENST00000312734 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.29■■■■■ 4.2
CGREF1-202ENST00000312734 ABCC5O15440 1437 aa41.26■■■■■ 4.2
CGREF1-202ENST00000312734 DAPK1P53355 1430 aa41.25■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.25■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.25■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 AFAP1Q8N556 730 aa41.25■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
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CGREF1-202ENST00000312734 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.21■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 PTPRKQ15262 1439 aa41.21■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.2■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 RAPGEF3O95398 923 aa41.2■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 TSPY4P0CV99 314 aa41.2■■■■■ 4.19
CGREF1-202ENST00000312734 TSPY10P0CW01 314 aa41.2■■■■■ 4.19
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CGREF1-202ENST00000312734 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.12■■■■■ 4.17
CGREF1-202ENST00000312734 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.09■■■■■ 4.17
CGREF1-202ENST00000312734 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
CGREF1-202ENST00000312734 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.08■■■■■ 4.17
CGREF1-202ENST00000312734 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
CGREF1-202ENST00000312734 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.07■■■■■ 4.16
CGREF1-202ENST00000312734 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.07■■■■■ 4.16
CGREF1-202ENST00000312734 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.03■■■■■ 4.16
CGREF1-202ENST00000312734 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.02■■■■■ 4.16
CGREF1-202ENST00000312734 RICTORQ6R327 1708 aa41.01■■■■■ 4.16
CGREF1-202ENST00000312734 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.98■■■■■ 4.15
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CGREF1-202ENST00000312734 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.95■■■■■ 4.15
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CGREF1-202ENST00000312734 ROCK1Q13464 1354 aa40.92■■■■■ 4.14
CGREF1-202ENST00000312734 ADGRL2O95490 1459 aa40.91■■■■■ 4.14
CGREF1-202ENST00000312734 ATP7AQ04656 1500 aa40.9■■■■■ 4.14
CGREF1-202ENST00000312734 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.9■■■■■ 4.14
CGREF1-202ENST00000312734 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.9■■■■■ 4.14
CGREF1-202ENST00000312734 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.9■■■■■ 4.14
CGREF1-202ENST00000312734 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.87■■■■■ 4.13
CGREF1-202ENST00000312734 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
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CGREF1-202ENST00000312734 KIF15Q9NS87 1388 aa40.84■■■■■ 4.13
CGREF1-202ENST00000312734 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.84■■■■■ 4.13
CGREF1-202ENST00000312734 HFM1A2PYH4 1435 aa40.82■■■■■ 4.12
CGREF1-202ENST00000312734 NAIPQ13075 1403 aa40.81■■■■■ 4.12
CGREF1-202ENST00000312734 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.79■■■■■ 4.12
CGREF1-202ENST00000312734 PLXNC1O60486 1568 aa40.78■■■■■ 4.12
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CGREF1-202ENST00000312734 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.77■■■■■ 4.12
CGREF1-202ENST00000312734 ABCA6Q8N139 1617 aa40.72■■■■■ 4.11
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CGREF1-202ENST00000312734 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.68■■■■■ 4.1
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CGREF1-202ENST00000312734 KIF3BO15066 747 aa40.54■■■■■ 4.08
CGREF1-202ENST00000312734 HRCP23327 699 aa40.5■■■■■ 4.07
CGREF1-202ENST00000312734 TRIM52Q96A61 297 aa40.5■■■■■ 4.07
CGREF1-202ENST00000312734 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.46■■■■■ 4.07
CGREF1-202ENST00000312734 REREQ9P2R6 1566 aa40.43■■■■■ 4.06
CGREF1-202ENST00000312734 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
CGREF1-202ENST00000312734 GGT6Q6P531 493 aa40.42■■■■■ 4.06
CGREF1-202ENST00000312734 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CGREF1-202ENST00000312734 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.39■■■■■ 4.06
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