RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.06■■■□□ 2.56
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.05■■■□□ 2.56
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.03■■■□□ 2.56
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FANCAO15360 1455 aa31.02■■■□□ 2.56
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.01■■■□□ 2.55
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.01■■■□□ 2.55
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.98■■■□□ 2.55
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MIA2Q96PC5 1412 aa30.96■■■□□ 2.55
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.93■■■□□ 2.54
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKNAQ7Z591 1439 aa30.93■■■□□ 2.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.92■■■□□ 2.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.91■■■□□ 2.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEO1Q92859 1461 aa30.9■■■□□ 2.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.9■■■□□ 2.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.89■■■□□ 2.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRL1O94910 1474 aa30.87■■■□□ 2.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.86■■■□□ 2.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.85■■■□□ 2.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.85■■■□□ 2.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC1P33527 1531 aa30.83■■■□□ 2.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.83■■■□□ 2.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAPGEF3O95398 923 aa30.79■■■□□ 2.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.79■■■□□ 2.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.78■■■□□ 2.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.78■■■□□ 2.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MBD5Q9P267 1494 aa30.78■■■□□ 2.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AFAP1Q8N556 730 aa30.78■■■□□ 2.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITGAEP38570 1179 aa30.77■■■□□ 2.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.71■■■□□ 2.511e-6■□□□□ 9.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.71■■■□□ 2.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC5O15440 1437 aa30.7■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DAPK1P53355 1430 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.66■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPRKQ15262 1439 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM6BO15054 1643 aa30.64■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.64■■■□□ 2.5
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RICTORQ6R327 1708 aa30.63■■■□□ 2.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSPY4P0CV99 314 aa30.62■■■□□ 2.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSPY10P0CW01 314 aa30.62■■■□□ 2.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.61■■■□□ 2.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.58■■■□□ 2.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM5CP41229 1560 aa30.58■■■□□ 2.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.54■■■□□ 2.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.52■■■□□ 2.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.51■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.5■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.5■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.5■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.49■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP7AQ04656 1500 aa30.49■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.49■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HRCP23327 699 aa30.49■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCOA1Q15788 1441 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRL2O95490 1459 aa30.42■■■□□ 2.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.42■■■□□ 2.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ROCK1Q13464 1354 aa30.4■■■□□ 2.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF15Q9NS87 1388 aa30.4■■■□□ 2.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCA6Q8N139 1617 aa30.39■■■□□ 2.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.38■■■□□ 2.45
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLXNC1O60486 1568 aa30.35■■■□□ 2.45
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP10AO60312 1499 aa30.32■■■□□ 2.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A2MP01023 1474 aa30.31■■■□□ 2.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HFM1A2PYH4 1435 aa30.3■■■□□ 2.44
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.27■■■□□ 2.44
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.26■■■□□ 2.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.24■■■□□ 2.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF3BO15066 747 aa30.21■■■□□ 2.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.2■■■□□ 2.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERBINQ96RT1 1412 aa30.19■■■□□ 2.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.18■■■□□ 2.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 REREQ9P2R6 1566 aa30.17■■■□□ 2.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MLECQ14165 292 aa30.15■■■□□ 2.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GGT6Q6P531 493 aa30.13■■■□□ 2.41
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