RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 MIA2Q96PC5 1412 aa36.72■■■■□ 3.47
SLC39A3-201ENST00000269740 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
SLC39A3-201ENST00000269740 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
SLC39A3-201ENST00000269740 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.72■■■■□ 3.47
SLC39A3-201ENST00000269740 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.71■■■■□ 3.47
SLC39A3-201ENST00000269740 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.69■■■■□ 3.46
SLC39A3-201ENST00000269740 FANCAO15360 1455 aa36.68■■■■□ 3.46
SLC39A3-201ENST00000269740 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.68■■■■□ 3.46
SLC39A3-201ENST00000269740 NEO1Q92859 1461 aa36.65■■■■□ 3.46
SLC39A3-201ENST00000269740 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.65■■■■□ 3.46
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
SLC39A3-201ENST00000269740 AKNAQ7Z591 1439 aa36.57■■■■□ 3.44
SLC39A3-201ENST00000269740 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.56■■■■□ 3.44
SLC39A3-201ENST00000269740 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.56■■■■□ 3.44
SLC39A3-201ENST00000269740 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.55■■■■□ 3.44
SLC39A3-201ENST00000269740 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
SLC39A3-201ENST00000269740 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
SLC39A3-201ENST00000269740 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.53■■■■□ 3.44
SLC39A3-201ENST00000269740 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.51■■■■□ 3.43
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
SLC39A3-201ENST00000269740 ADGRL1O94910 1474 aa36.49■■■■□ 3.43
SLC39A3-201ENST00000269740 ABCC1P33527 1531 aa36.49■■■■□ 3.43
SLC39A3-201ENST00000269740 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.47■■■■□ 3.432e-9■■■■■ 39.6
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SLC39A3-201ENST00000269740 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.41■■■■□ 3.42
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
SLC39A3-201ENST00000269740 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.4■■■■□ 3.42
SLC39A3-201ENST00000269740 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.4■■■■□ 3.42
SLC39A3-201ENST00000269740 MBD5Q9P267 1494 aa36.4■■■■□ 3.42
SLC39A3-201ENST00000269740 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.38■■■■□ 3.41
SLC39A3-201ENST00000269740 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.41
SLC39A3-201ENST00000269740 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
SLC39A3-201ENST00000269740 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.32■■■■□ 3.4
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.32■■■■□ 3.4
SLC39A3-201ENST00000269740 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
SLC39A3-201ENST00000269740 RICTORQ6R327 1708 aa36.31■■■■□ 3.4
SLC39A3-201ENST00000269740 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.3■■■■□ 3.4
SLC39A3-201ENST00000269740 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.3■■■■□ 3.4
SLC39A3-201ENST00000269740 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
SLC39A3-201ENST00000269740 KDM6BO15054 1643 aa36.28■■■■□ 3.4
SLC39A3-201ENST00000269740 DAPK1P53355 1430 aa36.26■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 RAPGEF3O95398 923 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 AFAP1Q8N556 730 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 ABCC5O15440 1437 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 KDM5CP41229 1560 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.22■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 TSPY4P0CV99 314 aa36.22■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 TSPY10P0CW01 314 aa36.22■■■■□ 3.39
SLC39A3-201ENST00000269740 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.19■■■■□ 3.38
SLC39A3-201ENST00000269740 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.18■■■■□ 3.38
SLC39A3-201ENST00000269740 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
SLC39A3-201ENST00000269740 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.16■■■■□ 3.38
SLC39A3-201ENST00000269740 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.16■■■■□ 3.38
SLC39A3-201ENST00000269740 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
SLC39A3-201ENST00000269740 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.15■■■■□ 3.38
SLC39A3-201ENST00000269740 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 ITGAEP38570 1179 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 PTPRKQ15262 1439 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 ATP7AQ04656 1500 aa36.09■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC39A3-201ENST00000269740 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.07■■■■□ 3.36
SLC39A3-201ENST00000269740 ADGRL2O95490 1459 aa36.05■■■■□ 3.36
SLC39A3-201ENST00000269740 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC39A3-201ENST00000269740 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC39A3-201ENST00000269740 ROCK1Q13464 1354 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC39A3-201ENST00000269740 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.02■■■■□ 3.36
SLC39A3-201ENST00000269740 PLXNC1O60486 1568 aa36.01■■■■□ 3.36
SLC39A3-201ENST00000269740 NCOA1Q15788 1441 aa36■■■■□ 3.35
SLC39A3-201ENST00000269740 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.95■■■■□ 3.35
SLC39A3-201ENST00000269740 ABCA6Q8N139 1617 aa35.95■■■■□ 3.35
SLC39A3-201ENST00000269740 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.94■■■■□ 3.34
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SLC39A3-201ENST00000269740 KIF15Q9NS87 1388 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC39A3-201ENST00000269740 ATP10AO60312 1499 aa35.9■■■■□ 3.34
SLC39A3-201ENST00000269740 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC39A3-201ENST00000269740 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.87■■■■□ 3.33
SLC39A3-201ENST00000269740 REREQ9P2R6 1566 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC39A3-201ENST00000269740 HFM1A2PYH4 1435 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC39A3-201ENST00000269740 A2MP01023 1474 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC39A3-201ENST00000269740 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
SLC39A3-201ENST00000269740 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC39A3-201ENST00000269740 NAIPQ13075 1403 aa35.82■■■■□ 3.32
SLC39A3-201ENST00000269740 ERBINQ96RT1 1412 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC39A3-201ENST00000269740 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.77■■■■□ 3.32
SLC39A3-201ENST00000269740 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC39A3-201ENST00000269740 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
SLC39A3-201ENST00000269740 AGLP35573 1532 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC39A3-201ENST00000269740 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC39A3-201ENST00000269740 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.71■■■■□ 3.31
SLC39A3-201ENST00000269740 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.66■■■■□ 3.3
SLC39A3-201ENST00000269740 KIF3BO15066 747 aa35.63■■■■□ 3.29
SLC39A3-201ENST00000269740 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
SLC39A3-201ENST00000269740 HRCP23327 699 aa35.61■■■■□ 3.29
SLC39A3-201ENST00000269740 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.59■■■■□ 3.29
SLC39A3-201ENST00000269740 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
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