RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.47■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 CCER2I3L3R5 266 aa22.47■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 SYNJ2O15056 1496 aa22.47■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 WDR62O43379 1518 aa22.47■■□□□ 1.19
CTCF-201ENST00000264010 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CTCF-201ENST00000264010 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.45■■□□□ 1.18
CTCF-201ENST00000264010 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CTCF-201ENST00000264010 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CTCF-201ENST00000264010 PTPRGP23470 1445 aa22.41■■□□□ 1.18
CTCF-201ENST00000264010 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTCF-201ENST00000264010 KCNH8Q96L42 1107 aa22.39■■□□□ 1.18
CTCF-201ENST00000264010 PKD2Q13563 968 aa22.38■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 DAPK1P53355 1430 aa22.38■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 ROCK1Q13464 1354 aa22.36■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.176e-7■■■□□ 15
CTCF-201ENST00000264010 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 AKNAQ7Z591 1439 aa22.35■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 KIAA0556O60303 1618 aa22.34■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 FKBP8Q14318 412 aa22.34■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.33■■□□□ 1.17
CTCF-201ENST00000264010 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.33■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 NUP155O75694 1391 aa22.32■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.31■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 DISP1Q96F81 1524 aa22.3■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 ABCC5O15440 1437 aa22.3■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.29■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.29■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 MRS2Q9HD23 443 aa22.27■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTCF-201ENST00000264010 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.25■■□□□ 1.15
CTCF-201ENST00000264010 NBR1Q14596 966 aa22.25■■□□□ 1.15
CTCF-201ENST00000264010 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.23■■□□□ 1.15
CTCF-201ENST00000264010 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.22■■□□□ 1.15
CTCF-201ENST00000264010 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.21■■□□□ 1.15
CTCF-201ENST00000264010 ARHGEF11O15085 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
CTCF-201ENST00000264010 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTCF-201ENST00000264010 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 NUP160Q12769 1436 aa22.18■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 RGL3Q3MIN7 710 aa22.17■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.16■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.16■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.15■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 KIF15Q9NS87 1388 aa22.15■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
CTCF-201ENST00000264010 NCOA1Q15788 1441 aa22.14■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.13■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.13■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.12■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 CEP170Q5SW79 1584 aa22.11■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 KIF14Q15058 1648 aa22.1■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.1■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 TMC1Q8TDI8 760 aa22.09■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 CCDC7Q96M83 1385 aa22.08■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 ATP10BO94823 1461 aa22.08■■□□□ 1.13
CTCF-201ENST00000264010 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.08■■□□□ 1.12
CTCF-201ENST00000264010 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.07■■□□□ 1.12
CTCF-201ENST00000264010 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTCF-201ENST00000264010 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTCF-201ENST00000264010 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.06■■□□□ 1.12
CTCF-201ENST00000264010 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.04■■□□□ 1.12
CTCF-201ENST00000264010 USP47Q96K76 1375 aa22.03■■□□□ 1.12
CTCF-201ENST00000264010 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTCF-201ENST00000264010 KIF7Q2M1P5 1343 aa22■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 ARHGAP5Q13017 1502 aa22■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.99■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.99■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.98■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.96■■□□□ 1.11
CTCF-201ENST00000264010 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CTCF-201ENST00000264010 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.94■■□□□ 1.1
CTCF-201ENST00000264010 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CTCF-201ENST00000264010 KDM6BO15054 1643 aa21.93■■□□□ 1.1
CTCF-201ENST00000264010 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CTCF-201ENST00000264010 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.91■■□□□ 1.1
CTCF-201ENST00000264010 ADGRL2O95490 1459 aa21.91■■□□□ 1.1
CTCF-201ENST00000264010 KANK1Q14678 1352 aa21.9■■□□□ 1.1
CTCF-201ENST00000264010 ABCA8O94911 1581 aa21.88■■□□□ 1.09
CTCF-201ENST00000264010 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CTCF-201ENST00000264010 PZPP20742 1482 aa21.88■■□□□ 1.09
CTCF-201ENST00000264010 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.88■■□□□ 1.09
CTCF-201ENST00000264010 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTCF-201ENST00000264010 TMF1P82094 1093 aa21.85■■□□□ 1.09
CTCF-201ENST00000264010 CDCA8Q53HL2 280 aa21.82■■□□□ 1.08
CTCF-201ENST00000264010 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.82■■□□□ 1.08
CTCF-201ENST00000264010 RALBP1Q15311 655 aa21.82■■□□□ 1.08
CTCF-201ENST00000264010 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTCF-201ENST00000264010 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.8■■□□□ 1.08
CTCF-201ENST00000264010 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.8■■□□□ 1.08
CTCF-201ENST00000264010 KIF3BO15066 747 aa21.79■■□□□ 1.08
CTCF-201ENST00000264010 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTCF-201ENST00000264010 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.77■■□□□ 1.08
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