RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262462.8

SLC27A6-201, Transcript of solute carrier family 27 member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC27A6, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6-201ENST00000262462 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC27A6-201ENST00000262462 NCOA1Q15788 1441 aa21.83■■□□□ 1.08
SLC27A6-201ENST00000262462 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC27A6-201ENST00000262462 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC27A6-201ENST00000262462 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC27A6-201ENST00000262462 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC27A6-201ENST00000262462 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC27A6-201ENST00000262462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC27A6-201ENST00000262462 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SLC27A6-201ENST00000262462 ARXQ96QS3 562 aa21.75■■□□□ 1.07
SLC27A6-201ENST00000262462 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
SLC27A6-201ENST00000262462 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC27A6-201ENST00000262462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SLC27A6-201ENST00000262462 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SLC27A6-201ENST00000262462 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC27A6-201ENST00000262462 NCAPD3P42695 1498 aa21.69■■□□□ 1.06
SLC27A6-201ENST00000262462 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.69■■□□□ 1.06
SLC27A6-201ENST00000262462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC27A6-201ENST00000262462 MS4A1P11836 297 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC27A6-201ENST00000262462 CRBNQ96SW2 442 aa21.65■■□□□ 1.06
SLC27A6-201ENST00000262462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.65■■□□□ 1.06
SLC27A6-201ENST00000262462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.63■■□□□ 1.05
SLC27A6-201ENST00000262462 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SLC27A6-201ENST00000262462 CFTRP13569 1480 aa21.63■■□□□ 1.05
SLC27A6-201ENST00000262462 RGS3P49796 1198 aa21.62■■□□□ 1.05
SLC27A6-201ENST00000262462 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.62■■□□□ 1.05
SLC27A6-201ENST00000262462 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.61■■□□□ 1.05
SLC27A6-201ENST00000262462 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SLC27A6-201ENST00000262462 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC27A6-201ENST00000262462 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6-201ENST00000262462 USP47Q96K76 1375 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC27A6-201ENST00000262462 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC27A6-201ENST00000262462 KDM6BO15054 1643 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC27A6-201ENST00000262462 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC27A6-201ENST00000262462 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 POGKQ9P215 609 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.46■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.45■■□□□ 1.03
SLC27A6-201ENST00000262462 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SLC27A6-201ENST00000262462 FAM161AQ3B820 660 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC27A6-201ENST00000262462 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC27A6-201ENST00000262462 KIF15Q9NS87 1388 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC27A6-201ENST00000262462 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SLC27A6-201ENST00000262462 RALBP1Q15311 655 aa21.4■■□□□ 1.02
SLC27A6-201ENST00000262462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.39■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 PDE3BQ13370 1112 aa21.39■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 PKD2Q13563 968 aa21.39■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.39■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 C8orf34Q49A92 452 aa21.38■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 NLRP13Q86W25 1043 aa21.38■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.38■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.37■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.36■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 HECW1Q76N89 1606 aa21.35■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 MIA2Q96PC5 1412 aa21.35■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.34■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SLC27A6-201ENST00000262462 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SLC27A6-201ENST00000262462 ZMYND15Q9H091 742 aa21.31■■□□□ 1
SLC27A6-201ENST00000262462 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SLC27A6-201ENST00000262462 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SLC27A6-201ENST00000262462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SLC27A6-201ENST00000262462 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.27■■□□□ 1
SLC27A6-201ENST00000262462 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.27■■□□□ 1
SLC27A6-201ENST00000262462 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 RGL3Q3MIN7 710 aa21.25■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 SEC24BO95487 1268 aa21.24■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 PANK2Q9BZ23 570 aa21.23■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 GRIN2BQ13224 1484 aa21.23■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.23■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.22■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.21■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 BECN1Q14457 450 aa21.21■□□□□ 0.99
SLC27A6-201ENST00000262462 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
SLC27A6-201ENST00000262462 HMGXB3Q12766 1538 aa21.19■□□□□ 0.98
SLC27A6-201ENST00000262462 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SLC27A6-201ENST00000262462 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.18■□□□□ 0.98
SLC27A6-201ENST00000262462 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
SLC27A6-201ENST00000262462 PANK3Q9H999 370 aa21.18■□□□□ 0.98
SLC27A6-201ENST00000262462 DAPK1P53355 1430 aa21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms