RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 CCER2I3L3R5 266 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 MRS2Q9HD23 443 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 IQGAP2Q13576 1575 aa12.06□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
GINS1-201ENST00000262460 PKD2Q13563 968 aa12.04□□□□□ -0.48
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GINS1-201ENST00000262460 RGL3Q3MIN7 710 aa12□□□□□ -0.49
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GINS1-201ENST00000262460 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.492e-7■□□□□ 10.3
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GINS1-201ENST00000262460 DISP1Q96F81 1524 aa12□□□□□ -0.49
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GINS1-201ENST00000262460 HECW1Q76N89 1606 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS1-201ENST00000262460 ARHGEF11O15085 1522 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS1-201ENST00000262460 CCDC7Q96M83 1385 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS1-201ENST00000262460 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
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GINS1-201ENST00000262460 KIAA0556O60303 1618 aa11.91□□□□□ -0.5
GINS1-201ENST00000262460 MIA2Q96PC5 1412 aa11.91□□□□□ -0.5
GINS1-201ENST00000262460 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.91□□□□□ -0.5
GINS1-201ENST00000262460 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.91□□□□□ -0.5
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GINS1-201ENST00000262460 IFT140Q96RY7 1462 aa11.9□□□□□ -0.51
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GINS1-201ENST00000262460 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.89□□□□□ -0.51
GINS1-201ENST00000262460 AKNAQ7Z591 1439 aa11.88□□□□□ -0.51
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GINS1-201ENST00000262460 CEP170Q5SW79 1584 aa11.88□□□□□ -0.51
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GINS1-201ENST00000262460 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.85□□□□□ -0.51
GINS1-201ENST00000262460 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
GINS1-201ENST00000262460 TMC1Q8TDI8 760 aa11.84□□□□□ -0.51
GINS1-201ENST00000262460 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.84□□□□□ -0.51
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GINS1-201ENST00000262460 ROCK1Q13464 1354 aa11.83□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.83□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 SKAP1Q86WV1 359 aa11.82□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 ATP10BO94823 1461 aa11.82□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.82□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.81□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 KIF15Q9NS87 1388 aa11.81□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.8□□□□□ -0.52
GINS1-201ENST00000262460 SYNJ2O15056 1496 aa11.79□□□□□ -0.52
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GINS1-201ENST00000262460 NUDCQ9Y266 331 aa11.71□□□□□ -0.53
GINS1-201ENST00000262460 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.71□□□□□ -0.54
GINS1-201ENST00000262460 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.71□□□□□ -0.54
GINS1-201ENST00000262460 PANK3Q9H999 370 aa11.71□□□□□ -0.54
GINS1-201ENST00000262460 NUP160Q12769 1436 aa11.71□□□□□ -0.54
GINS1-201ENST00000262460 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.7□□□□□ -0.54
GINS1-201ENST00000262460 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
GINS1-201ENST00000262460 MBD5Q9P267 1494 aa11.7□□□□□ -0.54
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