RNA–Protein interactions for RNA: YOR054C

VHS3, Transcript of Negative regulatory subunit of protein phosphatase 1 Ppz1p, yeast

Gene VHS3, Length 2,025 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS3	YOR054C	ARP10	Q04549	284 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SPO77	Q06134	477 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MHR1	Q06630	226 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	TCO89	Q08921	799 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MDM32	Q12171	622 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RIF1	P29539	1916 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CIT1	P00890	479 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ABF1	P14164	731 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	HNM1	P19807	563 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RIT1	P23796	513 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GIT1	P25346	518 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	HYM1	P32464	399 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RTG1	P32607	177 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	UGA4	P32837	571 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	IXR1	P33417	597 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RIM2	P38127	377 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CST26	P38226	397 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	STB5	P38699	743 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	LNP1	P38878	278 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SHU2	P38957	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	DUN1	P39009	513 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	DSS1	P39112	969 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SSO2	P39926	295 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YEL020C	P39994	560 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	NDE1	P40215	560 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PEP8	P40335	379 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SAE2	P46946	345 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YJL016W	P47072	561 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	AIM24	P47127	394 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	NIT3	P49954	291 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SLD3	P53135	668 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YGR067C	P53243	804 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ARL3	Q02804	198 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	BSC2	Q05611	235 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ULA1	Q12059	462 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	LAG2	Q92325	660 aa		4.04	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RAD10	P06838	210 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SNF3	P10870	884 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	WHI2	P12611	486 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MRPL8	P22353	238 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	VAC17	P25591	423 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RAD27	P26793	382 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	UBC8	P28263	218 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PPG1	P32838	368 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RGT1	P32862	1170 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SRB2	P34162	210 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SPT10	P35208	640 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GPX2	P38143	162 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YBR259W	P38338	688 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MSR1	P38714	643 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GIP4	P39732	760 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YEL076C	P39971	216 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YIL054W	P40524	105 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	AGE2	P40529	298 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	HXT9	P40885	567 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RET3	P53600	189 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CPR8	P53728	308 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CBK1	P53894	756 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	NHP10	Q03435	203 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SNX41	Q04053	625 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	BUR2	Q05949	395 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GMC2	Q06201	188 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MLH3	Q12083	715 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RPN6	Q12377	434 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MYO1	P08964	1928 aa		4.03	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CYB2	P00175	591 aa		4.02	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ARG81	P05085	880 aa		4.02	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	MSS18	P08593	268 aa		4.02	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	ENA1	P13587	1091 aa		4.02	□□□□□ -1.77
VHS3	YOR054C	UGA1	P17649	471 aa		4.02	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.6 ms