Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 NSR1YGR159C 1245 nt19.5■□□□□ 0.71
RPN6Q12377 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.36■□□□□ 0.69
RPN6Q12377 NOP1YDL014W 984 nt18.73■□□□□ 0.59
RPN6Q12377 MDJ1YFL016C 1536 nt17.55■□□□□ 0.4
RPN6Q12377 YKL036CYKL036C 393 nt17.01■□□□□ 0.31
RPN6Q12377 SRX1YKL086W 384 nt16.36■□□□□ 0.21
RPN6Q12377 Q0297Q0297 156 nt16.31■□□□□ 0.2
RPN6Q12377 YJL027CYJL027C 417 nt16.19■□□□□ 0.18
RPN6Q12377 YCR051WYCR051W 669 nt15.47■□□□□ 0.07
RPN6Q12377 DBP2YNL112W 1641 nt15.43■□□□□ 0.06
RPN6Q12377 SCS3YGL126W 1143 nt15.33■□□□□ 0.04
RPN6Q12377 YBR190WYBR190W 312 nt15.06■□□□□ 0
RPN6Q12377 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.96□□□□□ -0.01
RPN6Q12377 CCC1YLR220W 969 nt14.77□□□□□ -0.05
RPN6Q12377 YOL085CYOL085C 342 nt14.74□□□□□ -0.05
RPN6Q12377 RTC3YHR087W 336 nt14.69□□□□□ -0.06
RPN6Q12377 RPP1BYDL130W 321 nt14.63□□□□□ -0.07
RPN6Q12377 PKP1YIL042C 1185 nt14.52□□□□□ -0.09
RPN6Q12377 RVS167YDR388W 1449 nt14.46□□□□□ -0.09
RPN6Q12377 SCJ1YMR214W 1134 nt14.31□□□□□ -0.12
RPN6Q12377 SSA3YBL075C 1950 nt14.12□□□□□ -0.15
RPN6Q12377 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.05□□□□□ -0.16
RPN6Q12377 PET122YER153C 765 nt13.99□□□□□ -0.17
RPN6Q12377 PUT4YOR348C 1884 nt13.89□□□□□ -0.19
RPN6Q12377 SHR5YOL110W 714 nt13.89□□□□□ -0.19
RPN6Q12377 SCR1SCR1 522 nt13.78□□□□□ -0.2
RPN6Q12377 URN1YPR152C 1398 nt13.65□□□□□ -0.22
RPN6Q12377 ATS1YAL020C 1002 nt13.64□□□□□ -0.23
RPN6Q12377 YDJ1YNL064C 1230 nt13.61□□□□□ -0.23
RPN6Q12377 RRN5YLR141W 1092 nt13.56□□□□□ -0.24
RPN6Q12377 DEP1YAL013W 1218 nt13.55□□□□□ -0.24
RPN6Q12377 ARE1YCR048W 1833 nt13.55□□□□□ -0.24
RPN6Q12377 OPI9YLR338W 858 nt13.53□□□□□ -0.24
RPN6Q12377 SAH1YER043C 1350 nt13.49□□□□□ -0.25
RPN6Q12377 RPN10YHR200W 807 nt13.42□□□□□ -0.26
RPN6Q12377 POA1YBR022W 534 nt13.4□□□□□ -0.26
RPN6Q12377 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.37□□□□□ -0.27
RPN6Q12377 YNL208WYNL208W 600 nt13.34□□□□□ -0.27
RPN6Q12377 GAR1YHR089C 618 nt13.32□□□□□ -0.28
RPN6Q12377 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.3□□□□□ -0.28
RPN6Q12377 RSB1YOR049C 1065 nt13.19□□□□□ -0.3
RPN6Q12377 BSC6YOL137W 1494 nt13.18□□□□□ -0.3
RPN6Q12377 PUN1YLR414C 792 nt13.14□□□□□ -0.31
RPN6Q12377 BUD23YCR047C 828 nt13.02□□□□□ -0.33
RPN6Q12377 YJR018WYJR018W 363 nt13.01□□□□□ -0.33
RPN6Q12377 PTC2YER089C 1395 nt13.01□□□□□ -0.33
RPN6Q12377 TIR1YER011W 765 nt12.9□□□□□ -0.34
RPN6Q12377 NAB2YGL122C 1578 nt12.89□□□□□ -0.35
RPN6Q12377 SSA1YAL005C 1929 nt12.8□□□□□ -0.36
RPN6Q12377 SPT5YML010W 3192 nt12.79□□□□□ -0.36
RPN6Q12377 YJR120WYJR120W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
RPN6Q12377 FIS1YIL065C 468 nt12.69□□□□□ -0.38
RPN6Q12377 PST2YDR032C 597 nt12.68□□□□□ -0.38
RPN6Q12377 RPP2BYDR382W 333 nt12.68□□□□□ -0.38
RPN6Q12377 DAL1YIR027C 1383 nt12.68□□□□□ -0.38
RPN6Q12377 INM2YDR287W 879 nt12.6□□□□□ -0.39
RPN6Q12377 FPR4YLR449W 1179 nt12.6□□□□□ -0.39
RPN6Q12377 PHO4YFR034C 939 nt12.55□□□□□ -0.4
RPN6Q12377 SRB2YHR041C 633 nt12.52□□□□□ -0.41
RPN6Q12377 SSA4YER103W 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
RPN6Q12377 YBL100CYBL100C 315 nt12.43□□□□□ -0.42
RPN6Q12377 MEP2YNL142W 1500 nt12.41□□□□□ -0.42
RPN6Q12377 YPS1YLR120C 1710 nt12.4□□□□□ -0.42
RPN6Q12377 BDH2YAL061W 1254 nt12.39□□□□□ -0.43
RPN6Q12377 YDR095CYDR095C 411 nt12.29□□□□□ -0.44
RPN6Q12377 FUN26YAL022C 1554 nt12.27□□□□□ -0.44
RPN6Q12377 WWM1YFL010C 636 nt12.27□□□□□ -0.45
RPN6Q12377 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.27□□□□□ -0.45
RPN6Q12377 SHU1YHL006C 453 nt12.22□□□□□ -0.45
RPN6Q12377 DCW1YKL046C 1350 nt12.19□□□□□ -0.46
RPN6Q12377 LSM3YLR438C-A 270 nt12.19□□□□□ -0.46
RPN6Q12377 TRM9YML014W 840 nt12.19□□□□□ -0.46
RPN6Q12377 YGR021WYGR021W 873 nt12.15□□□□□ -0.46
RPN6Q12377 ALF1YNL148C 765 nt12.14□□□□□ -0.47
RPN6Q12377 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.11□□□□□ -0.47
RPN6Q12377 CCT6YDR188W 1641 nt12.1□□□□□ -0.47
RPN6Q12377 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.09□□□□□ -0.47
RPN6Q12377 BDF1YLR399C 2061 nt12.09□□□□□ -0.47
RPN6Q12377 HOM6YJR139C 1080 nt12.08□□□□□ -0.48
RPN6Q12377 RPP2AYOL039W 321 nt12.05□□□□□ -0.48
RPN6Q12377 EMI2YDR516C 1503 nt12.05□□□□□ -0.48
RPN6Q12377 PTP1YDL230W 1008 nt12.03□□□□□ -0.48
RPN6Q12377 YKL097CYKL097C 411 nt12.03□□□□□ -0.48
RPN6Q12377 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.02□□□□□ -0.49
RPN6Q12377 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.02□□□□□ -0.49
RPN6Q12377 YMR090WYMR090W 684 nt11.99□□□□□ -0.49
RPN6Q12377 SIS1YNL007C 1059 nt11.98□□□□□ -0.49
RPN6Q12377 CAC2YML102W 1407 nt11.96□□□□□ -0.49
RPN6Q12377 MNP1YGL068W 585 nt11.96□□□□□ -0.49
RPN6Q12377 YDL221WYDL221W 552 nt11.95□□□□□ -0.5
RPN6Q12377 TAT1YBR069C 1860 nt11.91□□□□□ -0.5
RPN6Q12377 YBR220CYBR220C 1683 nt11.91□□□□□ -0.5
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